87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2815 on replicon NC_013502
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013502  Rmar_2815  beta-lactamase  100 
 
 		 296 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0602  beta-lactamase  38.35 
 
 		 274 aa  168  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3212  beta-lactamase  33.61 
 
 		 304 aa  119  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.184009 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3104  beta-lactamase  31.85 
 
 		 292 aa  117  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0156614  normal  0.401813 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6176  beta-lactamase  30.45 
 
 		 286 aa  116  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0566092 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4151  beta-lactamase  29.44 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.433565 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5194  beta-lactamase  28.73 
 
 		 323 aa  102  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2092  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.39 
 
 		 424 aa  99.8  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00783255  hitchhiker  0.00000266476 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0316  beta-lactamase  36.52 
 
 		 315 aa  99.8  5e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00360568 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  28.09 
 
 		 803 aa  94  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2043  beta-lactamase  30.11 
 
 		 271 aa  90.5  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0136357  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1147  putative beta-lactamase  30.26 
 
 		 423 aa  89  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1603  beta-lactamase  27.54 
 
 		 375 aa  88.2  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.955317  normal  0.378927 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4223  beta-lactamase  31.39 
 
 		 508 aa  87.8  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0491  putative beta-lactamase protein  28.97 
 
 		 440 aa  85.9  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3334  Beta-lactamase  28.85 
 
 		 349 aa  85.5  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3876  beta-lactamase  29.06 
 
 		 468 aa  84.7  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1408  penicillin-binding protein, transpeptidase  28.81 
 
 		 504 aa  83.6  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4774  beta-lactamase  29.91 
 
 		 442 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167145 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1712  beta-lactamase  30.08 
 
 		 576 aa  77  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1443  beta-lactamase  30.08 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69594  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1388  putative beta-lactamase  24.46 
 
 		 259 aa  76.3  0.0000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1202  beta-lactamase, putative  24.46 
 
 		 259 aa  76.3  0.0000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6760  Beta-lactamase class A-like protein  32.29 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0689983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1608  beta-lactamase  26.6 
 
 		 425 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1634  beta-lactamase  26.6 
 
 		 425 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.54925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5713  beta-lactamase  28.33 
 
 		 292 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1446  beta-lactamase related protein  27.39 
 
 		 320 aa  68.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15311  putative beta-lactamase  26.39 
 
 		 357 aa  68.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.709796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0697  putative beta-lactamase  26.39 
 
 		 357 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5574  Beta-lactamase class A-like protein  29.26 
 
 		 266 aa  63.9  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2055  peptidoglycan-binding LysM  25.38 
 
 		 333 aa  63.5  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000227262  normal  0.0328069 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0280  Beta-lactamase  28.15 
 
 		 353 aa  62.8  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6642  putative beta-lactamase precursor protein  25.91 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2421  Beta-lactamase  26.46 
 
 		 310 aa  62.4  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000915272  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1169  Beta-lactamase class A-like protein  21.67 
 
 		 383 aa  60.1  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2020  beta-lactamase  25.8 
 
 		 319 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4436  beta-lactamase class A-like protein  35.59 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101027  normal  0.450402 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2437  putative beta-lactamase precursor protein  25.31 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11351  Beta-lactamase class A  24.68 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.470021  normal  0.82694 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2580  Beta-lactamase  26.84 
 
 		 300 aa  55.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000559373  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2386  beta-lactamase  26.32 
 
 		 302 aa  53.1  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5353  beta-lactamase  26.36 
 
 		 454 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3972  beta-lactamase  35.71 
 
 		 305 aa  52.4  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0506092  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4021  Beta-lactamase  26.25 
 
 		 296 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0799644 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001392  beta-lactamase  27.44 
 
 		 283 aa  51.6  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000730239  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4574  Beta-lactamase  30.82 
 
 		 303 aa  51.2  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08971  putative beta-lactamase  34.26 
 
 		 386 aa  50.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.712716 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1931  Beta-lactamase  37.5 
 
 		 335 aa  50.8  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2552  Beta-lactamase  25.66 
 
 		 300 aa  50.1  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0802917  normal  0.0118018 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0715  beta-lactamase family protein  27.95 
 
 		 388 aa  50.4  0.00004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0594  Beta-lactamase  24.41 
 
 		 296 aa  49.3  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.272363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0809  Beta-lactamase  22.86 
 
 		 315 aa  48.9  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3839  Beta-lactamase class A-like  28.03 
 
 		 402 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000233386  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3723  Beta-lactamase class A-like  23.85 
 
 		 255 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000939313  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1458  beta-lactamase  29.41 
 
 		 306 aa  48.1  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.755992  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1950  beta-lactamase family protein  26.15 
 
 		 381 aa  48.1  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2862  beta-lactamase  23.21 
 
 		 314 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0320845 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3299  Beta-lactamase  25.4 
 
 		 291 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5341  hypothetical protein  23.79 
 
 		 350 aa  47.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0183  beta-lactamase  27.95 
 
 		 436 aa  47.4  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975829 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1856  Beta-lactamase class A  24.77 
 
 		 243 aa  47.4  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000412045 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0195  Beta-lactamase  25 
 
 		 288 aa  46.6  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.210334  normal  0.167544 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5163  Beta-lactamase  34.82 
 
 		 322 aa  46.6  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0157119 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1434  beta-lactamase  24.42 
 
 		 452 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.685838 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1291  beta-lactamase, putative  32.43 
 
 		 387 aa  46.2  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4752  putative lipoprotein LpqF  34.04 
 
 		 443 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.164946  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4838  putative lipoprotein LpqF  34.04 
 
 		 443 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1419  beta-lactamase  27.41 
 
 		 305 aa  46.2  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.533278  hitchhiker  0.0000178355 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5138  putative lipoprotein LpqF  34.04 
 
 		 443 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1000  putative beta-lactamase  40.96 
 
 		 390 aa  45.4  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.358949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1476  hypothetical protein  23.84 
 
 		 496 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2728  Beta-lactamase  30.07 
 
 		 299 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0079236  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1457  Beta-lactamase  30.63 
 
 		 305 aa  44.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.249297 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1067  Beta-lactamase class A  35.11 
 
 		 253 aa  44.3  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.771599  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2389  Beta-lactamase  25.68 
 
 		 317 aa  44.3  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0172194  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3023  Beta-lactamase class A-like protein  24.89 
 
 		 277 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0538064  normal  0.499976 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3361  beta-lactamase  25.63 
 
 		 282 aa  43.9  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282427 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0183  Beta-lactamase  22.56 
 
 		 306 aa  43.9  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.51311 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1418  Beta-lactamase  29.73 
 
 		 300 aa  43.5  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732214  hitchhiker  0.0000172267 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2328  Beta-lactamase  24 
 
 		 296 aa  43.5  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1080  Beta-lactamase  24.21 
 
 		 301 aa  43.9  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0392714  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2085  Beta-lactamase  26.39 
 
 		 296 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11921 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1607  Beta-lactamase  20.46 
 
 		 291 aa  43.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0725  Beta-lactamase class A-like protein  20.69 
 
 		 370 aa  43.5  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.725916  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1529  Beta-lactamase  25.5 
 
 		 296 aa  43.1  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  20.17 
 
 		 422 aa  42.7  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>