51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0725 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0725  Beta-lactamase class A-like protein  100 
 
 		 370 aa  758    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.725916  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1169  Beta-lactamase class A-like protein  31.18 
 
 		 383 aa  171  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.68 
 
 		 422 aa  158  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2055  peptidoglycan-binding LysM  30.51 
 
 		 333 aa  132  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000227262  normal  0.0328069 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4223  beta-lactamase  27.16 
 
 		 508 aa  82.8  0.000000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2092  penicillin-binding protein, transpeptidase  25.87 
 
 		 424 aa  81.6  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00783255  hitchhiker  0.00000266476 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5194  beta-lactamase  29.09 
 
 		 323 aa  79  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1712  beta-lactamase  26.45 
 
 		 576 aa  78.6  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1408  penicillin-binding protein, transpeptidase  36.89 
 
 		 504 aa  75.5  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3876  beta-lactamase  26.37 
 
 		 468 aa  73.2  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4151  beta-lactamase  26.01 
 
 		 300 aa  72.8  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.433565 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0316  beta-lactamase  24.79 
 
 		 315 aa  71.2  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00360568 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1634  beta-lactamase  28.1 
 
 		 425 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.54925  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0013  hypothetical protein  26.82 
 
 		 428 aa  69.7  0.00000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1608  beta-lactamase  27.69 
 
 		 425 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0491  putative beta-lactamase protein  29.57 
 
 		 440 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  24.8 
 
 		 803 aa  67  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1147  putative beta-lactamase  27.59 
 
 		 423 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4774  beta-lactamase  31.71 
 
 		 442 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167145 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1603  beta-lactamase  26.47 
 
 		 375 aa  66.2  0.0000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.955317  normal  0.378927 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3334  Beta-lactamase  31.07 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1388  putative beta-lactamase  33.59 
 
 		 259 aa  62.4  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1202  beta-lactamase, putative  33.59 
 
 		 259 aa  62.4  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0602  beta-lactamase  25.75 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0015  Beta-lactamase class A  27.96 
 
 		 445 aa  60.5  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1435  Beta-lactamase  23.57 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0182  beta-lactamase  27 
 
 		 327 aa  55.8  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.689531 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1607  Beta-lactamase  22.81 
 
 		 291 aa  55.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0183  beta-lactamase  30.48 
 
 		 436 aa  53.5  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975829 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2552  Beta-lactamase  24.62 
 
 		 300 aa  53.1  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0802917  normal  0.0118018 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0011  hypothetical protein  27.18 
 
 		 430 aa  53.1  0.000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3231  Beta-lactamase  22.65 
 
 		 299 aa  49.3  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2043  beta-lactamase  28.43 
 
 		 271 aa  48.5  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0136357  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11351  Beta-lactamase class A  28.85 
 
 		 356 aa  47  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.470021  normal  0.82694 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0446  Beta-lactamase  24.26 
 
 		 297 aa  46.6  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0997  Beta-lactamase  26.06 
 
 		 304 aa  45.8  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.940845 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3523  Beta-lactamase  24.51 
 
 		 338 aa  45.8  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2827  Beta-lactamase  26.75 
 
 		 281 aa  45.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.940774  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2749  Beta-lactamase  26.75 
 
 		 281 aa  45.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15311  putative beta-lactamase  25.93 
 
 		 357 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.709796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0715  beta-lactamase family protein  29.07 
 
 		 388 aa  45.1  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0809  Beta-lactamase  27.11 
 
 		 315 aa  44.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0195  Beta-lactamase  20.51 
 
 		 288 aa  43.9  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.210334  normal  0.167544 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0003  beta-lactamase  26.34 
 
 		 281 aa  43.5  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000347481  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0679  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.49 
 
 		 404 aa  43.5  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.877856  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4436  beta-lactamase class A-like protein  27.18 
 
 		 293 aa  43.5  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101027  normal  0.450402 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0697  putative beta-lactamase  25.19 
 
 		 357 aa  43.5  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2815  beta-lactamase  20.69 
 
 		 296 aa  43.5  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2328  Beta-lactamase  23.47 
 
 		 296 aa  43.1  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2862  beta-lactamase  26.86 
 
 		 314 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0320845 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12104  class A beta-lactamase blaC  25.51 
 
 		 307 aa  42.7  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0108435  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>