83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3212 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3212  beta-lactamase  100 
 
 		 304 aa  636    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.184009 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3104  beta-lactamase  53.45 
 
 		 292 aa  310  2e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0156614  normal  0.401813 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6176  beta-lactamase  53.56 
 
 		 286 aa  294  1e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0566092 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2815  beta-lactamase  33.61 
 
 		 296 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0602  beta-lactamase  31.58 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1712  beta-lactamase  30.28 
 
 		 576 aa  86.3  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4223  beta-lactamase  27.6 
 
 		 508 aa  82.4  0.000000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2043  beta-lactamase  23.79 
 
 		 271 aa  80.9  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0136357  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1603  beta-lactamase  27.68 
 
 		 375 aa  80.9  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.955317  normal  0.378927 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0491  putative beta-lactamase protein  25.26 
 
 		 440 aa  76.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1408  penicillin-binding protein, transpeptidase  27.91 
 
 		 504 aa  76.3  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1147  putative beta-lactamase  25.94 
 
 		 423 aa  73.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4151  beta-lactamase  25.48 
 
 		 300 aa  72  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.433565 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2055  peptidoglycan-binding LysM  25.95 
 
 		 333 aa  72  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000227262  normal  0.0328069 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4774  beta-lactamase  23.79 
 
 		 442 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167145 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3876  beta-lactamase  25.69 
 
 		 468 aa  68.9  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5194  beta-lactamase  28.12 
 
 		 323 aa  68.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1608  beta-lactamase  24 
 
 		 425 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  24.23 
 
 		 803 aa  65.1  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1634  beta-lactamase  23.6 
 
 		 425 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.54925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0715  beta-lactamase family protein  24.31 
 
 		 388 aa  62.4  0.000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2092  penicillin-binding protein, transpeptidase  26.63 
 
 		 424 aa  62.4  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00783255  hitchhiker  0.00000266476 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1746  hypothetical protein  25.37 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.470795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3334  Beta-lactamase  24.15 
 
 		 349 aa  59.3  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5341  hypothetical protein  29.65 
 
 		 350 aa  59.3  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1950  beta-lactamase family protein  25.83 
 
 		 381 aa  59.7  0.00000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15311  putative beta-lactamase  23.71 
 
 		 357 aa  59.3  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.709796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0280  Beta-lactamase  22.73 
 
 		 353 aa  59.3  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0697  putative beta-lactamase  23.71 
 
 		 357 aa  58.9  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1250  hypothetical protein  24.14 
 
 		 504 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2152  hypothetical protein  24.06 
 
 		 513 aa  56.6  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0167915  hitchhiker  0.00298164 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0195  Beta-lactamase  25.88 
 
 		 288 aa  56.2  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.210334  normal  0.167544 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  23.57 
 
 		 422 aa  56.2  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5947  hypothetical protein  24.71 
 
 		 341 aa  56.2  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2552  Beta-lactamase  26.46 
 
 		 300 aa  55.8  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0802917  normal  0.0118018 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0316  beta-lactamase  24.9 
 
 		 315 aa  55.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00360568 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4574  Beta-lactamase  26.75 
 
 		 303 aa  55.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3023  hypothetical protein  25 
 
 		 516 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.698448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0855  Beta-lactamase  24.27 
 
 		 296 aa  53.5  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689397  normal  0.580537 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1435  Beta-lactamase  22.02 
 
 		 295 aa  53.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1388  putative beta-lactamase  22.13 
 
 		 259 aa  53.9  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1202  beta-lactamase, putative  22.13 
 
 		 259 aa  53.9  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1443  beta-lactamase  26.22 
 
 		 283 aa  53.9  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69594  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08971  putative beta-lactamase  26.22 
 
 		 386 aa  52.8  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.712716 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1169  Beta-lactamase class A-like protein  24.56 
 
 		 383 aa  52.4  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1080  Beta-lactamase  23.38 
 
 		 301 aa  51.6  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0392714  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2553  beta-lactamase  29.02 
 
 		 309 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1381  class A beta-lactamase  29.02 
 
 		 314 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0489957  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1446  beta-lactamase related protein  24.23 
 
 		 320 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1450  class A beta-lactamase precursor  26.94 
 
 		 322 aa  50.8  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2386  beta-lactamase  22.76 
 
 		 302 aa  50.8  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0228  twin-arginine translocation pathway signal  24.34 
 
 		 300 aa  50.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4021  Beta-lactamase  23.71 
 
 		 296 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0799644 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1301  class A beta-lactamase  29.02 
 
 		 314 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2085  Beta-lactamase  23.81 
 
 		 296 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11921 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0088  Beta-lactamase  25.67 
 
 		 291 aa  49.7  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.748085 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2148  Beta-lactamase  23.81 
 
 		 296 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.748404  normal  0.133415 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2102  twin-arginine translocation pathway signal  23.81 
 
 		 296 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0733882  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11351  Beta-lactamase class A  24.73 
 
 		 356 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.470021  normal  0.82694 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4436  beta-lactamase class A-like protein  27.1 
 
 		 293 aa  48.5  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101027  normal  0.450402 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1283  class A beta-lactamase  28.57 
 
 		 295 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.162345  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0527  class A beta-lactamase  28.57 
 
 		 314 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.29059  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1040  class A beta-lactamase  28.57 
 
 		 314 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.257126  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0257  class A beta-lactamase  28.57 
 
 		 314 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4009  Beta-lactamase  24.86 
 
 		 315 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2580  Beta-lactamase  22.31 
 
 		 300 aa  48.1  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000559373  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1011  beta-lactamase  25.59 
 
 		 290 aa  47  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2352  Beta-lactamase  23.24 
 
 		 297 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445844 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0183  beta-lactamase  29.11 
 
 		 436 aa  46.6  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975829 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0978  Beta-lactamase  23.55 
 
 		 304 aa  46.2  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.518614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1931  Beta-lactamase  29.38 
 
 		 335 aa  46.2  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5163  Beta-lactamase  31.36 
 
 		 322 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0157119 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1607  Beta-lactamase  21.25 
 
 		 291 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2827  Beta-lactamase  25.45 
 
 		 281 aa  45.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.940774  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2749  Beta-lactamase  25.45 
 
 		 281 aa  45.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0366  Beta-lactamase  25.28 
 
 		 291 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0385843  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2215  beta-lactamase  23.72 
 
 		 290 aa  43.9  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.296886  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5713  beta-lactamase  24.18 
 
 		 292 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1419  beta-lactamase  26.14 
 
 		 305 aa  43.9  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.533278  hitchhiker  0.0000178355 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0594  Beta-lactamase  21.67 
 
 		 296 aa  43.9  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.272363  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2388  Beta-lactamase  25.53 
 
 		 305 aa  43.9  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.327196  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1164  Beta-lactamase  22.98 
 
 		 300 aa  42.7  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.590965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1476  hypothetical protein  23.88 
 
 		 496 aa  42.7  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>