153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2092 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2092  penicillin-binding protein, transpeptidase  100 
 
 		 424 aa  863    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00783255  hitchhiker  0.00000266476 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4774  beta-lactamase  40.77 
 
 		 442 aa  347  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167145 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0491  putative beta-lactamase protein  49.65 
 
 		 440 aa  293  6e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1147  putative beta-lactamase  53.88 
 
 		 423 aa  288  9e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1408  penicillin-binding protein, transpeptidase  48.66 
 
 		 504 aa  278  2e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3876  beta-lactamase  46.6 
 
 		 468 aa  268  2e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4223  beta-lactamase  46.39 
 
 		 508 aa  258  1e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1603  beta-lactamase  44.44 
 
 		 375 aa  252  9.000000000000001e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.955317  normal  0.378927 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1608  beta-lactamase  43.2 
 
 		 425 aa  250  4e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1634  beta-lactamase  43.2 
 
 		 425 aa  249  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.54925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1950  beta-lactamase family protein  34.31 
 
 		 381 aa  175  9.999999999999999e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15311  putative beta-lactamase  36.3 
 
 		 357 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.709796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0715  beta-lactamase family protein  34.52 
 
 		 388 aa  173  5e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0697  putative beta-lactamase  36.56 
 
 		 357 aa  172  7.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08971  putative beta-lactamase  36.65 
 
 		 386 aa  172  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.712716 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11351  Beta-lactamase class A  33.57 
 
 		 356 aa  166  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.470021  normal  0.82694 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1466  cell wall hydrolase/autolysin  45.28 
 
 		 627 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000100817  normal  0.166489 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0861  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  46.97 
 
 		 631 aa  120  4.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000195536  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1465  cell wall hydrolase/autolysin  45.52 
 
 		 627 aa  119  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000155726  normal  0.0455493 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0862  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  38.95 
 
 		 619 aa  118  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00159133  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1798  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  44.35 
 
 		 623 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0339  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  40.15 
 
 		 706 aa  109  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  26.1 
 
 		 803 aa  109  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4727  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  39.67 
 
 		 619 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0152355  normal  0.26499 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0602  beta-lactamase  27.93 
 
 		 274 aa  106  8e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0604  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  39.47 
 
 		 612 aa  106  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.594044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0589  cell wall hydrolase/autolysin  39.47 
 
 		 612 aa  106  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2360  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  43.9 
 
 		 344 aa  105  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.26107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5194  beta-lactamase  26.64 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1712  beta-lactamase  24.79 
 
 		 576 aa  100  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2815  beta-lactamase  29.39 
 
 		 296 aa  99.8  8e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6176  beta-lactamase  25.81 
 
 		 286 aa  98.6  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0566092 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3123  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  38.33 
 
 		 332 aa  98.2  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3334  Beta-lactamase  26.3 
 
 		 349 aa  97.8  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.17 
 
 		 422 aa  97.4  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3104  beta-lactamase  25.27 
 
 		 292 aa  92  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0156614  normal  0.401813 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3732  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.72 
 
 		 338 aa  90.5  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000534753  normal  0.117524 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3678  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.72 
 
 		 338 aa  90.5  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1169  Beta-lactamase class A-like protein  27.13 
 
 		 383 aa  89.7  8e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0280  Beta-lactamase  24.56 
 
 		 353 aa  87.8  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0316  beta-lactamase  27.51 
 
 		 315 aa  81.3  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00360568 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0725  Beta-lactamase class A-like protein  25.87 
 
 		 370 aa  81.6  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.725916  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4151  beta-lactamase  26.45 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.433565 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1435  Beta-lactamase  24.73 
 
 		 295 aa  79.7  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1634  hypothetical protein  28.47 
 
 		 236 aa  77.8  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1388  putative beta-lactamase  29.15 
 
 		 259 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1202  beta-lactamase, putative  29.15 
 
 		 259 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2055  peptidoglycan-binding LysM  26.12 
 
 		 333 aa  74.7  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000227262  normal  0.0328069 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1443  beta-lactamase  24.18 
 
