138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1408 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_1408  penicillin-binding protein, transpeptidase  100 
 
 		 504 aa  1006    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4223  beta-lactamase  60.23 
 
 		 508 aa  564  1.0000000000000001e-159  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0491  putative beta-lactamase protein  53.87 
 
 		 440 aa  336  5.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1147  putative beta-lactamase  50.58 
 
 		 423 aa  332  8e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3876  beta-lactamase  50.31 
 
 		 468 aa  331  2e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1634  beta-lactamase  49.85 
 
 		 425 aa  314  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.54925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1608  beta-lactamase  49.55 
 
 		 425 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1603  beta-lactamase  48.23 
 
 		 375 aa  295  2e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.955317  normal  0.378927 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4774  beta-lactamase  48.81 
 
 		 442 aa  281  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167145 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2092  penicillin-binding protein, transpeptidase  48.66 
 
 		 424 aa  278  2e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00783255  hitchhiker  0.00000266476 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11351  Beta-lactamase class A  39.2 
 
 		 356 aa  228  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.470021  normal  0.82694 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0715  beta-lactamase family protein  37.33 
 
 		 388 aa  226  6e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08971  putative beta-lactamase  38.3 
 
 		 386 aa  222  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.712716 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1950  beta-lactamase family protein  39.8 
 
 		 381 aa  214  3.9999999999999995e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15311  putative beta-lactamase  34.71 
 
 		 357 aa  196  8.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.709796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0697  putative beta-lactamase  33.82 
 
 		 357 aa  195  1e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0602  beta-lactamase  29.21 
 
 		 274 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6176  beta-lactamase  26.51 
 
 		 286 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0566092 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1712  beta-lactamase  24.18 
 
 		 576 aa  100  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0280  Beta-lactamase  31.08 
 
 		 353 aa  95.9  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  28.86 
 
 		 803 aa  89.4  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5194  beta-lactamase  25.58 
 
 		 323 aa  87.8  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.56 
 
 		 422 aa  85.1  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2815  beta-lactamase  28.81 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4151  beta-lactamase  26.75 
 
 		 300 aa  82.4  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.433565 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3104  beta-lactamase  24.21 
 
 		 292 aa  78.6  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0156614  normal  0.401813 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3334  Beta-lactamase  23.92 
 
 		 349 aa  77.4  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2043  beta-lactamase  28.16 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0136357  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3212  beta-lactamase  27.91 
 
 		 304 aa  76.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.184009 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0725  Beta-lactamase class A-like protein  36.89 
 
 		 370 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.725916  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1435  Beta-lactamase  25.98 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0351  beta-lactamase  31.77 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.154712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1443  beta-lactamase  26.97 
 
 		 283 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69594  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0316  beta-lactamase  27.54 
 
 		 315 aa  71.6  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00360568 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1169  Beta-lactamase class A-like protein  25.81 
 
 		 383 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0182  beta-lactamase  34.55 
 
 		 327 aa  68.2  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.689531 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2020  beta-lactamase  27.64 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2728  Beta-lactamase  31.47 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0079236  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0446  Beta-lactamase  31.25 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2552  Beta-lactamase  29.29 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0802917  normal  0.0118018 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2085  Beta-lactamase  29.44 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11921 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0183  beta-lactamase  27.7 
 
 		 436 aa  67  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975829 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1607  Beta-lactamase  21.34 
 
 		 291 aa  67  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2102  twin-arginine translocation pathway signal  29.44 
 
 		 296 aa  67  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0733882  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2148  Beta-lactamase  29.44 
 
 		 296 aa  67  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.748404  normal  0.133415 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1388  putative beta-lactamase  26.98 
 
 		 259 aa  65.9  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1202  beta-lactamase, putative  26.98 
 
 		 259 aa  65.9  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2352  Beta-lactamase  26.39 
 
 		 297 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445844 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4021  Beta-lactamase  27.71 
 
 		 296 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0799644 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2055  peptidoglycan-binding LysM  27.73 
 
 		 333 aa  63.9  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000227262  normal  0.0328069 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0228  twin-arginine translocation pathway signal  31.07 
 
