87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_15311 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0697  putative beta-lactamase  96.92 
 
 		 357 aa  688    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15311  putative beta-lactamase  100 
 
 		 357 aa  714    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.709796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1950  beta-lactamase family protein  50.71 
 
 		 381 aa  312  6.999999999999999e-84  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0715  beta-lactamase family protein  42.7 
 
 		 388 aa  303  3.0000000000000004e-81  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11351  Beta-lactamase class A  42.24 
 
 		 356 aa  287  2e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.470021  normal  0.82694 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08971  putative beta-lactamase  44.64 
 
 		 386 aa  286  5e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.712716 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1147  putative beta-lactamase  36.62 
 
 		 423 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1603  beta-lactamase  39.86 
 
 		 375 aa  199  6e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.955317  normal  0.378927 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1408  penicillin-binding protein, transpeptidase  34.71 
 
 		 504 aa  196  5.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0491  putative beta-lactamase protein  39.47 
 
 		 440 aa  196  6e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4223  beta-lactamase  32.27 
 
 		 508 aa  176  5e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2092  penicillin-binding protein, transpeptidase  36.3 
 
 		 424 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00783255  hitchhiker  0.00000266476 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1608  beta-lactamase  36.84 
 
 		 425 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1634  beta-lactamase  36.44 
 
 		 425 aa  169  6e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.54925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3876  beta-lactamase  30.81 
 
 		 468 aa  167  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4774  beta-lactamase  34.98 
 
 		 442 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167145 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1712  beta-lactamase  25.56 
 
 		 576 aa  87.4  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0602  beta-lactamase  28.99 
 
 		 274 aa  72  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2815  beta-lactamase  26.39 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6176  beta-lactamase  23.61 
 
 		 286 aa  67  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0566092 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1388  putative beta-lactamase  30.6 
 
 		 259 aa  66.2  0.0000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1202  beta-lactamase, putative  30.6 
 
 		 259 aa  66.2  0.0000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3212  beta-lactamase  23.71 
 
 		 304 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.184009 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0316  beta-lactamase  27.82 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00360568 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5194  beta-lactamase  20.82 
 
 		 323 aa  57  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0003  beta-lactamase  28.77 
 
 		 281 aa  55.8  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000347481  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3104  beta-lactamase  24.01 
 
 		 292 aa  55.8  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0156614  normal  0.401813 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2020  beta-lactamase  26.54 
 
 		 319 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1457  Beta-lactamase  28.05 
 
 		 305 aa  54.3  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.249297 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1418  Beta-lactamase  28.66 
 
 		 300 aa  53.9  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732214  hitchhiker  0.0000172267 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0280  Beta-lactamase  22.73 
 
 		 353 aa  53.9  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2421  Beta-lactamase  31.43 
 
 		 310 aa  53.5  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000915272  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3334  Beta-lactamase  22.5 
 
 		 349 aa  53.1  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.38 
 
 		 422 aa  52.8  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2749  Beta-lactamase  28.31 
 
 		 281 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2827  Beta-lactamase  28.31 
 
 		 281 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.940774  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2728  Beta-lactamase  32.63 
 
 		 299 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0079236  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2352  Beta-lactamase  21.57 
 
 		 297 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445844 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2055  peptidoglycan-binding LysM  23.02 
 
 		 333 aa  50.8  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000227262  normal  0.0328069 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2862  beta-lactamase  28.48 
 
 		 314 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0320845 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2331  Beta-lactamase  29.52 
 
 		 309 aa  49.3  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000573292  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0809  Beta-lactamase  28.48 
 
 		 315 aa  49.7  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  23.83 
 
 		 803 aa  48.9  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5353  beta-lactamase  34.48 
 
 		 454 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1434  beta-lactamase  28.44 
 
 		 452 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.685838 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1080  Beta-lactamase  23.61 
 
 		 301 aa  48.1  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0392714  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1381  class A beta-lactamase  24.07 
 
 		 314 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0489957  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0257  class A beta-lactamase  24.69 
 
 		 314 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03960  hypothetical protein  30.21 
 
 		 453 aa  47.8  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0388079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1040  class A beta-lactamase  24.69 
 
 		 314 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.257126  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1301  class A beta-lactamase  24.69 
 
 		 314 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0527  class A beta-lactamase  24.69 
 
 		 314 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.29059  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1283  class A beta-lactamase  24.69 
 
 		 295 aa  47.4  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.162345  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1041  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.75 
 
 		 258 aa  47  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0182  beta-lactamase  32.14 
 
 		 327 aa  46.6  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.689531 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2389  Beta-lactamase  25.15 
 
 		 317 aa  46.6  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0172194  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3317  beta-lactamase class A-like protein  34.34 
 
 		 429 aa  46.6  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.313271  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2553  beta-lactamase  24.28 
 
 		 309 aa  46.6  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1855  Peptidoglycan-binding LysM  23.58 
 
 		 414 aa  45.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2043  beta-lactamase  29.41 
 
 		 271 aa  45.8  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0136357  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1580  beta-lactamase TEM  27.27 
 
 		 286 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.262835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33460  hypothetical protein  30.84 
 
 		 424 aa  44.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0725  Beta-lactamase class A-like protein  25.93 
 
 		 370 aa  45.1  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.725916  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2085  Beta-lactamase  21.46 
 
 		 296 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11921 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0594  Beta-lactamase  29.07 
 
 		 296 aa  45.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.272363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3723  Beta-lactamase class A-like  24.9 
 
 		 255 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000939313  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2388  Beta-lactamase  24.86 
 
 		 305 aa  45.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.327196  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0130  beta-lactamase TEM  27.27 
 
 		 286 aa  44.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0046  beta-lactamase TEM  27.27 
 
 		 286 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00171312  normal  0.356541 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5138  putative lipoprotein LpqF  31.11 
 
 		 443 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2102  twin-arginine translocation pathway signal  22.92 
 
 		 296 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0733882  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4752  putative lipoprotein LpqF  31.11 
 
 		 443 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.164946  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2215  beta-lactamase  24.69 
 
 		 290 aa  44.7  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.296886  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2148  Beta-lactamase  22.92 
 
 		 296 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.748404  normal  0.133415 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4838  putative lipoprotein LpqF  31.11 
 
 		 443 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0183  beta-lactamase  27.82 
 
 		 436 aa  44.7  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975829 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2253  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.16 
 
 		 393 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4574  Beta-lactamase  21.76 
 
 		 303 aa  43.9  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1749  peptidase S11 D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase 1  24.63 
 
 		 408 aa  43.5  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2522  beta-lactamase Bla1  29.52 
 
 		 306 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000102568 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4151  beta-lactamase  25.45 
 
 		 300 aa  43.5  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.433565 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2291  beta-lactamase  29.52 
 
 		 312 aa  43.5  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000475261  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1618  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  27.01 
 
 		 363 aa  43.5  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0088  Beta-lactamase  23.26 
 
 		 291 aa  43.5  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.748085 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2595  beta-lactamase Bla1  29.52 
 
 		 276 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.467167  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2503  beta-lactamase  29.52 
 
 		 312 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1169  Beta-lactamase class A-like protein  25.93 
 
 		 383 aa  42.7  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>