140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0602 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0602  beta-lactamase  100 
 
 		 274 aa  560  1e-158  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2815  beta-lactamase  38.35 
 
 		 296 aa  168  8e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  32.4 
 
 		 803 aa  141  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5194  beta-lactamase  34.01 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4151  beta-lactamase  32.05 
 
 		 300 aa  122  9e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.433565 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3104  beta-lactamase  32.06 
 
 		 292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0156614  normal  0.401813 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6176  beta-lactamase  32.3 
 
 		 286 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0566092 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1712  beta-lactamase  30.61 
 
 		 576 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1388  putative beta-lactamase  31.84 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1202  beta-lactamase, putative  31.84 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2092  penicillin-binding protein, transpeptidase  27.93 
 
 		 424 aa  106  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00783255  hitchhiker  0.00000266476 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0316  beta-lactamase  32.13 
 
 		 315 aa  103  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00360568 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3212  beta-lactamase  31.58 
 
 		 304 aa  103  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.184009 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1408  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.21 
 
 		 504 aa  102  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2043  beta-lactamase  26.52 
 
 		 271 aa  102  6e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0136357  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3876  beta-lactamase  27.84 
 
 		 468 aa  101  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4774  beta-lactamase  26.91 
 
 		 442 aa  99.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167145 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4223  beta-lactamase  28.4 
 
 		 508 aa  98.2  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0491  putative beta-lactamase protein  26.19 
 
 		 440 aa  96.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1603  beta-lactamase  27.68 
 
 		 375 aa  94.4  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.955317  normal  0.378927 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4436  beta-lactamase class A-like protein  31.66 
 
 		 293 aa  85.1  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101027  normal  0.450402 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1608  beta-lactamase  26.46 
 
 		 425 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1147  putative beta-lactamase  26.51 
 
 		 423 aa  82.8  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1634  beta-lactamase  26.01 
 
 		 425 aa  82.8  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.54925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2055  peptidoglycan-binding LysM  30.29 
 
 		 333 aa  82.8  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000227262  normal  0.0328069 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0280  Beta-lactamase  27.56 
 
 		 353 aa  82.4  0.000000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2437  putative beta-lactamase precursor protein  26.25 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1443  beta-lactamase  26.32 
 
 		 283 aa  79.7  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69594  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6642  putative beta-lactamase precursor protein  27.69 
 
 		 287 aa  76.6  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1169  Beta-lactamase class A-like protein  27.52 
 
 		 383 aa  75.5  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4021  Beta-lactamase  28.8 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0799644 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0697  putative beta-lactamase  29.47 
 
 		 357 aa  72.8  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1446  beta-lactamase related protein  23.64 
 
 		 320 aa  72.4  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15311  putative beta-lactamase  28.99 
 
 		 357 aa  72  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.709796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2352  Beta-lactamase  28.45 
 
 		 297 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445844 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0715  beta-lactamase family protein  26.55 
 
 		 388 aa  70.5  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5713  beta-lactamase  24.31 
 
 		 292 aa  70.1  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2552  Beta-lactamase  29.96 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0802917  normal  0.0118018 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  24.89 
 
 		 422 aa  69.3  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1950  beta-lactamase family protein  24.45 
 
 		 381 aa  64.7  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2257  hypothetical protein  34.84 
 
 		 434 aa  64.7  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0088  Beta-lactamase  29.22 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.748085 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2085  Beta-lactamase  26.38 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11921 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3334  Beta-lactamase  25.08 
 
 		 349 aa  63.2  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0182  beta-lactamase  31.62 
 
 		 327 aa  62.8  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.689531 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4439  putative Beta-lactamase  28.81 
 
 		 288 aa  62.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0228  twin-arginine translocation pathway signal  29 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1607  Beta-lactamase  25.56 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2102  twin-arginine translocation pathway signal  26.14 
 
 		 296 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0733882  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2148  Beta-lactamase  26.14 
 
 		 296 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.748404  normal  0.133415 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2328  Beta-lactamase  28.69 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11351  Beta-lactamase class A  22.57 
 
