128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1169 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1169  Beta-lactamase class A-like protein  100 
 
 		 383 aa  779    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.65 
 
 		 422 aa  192  7e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2055  peptidoglycan-binding LysM  37.11 
 
 		 333 aa  182  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000227262  normal  0.0328069 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0725  Beta-lactamase class A-like protein  31.18 
 
 		 370 aa  171  3e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.725916  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5194  beta-lactamase  29.82 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1712  beta-lactamase  29.1 
 
 		 576 aa  107  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4151  beta-lactamase  30.61 
 
 		 300 aa  103  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.433565 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  28.33 
 
 		 803 aa  95.9  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2092  penicillin-binding protein, transpeptidase  27.13 
 
 		 424 aa  89.7  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00783255  hitchhiker  0.00000266476 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0491  putative beta-lactamase protein  30.74 
 
 		 440 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1388  putative beta-lactamase  23.83 
 
 		 259 aa  83.6  0.000000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1202  beta-lactamase, putative  23.83 
 
 		 259 aa  83.6  0.000000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3334  Beta-lactamase  25.99 
 
 		 349 aa  79  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1603  beta-lactamase  27.44 
 
 		 375 aa  76.6  0.0000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.955317  normal  0.378927 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4021  Beta-lactamase  24.69 
 
 		 296 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0799644 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0602  beta-lactamase  27.52 
 
 		 274 aa  75.5  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4223  beta-lactamase  29.18 
 
 		 508 aa  74.7  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1408  penicillin-binding protein, transpeptidase  25.81 
 
 		 504 aa  68.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0013  hypothetical protein  28.51 
 
 		 428 aa  67.8  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6176  beta-lactamase  27.24 
 
 		 286 aa  67.8  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0566092 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3876  beta-lactamase  25.09 
 
 		 468 aa  68.2  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0003  beta-lactamase  27.67 
 
 		 281 aa  65.5  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000347481  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0183  beta-lactamase  29.92 
 
 		 436 aa  65.1  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975829 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2749  Beta-lactamase  27.38 
 
 		 281 aa  65.5  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2827  Beta-lactamase  27.38 
 
 		 281 aa  65.5  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.940774  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1147  putative beta-lactamase  25.8 
 
 		 423 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0316  beta-lactamase  24.28 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00360568 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0594  Beta-lactamase  26.05 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.272363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12104  class A beta-lactamase blaC  25.3 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0108435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3231  Beta-lactamase  22.51 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0228  twin-arginine translocation pathway signal  23.77 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2862  beta-lactamase  25 
 
 		 314 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0320845 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2728  Beta-lactamase  24.16 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0079236  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0280  Beta-lactamase  25.57 
 
 		 353 aa  62  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0182  beta-lactamase  29.31 
 
 		 327 aa  62.4  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.689531 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2580  Beta-lactamase  25.3 
 
 		 300 aa  62.8  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000559373  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3104  beta-lactamase  26.42 
 
 		 292 aa  62.4  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0156614  normal  0.401813 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0015  Beta-lactamase class A  25.83 
 
 		 445 aa  61.6  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2085  Beta-lactamase  25 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11921 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5163  Beta-lactamase  23.41 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0157119 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0809  Beta-lactamase  24.51 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1450  class A beta-lactamase precursor  24.39 
 
 		 322 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2421  Beta-lactamase  24.7 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000915272  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2815  beta-lactamase  21.67 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5713  beta-lactamase  22.83 
 
 		 292 aa  59.7  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2102  twin-arginine translocation pathway signal  24.58 
 
 		 296 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0733882  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2148  Beta-lactamase  24.58 
 
 		 296 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.748404  normal  0.133415 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2352  Beta-lactamase  23.41 
 
 		 297 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445844 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1381  class A beta-lactamase  22.61 
 
 		 314 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0489957  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1435  Beta-lactamase  24.16 
 