 		 300 aa  63.2  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0594  Beta-lactamase  27.6 
 
 		 296 aa  63.2  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.272363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1435  Beta-lactamase  30.17 
 
 		 288 aa  62.8  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1446  beta-lactamase related protein  24.54 
 
 		 320 aa  62.4  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0183  Beta-lactamase  22.09 
 
 		 306 aa  62.4  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.51311 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3361  beta-lactamase  27.05 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282427 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1434  beta-lactamase  34.15 
 
 		 452 aa  61.6  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.685838 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1746  hypothetical protein  27.2 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.470795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33460  hypothetical protein  39.24 
 
 		 424 aa  60.1  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1000  putative beta-lactamase  36.67 
 
 		 390 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.358949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1476  hypothetical protein  22.94 
 
 		 496 aa  59.7  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2421  Beta-lactamase  25.82 
 
 		 310 aa  59.3  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000915272  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0788  beta-lactamase  24.04 
 
 		 418 aa  58.9  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2437  putative beta-lactamase precursor protein  24.91 
 
 		 290 aa  58.9  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03960  hypothetical protein  38.1 
 
 		 453 aa  58.5  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0388079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0130  beta-lactamase TEM  26.87 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6642  putative beta-lactamase precursor protein  28.19 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1580  beta-lactamase TEM  26.87 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.262835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0046  beta-lactamase TEM  26.87 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00171312  normal  0.356541 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3023  Beta-lactamase class A-like protein  24.14 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0538064  normal  0.499976 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4439  putative Beta-lactamase  28.79 
 
 		 288 aa  57  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0809  Beta-lactamase  25.2 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3317  beta-lactamase class A-like protein  36.63 
 
 		 429 aa  56.2  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.313271  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4752  putative lipoprotein LpqF  36.9 
 
 		 443 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.164946  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4838  putative lipoprotein LpqF  36.9 
 
 		 443 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5713  beta-lactamase  23.94 
 
 		 292 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5138  putative lipoprotein LpqF  36.9 
 
 		 443 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0978  Beta-lactamase  29.02 
 
 		 304 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.518614  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2388  Beta-lactamase  28.16 
 
 		 305 aa  55.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.327196  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0762  Beta-lactamase  28.34 
 
 		 315 aa  55.5  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0608621  hitchhiker  0.000417556 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0003  beta-lactamase  24.12 
 
 		 281 aa  54.7  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000347481  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4436  beta-lactamase class A-like protein  27.94 
 
 		 293 aa  54.7  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101027  normal  0.450402 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2749  Beta-lactamase  24.51 
 
 		 281 aa  54.7  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2827  Beta-lactamase  24.51 
 
 		 281 aa  54.7  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.940774  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2862  beta-lactamase  26.21 
 
 		 314 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0320845 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4929  Beta-lactamase  28.29 
 
 		 312 aa  54.3  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000000432948  normal  0.0487719 
 
 
 
NC_011369  Rleg2_0855  Beta-lactamase  26.77 
 
 		 296 aa  54.3  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689397  normal  0.580537 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3133  beta-lactamase  25 
 
 		 283 aa  53.9  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2215  beta-lactamase  27.6 
 
 		 290 aa  53.5  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.296886  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5353  beta-lactamase  36.9 
 
 		 454 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1381  class A beta-lactamase  25.96 
 
 		 314 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0489957  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5358  Beta-lactamase  27.89 
 
 		 312 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000938331  normal  0.124933 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001392  beta-lactamase  29.06 
 
 		 283 aa  52.8  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000730239  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0366  Beta-lactamase  28.43 
 
 		 291 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0385843  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2820  Beta-lactamase  28.72 
 
 		 289 aa  52.8  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.893397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5341  hypothetical protein  30.77 
 
 		 350 aa  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1301  class A beta-lactamase  26.32 
 
 		 314 aa  52  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13626  lipoprotein lpqF  35.79 
 
 		 452 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.7641599999999997e-27  normal  0.0255048 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1390  Beta-lactamase  29.41 
 
 		 289 aa  52  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0585114  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1931  Beta-lactamase  27.98 
 
 		 335 aa  51.2  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>