 		 356 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.470021  normal  0.82694 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0725  Beta-lactamase class A-like protein  25.75 
 
 		 370 aa  60.8  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.725916  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1080  Beta-lactamase  28.4 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0392714  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5574  Beta-lactamase class A-like protein  27.44 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1529  Beta-lactamase  28.69 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2580  Beta-lactamase  27.73 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000559373  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2386  beta-lactamase  23.17 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0183  beta-lactamase  34.48 
 
 		 436 aa  58.9  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975829 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2728  Beta-lactamase  30.77 
 
 		 299 aa  58.9  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0079236  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4752  putative lipoprotein LpqF  28.1 
 
 		 443 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.164946  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4838  putative lipoprotein LpqF  28.1 
 
 		 443 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5138  putative lipoprotein LpqF  28.1 
 
 		 443 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0594  Beta-lactamase  27.23 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.272363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0997  Beta-lactamase  26.52 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.940845 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1435  Beta-lactamase  21.77 
 
 		 295 aa  57  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0366  Beta-lactamase  28.38 
 
 		 291 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0385843  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1856  Beta-lactamase class A  29.63 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000412045 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5353  beta-lactamase  29.29 
 
 		 454 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4009  Beta-lactamase  28.69 
 
 		 315 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0446  Beta-lactamase  27.53 
 
 		 297 aa  54.3  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1434  beta-lactamase  24.29 
 
 		 452 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.685838 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03960  hypothetical protein  29.79 
 
 		 453 aa  54.3  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0388079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4574  Beta-lactamase  28.49 
 
 		 303 aa  54.3  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174875  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3972  beta-lactamase  29.81 
 
 		 305 aa  54.3  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0506092  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0855  Beta-lactamase  25.64 
 
 		 296 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689397  normal  0.580537 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13626  lipoprotein lpqF  34.34 
 
 		 452 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.7641599999999997e-27  normal  0.0255048 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2820  Beta-lactamase  27.91 
 
 		 289 aa  53.5  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.893397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1458  beta-lactamase  23.48 
 
 		 306 aa  53.1  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.755992  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1746  hypothetical protein  25.43 
 
 		 337 aa  53.1  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.470795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0351  beta-lactamase  26.52 
 
 		 296 aa  52.8  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.154712 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08971  putative beta-lactamase  23.58 
 
 		 386 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.712716 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1419  beta-lactamase  23.19 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.533278  hitchhiker  0.0000178355 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2215  beta-lactamase  26.53 
 
 		 290 aa  51.2  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.296886  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1390  Beta-lactamase  26.45 
 
 		 289 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0585114  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0183  Beta-lactamase  22.18 
 
 		 306 aa  50.1  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.51311 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33460  hypothetical protein  29.35 
 
 		 424 aa  49.7  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3231  Beta-lactamase  26.69 
 
 		 299 aa  49.7  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0978  Beta-lactamase  24.89 
 
 		 304 aa  48.9  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.518614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2229  Beta-lactamase  25.98 
 
 		 281 aa  48.9  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0753416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1435  Beta-lactamase  25.93 
 
 		 288 aa  48.9  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0105  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  29.53 
 
 		 392 aa  48.1  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1646  beta lactamase-related protein, putative  30.34 
 
 		 399 aa  48.5  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.748601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3023  Beta-lactamase class A-like protein  22.4 
 
 		 277 aa  48.5  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0538064  normal  0.499976 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1684  Beta-lactamase  26.1 
 
 		 312 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132046  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1450  class A beta-lactamase precursor  26.5 
 
 		 322 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6760  Beta-lactamase class A-like protein  28.05 
 
 		 271 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0689983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1460  Beta-lactamase  23.13 
 
 		 334 aa  48.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00829053 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5358  Beta-lactamase  26.79 
 
 		 312 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000938331  normal  0.124933 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4929  Beta-lactamase  26.79 
 
 		 312 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000000432948  normal  0.0487719 
 
 
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>