84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0697 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008819  NATL1_15311  putative beta-lactamase  96.92 
 
 		 357 aa  688    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.709796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0697  putative beta-lactamase  100 
 
 		 357 aa  712    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1950  beta-lactamase family protein  52.38 
 
 		 381 aa  315  9.999999999999999e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0715  beta-lactamase family protein  49.65 
 
 		 388 aa  307  2.0000000000000002e-82  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11351  Beta-lactamase class A  42.82 
 
 		 356 aa  291  1e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.470021  normal  0.82694 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08971  putative beta-lactamase  46.15 
 
 		 386 aa  287  2e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.712716 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1147  putative beta-lactamase  36 
 
 		 423 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1603  beta-lactamase  40.21 
 
 		 375 aa  202  5e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.955317  normal  0.378927 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0491  putative beta-lactamase protein  36.28 
 
 		 440 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1408  penicillin-binding protein, transpeptidase  33.82 
 
 		 504 aa  195  9e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4223  beta-lactamase  31.98 
 
 		 508 aa  179  4.999999999999999e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1608  beta-lactamase  32.05 
 
 		 425 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1634  beta-lactamase  32.05 
 
 		 425 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.54925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2092  penicillin-binding protein, transpeptidase  36.56 
 
 		 424 aa  172  5.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00783255  hitchhiker  0.00000266476 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4774  beta-lactamase  35.85 
 
 		 442 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167145 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3876  beta-lactamase  30.81 
 
 		 468 aa  169  5e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1712  beta-lactamase  25.19 
 
 		 576 aa  87.4  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0602  beta-lactamase  29.47 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2815  beta-lactamase  26.39 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6176  beta-lactamase  26.49 
 
 		 286 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0566092 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1388  putative beta-lactamase  28.76 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1202  beta-lactamase, putative  28.76 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3212  beta-lactamase  23.71 
 
 		 304 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.184009 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5194  beta-lactamase  20.75 
 
 		 323 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3104  beta-lactamase  25.73 
 
 		 292 aa  54.7  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0156614  normal  0.401813 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0316  beta-lactamase  27.44 
 
 		 315 aa  55.1  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00360568 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0280  Beta-lactamase  23.28 
 
 		 353 aa  53.5  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2020  beta-lactamase  26.07 
 
 		 319 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2421  Beta-lactamase  27.98 
 
 		 310 aa  52.8  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000915272  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2352  Beta-lactamase  21.4 
 
 		 297 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445844 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.79 
 
 		 422 aa  52  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0003  beta-lactamase  26.64 
 
 		 281 aa  52.8  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000347481  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2728  Beta-lactamase  32.63 
 
 		 299 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0079236  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2055  peptidoglycan-binding LysM  23.64 
 
 		 333 aa  51.6  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000227262  normal  0.0328069 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1418  Beta-lactamase  27.95 
 
 		 300 aa  51.2  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732214  hitchhiker  0.0000172267 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2827  Beta-lactamase  26.56 
 
 		 281 aa  50.4  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.940774  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2749  Beta-lactamase  26.56 
 
 		 281 aa  50.4  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1457  Beta-lactamase  27.33 
 
 		 305 aa  50.4  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.249297 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3334  Beta-lactamase  22.19 
 
 		 349 aa  50.1  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2862  beta-lactamase  28.48 
 
 		 314 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0320845 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1434  beta-lactamase  28.44 
 
 		 452 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.685838 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5353  beta-lactamase  34.48 
 
 		 454 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1080  Beta-lactamase  23.33 
 
 		 301 aa  48.9  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0392714  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  23.83 
 
 		 803 aa  48.5  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03960  hypothetical protein  30.21 
 
 		 453 aa  48.5  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0388079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1041  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.45 
 
 		 258 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0809  Beta-lactamase  28.48 
 
 		 315 aa  48.5  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2331  Beta-lactamase  29.52 
 
 		 309 aa  48.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000573292  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1855  Peptidoglycan-binding LysM  22.76 
 
 		 414 aa  47.8  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0182  beta-lactamase  32.14 
 
 		 327 aa  47  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.689531 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33460  hypothetical protein  31.78 
 
 		 424 aa  47  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3317  beta-lactamase class A-like protein  34.34 
 
 		 429 aa  46.6  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.313271  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0183  beta-lactamase  27.82 
 
 		 436 aa  46.2  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975829 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2148  Beta-lactamase  20.61 
 
 		 296 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.748404  normal  0.133415 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2253  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.16 
 
 		 393 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2043  beta-lactamase  29.41 
 
 		 271 aa  45.8  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0136357  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1381  class A beta-lactamase  23.15 
 
 		 314 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0489957  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2085  Beta-lactamase  20.61 
 
 		 296 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11921 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2102  twin-arginine translocation pathway signal  20.61 
 
 		 296 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0733882  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5138  putative lipoprotein LpqF  31.11 
 
 		 443 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1301  class A beta-lactamase  23.87 
 
 		 314 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1040  class A beta-lactamase  23.87 
 
 		 314 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.257126  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4838  putative lipoprotein LpqF  31.11 
 
 		 443 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0527  class A beta-lactamase  23.87 
 
 		 314 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.29059  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0257  class A beta-lactamase  23.87 
 
 		 314 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3723  Beta-lactamase class A-like  24.9 
 
 		 255 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000939313  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4752  putative lipoprotein LpqF  31.11 
 
 		 443 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.164946  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2389  Beta-lactamase  30.77 
 
 		 317 aa  45.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0172194  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1283  class A beta-lactamase  23.55 
 
 		 295 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.162345  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1749  peptidase S11 D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase 1  24.63 
 
 		 408 aa  44.3  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0088  Beta-lactamase  24.03 
 
 		 291 aa  44.7  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.748085 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0046  beta-lactamase TEM  27.27 
 
 		 286 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00171312  normal  0.356541 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1580  beta-lactamase TEM  27.27 
 
 		 286 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.262835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0130  beta-lactamase TEM  27.27 
 
 		 286 aa  44.7  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2215  beta-lactamase  24.69 
 
 		 290 aa  44.7  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.296886  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0594  Beta-lactamase  26.21 
 
 		 296 aa  44.3  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.272363  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0105  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  27.1 
 
 		 392 aa  43.9  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2553  beta-lactamase  23.46 
 
 		 309 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0725  Beta-lactamase class A-like protein  25.19 
 
 		 370 aa  43.5  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.725916  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4574  Beta-lactamase  21.76 
 
 		 303 aa  43.5  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0272  penicillin-binding protein 6  29.17 
 
 		 384 aa  43.5  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0746018  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2595  beta-lactamase Bla1  29.52 
 
 		 276 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.467167  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2522  beta-lactamase Bla1  29.52 
 
 		 306 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000102568 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2388  Beta-lactamase  28.57 
 
 		 305 aa  42.7  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.327196  normal  0.721784 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>