 		 295 aa  59.3  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1684  Beta-lactamase  24.42 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132046  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2043  beta-lactamase  25.35 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0136357  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3441  Beta-lactamase class A-like protein  26.64 
 
 		 347 aa  57.8  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000016591  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5358  Beta-lactamase  24.08 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000938331  normal  0.124933 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3299  Beta-lactamase  26.16 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4360  Beta-lactamase  23.79 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000108699  unclonable  0.00000562292 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4929  Beta-lactamase  24.08 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000000432948  normal  0.0487719 
 
 
 
NC_008782  Ajs_2328  Beta-lactamase  24.9 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1283  class A beta-lactamase  23.37 
 
 		 295 aa  57  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.162345  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0351  beta-lactamase  23.53 
 
 		 296 aa  57  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.154712 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0795  hypothetical protein  25.35 
 
 		 354 aa  57  0.0000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.845629  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2553  beta-lactamase  22.61 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0762  Beta-lactamase  23.77 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0608621  hitchhiker  0.000417556 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0257  class A beta-lactamase  22.61 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0527  class A beta-lactamase  22.61 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.29059  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1040  class A beta-lactamase  22.61 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.257126  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1529  Beta-lactamase  25.68 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1301  class A beta-lactamase  22.61 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1461  beta-lactamase  27.38 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000606935  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5574  Beta-lactamase class A-like protein  28.87 
 
 		 266 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0011  hypothetical protein  24.78 
 
 		 430 aa  55.8  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1457  Beta-lactamase  20.93 
 
 		 305 aa  55.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.249297 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3133  beta-lactamase  24 
 
 		 283 aa  55.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2020  beta-lactamase  23.44 
 
 		 319 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4774  beta-lactamase  24.9 
 
 		 442 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167145 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1950  beta-lactamase family protein  24.8 
 
 		 381 aa  55.1  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2388  Beta-lactamase  22.89 
 
 		 305 aa  54.7  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.327196  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1419  beta-lactamase  27.87 
 
 		 305 aa  54.3  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.533278  hitchhiker  0.0000178355 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1634  beta-lactamase  26.94 
 
 		 425 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.54925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0446  Beta-lactamase  21.29 
 
 		 297 aa  53.5  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4009  Beta-lactamase  22.88 
 
 		 315 aa  53.5  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2552  Beta-lactamase  22.13 
 
 		 300 aa  53.5  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0802917  normal  0.0118018 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0997  Beta-lactamase  24.58 
 
 		 304 aa  53.1  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.940845 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0765  hypothetical protein  29.9 
 
 		 459 aa  52.8  0.000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0727099  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3212  beta-lactamase  24.56 
 
 		 304 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.184009 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2215  beta-lactamase  24.56 
 
 		 290 aa  52.8  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.296886  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4574  Beta-lactamase  22.78 
 
 		 303 aa  52.8  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3960  hypothetical protein  25.98 
 
 		 295 aa  52.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0366  Beta-lactamase  26.41 
 
 		 291 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0385843  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1931  Beta-lactamase  26.47 
 
 		 335 aa  52.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1418  Beta-lactamase  20.62 
 
 		 300 aa  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732214  hitchhiker  0.0000172267 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11351  Beta-lactamase class A  23.14 
 
 		 356 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.470021  normal  0.82694 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3523  Beta-lactamase  21.63 
 
 		 338 aa  52  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3136  Beta-lactamase  26.75 
 
 		 303 aa  51.6  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0570574  normal  0.676016 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1608  beta-lactamase  26.94 
 
 		 425 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3361  beta-lactamase  23.87 
 
 		 282 aa  51.2  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282427 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5706  Beta-lactamase  23.65 
 
 		 327 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0338924  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2389  Beta-lactamase  21.74 
 
 		 317 aa  50.1  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0172194  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2386  beta-lactamase  27.14 
 
 		 302 aa  49.7  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3723  Beta-lactamase class A-like  21.76 
 
 		 255 aa  49.7  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000939313  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>