 		 283 aa  69.7  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69594  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0724  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.52 
 
 		 287 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0435442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1000  putative beta-lactamase  33.04 
 
 		 390 aa  63.9  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.358949  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2043  beta-lactamase  26.05 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0136357  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0183  Beta-lactamase  21.46 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.51311 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3212  beta-lactamase  26.63 
 
 		 304 aa  62.4  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.184009 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4436  beta-lactamase class A-like protein  27.36 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101027  normal  0.450402 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3523  Beta-lactamase  30.43 
 
 		 338 aa  60.1  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1041  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.57 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1250  hypothetical protein  23.3 
 
 		 504 aa  59.3  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0003  beta-lactamase  27.54 
 
 		 281 aa  59.7  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000347481  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2552  Beta-lactamase  25.12 
 
 		 300 aa  59.7  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0802917  normal  0.0118018 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3361  beta-lactamase  25.46 
 
 		 282 aa  58.9  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282427 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0183  beta-lactamase  27.78 
 
 		 436 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975829 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2749  Beta-lactamase  27.54 
 
 		 281 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2827  Beta-lactamase  27.54 
 
 		 281 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.940774  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1476  hypothetical protein  20.89 
 
 		 496 aa  58.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001392  beta-lactamase  25.66 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000730239  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2352  Beta-lactamase  23.2 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445844 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0182  beta-lactamase  24.24 
 
 		 327 aa  57.8  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.689531 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2020  beta-lactamase  26.02 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4021  Beta-lactamase  24.16 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0799644 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1607  Beta-lactamase  20.83 
 
 		 291 aa  57  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1080  Beta-lactamase  26.61 
 
 		 301 aa  56.2  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0392714  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2257  hypothetical protein  27.85 
 
 		 434 aa  55.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3317  beta-lactamase class A-like protein  28.28 
 
 		 429 aa  55.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.313271  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2728  Beta-lactamase  25.26 
 
 		 299 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0079236  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3133  beta-lactamase  23.2 
 
 		 283 aa  54.7  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0594  Beta-lactamase  24.15 
 
 		 296 aa  54.7  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.272363  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2554  hypothetical protein  31.71 
 
 		 176 aa  54.7  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.388172  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0228  twin-arginine translocation pathway signal  28.24 
 
 		 300 aa  54.3  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2386  beta-lactamase  28 
 
 		 302 aa  53.5  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5713  beta-lactamase  25 
 
 		 292 aa  53.9  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2820  Beta-lactamase  27.66 
 
 		 289 aa  53.1  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.893397  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1461  beta-lactamase  28.57 
 
 		 281 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000606935  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6642  putative beta-lactamase precursor protein  25.12 
 
 		 287 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33460  hypothetical protein  28.57 
 
 		 424 aa  52.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1457  Beta-lactamase  22.85 
 
 		 305 aa  52.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.249297 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1117  hypothetical protein  26.56 
 
 		 492 aa  52.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00643446  normal  0.0767157 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2437  putative beta-lactamase precursor protein  25.71 
 
 		 290 aa  52  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5574  Beta-lactamase class A-like protein  27.23 
 
 		 266 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1446  beta-lactamase related protein  19.31 
 
 		 320 aa  51.2  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0788  beta-lactamase  22.34 
 
 		 418 aa  50.8  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2102  twin-arginine translocation pathway signal  22.27 
 
 		 296 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0733882  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2148  Beta-lactamase  22.27 
 
 		 296 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.748404  normal  0.133415 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2085  Beta-lactamase  22.27 
 
 		 296 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11921 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10331  cell wall hydrolase/autolysin  31.03 
 
 		 362 aa  50.4  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.374691  normal  0.548996 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2328  Beta-lactamase  22.27 
 
 		 296 aa  50.4  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1122  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.9 
 
 		 481 aa  50.4  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06370  beta-lactamase  25.41 
 
 		 283 aa  50.1  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3723  Beta-lactamase class A-like  24.02 
 
 		 255 aa  50.1  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000939313  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2215  beta-lactamase  25.56 
 
 		 290 aa  50.1  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.296886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>