28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1746 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1746  hypothetical protein  100 
 
 
337 aa  682    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.470795  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5341  hypothetical protein  49.67 
 
 
350 aa  306  2.0000000000000002e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5947  hypothetical protein  43.57 
 
 
341 aa  293  4e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125312  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3104  beta-lactamase  29.17 
 
 
292 aa  69.7  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0156614  normal  0.401813 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4223  beta-lactamase  26.51 
 
 
508 aa  63.2  0.000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3212  beta-lactamase  25.37 
 
 
304 aa  61.2  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.184009 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6176  beta-lactamase  26.75 
 
 
286 aa  60.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0566092 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1408  penicillin-binding protein, transpeptidase  27.2 
 
 
504 aa  60.5  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1435  Beta-lactamase  29.41 
 
 
288 aa  57  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1388  putative beta-lactamase  26.67 
 
 
259 aa  55.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1202  beta-lactamase, putative  26.67 
 
 
259 aa  55.5  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4774  beta-lactamase  24.39 
 
 
442 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167145 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0602  beta-lactamase  25.43 
 
 
274 aa  53.1  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0351  beta-lactamase  24.67 
 
 
296 aa  49.7  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.154712 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1712  beta-lactamase  23.79 
 
 
576 aa  48.9  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2328  Beta-lactamase  24.26 
 
 
296 aa  47.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1603  beta-lactamase  26.28 
 
 
375 aa  48.1  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.955317  normal  0.378927 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0446  Beta-lactamase  24.43 
 
 
297 aa  47.8  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1529  Beta-lactamase  24.36 
 
 
296 aa  47.4  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3876  beta-lactamase  26.53 
 
 
468 aa  47.4  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2257  hypothetical protein  29.2 
 
 
434 aa  46.6  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1607  Beta-lactamase  24.77 
 
 
291 aa  46.2  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2820  Beta-lactamase  25.11 
 
 
289 aa  45.8  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.893397  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0088  Beta-lactamase  22.22 
 
 
291 aa  45.1  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.748085 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4574  Beta-lactamase  24.05 
 
 
303 aa  44.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174875  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2552  Beta-lactamase  26.04 
 
 
300 aa  45.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0802917  normal  0.0118018 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1435  Beta-lactamase  25.83 
 
 
295 aa  44.3  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5194  beta-lactamase  20.45 
 
 
323 aa  42.7  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>