50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5353 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_1434  beta-lactamase  86.53 
 
 		 452 aa  789    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.685838 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5138  putative lipoprotein LpqF  70.84 
 
 		 443 aa  641    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5353  beta-lactamase  100 
 
 		 454 aa  925    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4752  putative lipoprotein LpqF  71.07 
 
 		 443 aa  642    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.164946  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4838  putative lipoprotein LpqF  71.07 
 
 		 443 aa  643    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13626  lipoprotein lpqF  62.56 
 
 		 452 aa  553  1e-156  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.7641599999999997e-27  normal  0.0255048 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03960  hypothetical protein  35.68 
 
 		 453 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0388079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33460  hypothetical protein  32.01 
 
 		 424 aa  180  4.999999999999999e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3317  beta-lactamase class A-like protein  31.27 
 
 		 429 aa  123  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.313271  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7688  putative beta-lactamase  30.97 
 
 		 458 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1090  putative beta-lactamase  27.58 
 
 		 443 aa  89  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.9523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1000  putative beta-lactamase  29.96 
 
 		 390 aa  79  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.358949  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1646  beta lactamase-related protein, putative  28.03 
 
 		 399 aa  68.2  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.748601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1603  beta-lactamase  40.86 
 
 		 375 aa  58.2  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.955317  normal  0.378927 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4774  beta-lactamase  37.11 
 
 		 442 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167145 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1634  beta-lactamase  32.26 
 
 		 425 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.54925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3876  beta-lactamase  36.36 
 
 		 468 aa  55.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0602  beta-lactamase  29.29 
 
 		 274 aa  55.1  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1608  beta-lactamase  31.45 
 
 		 425 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5713  beta-lactamase  34 
 
 		 292 aa  53.5  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3839  Beta-lactamase class A-like  31.62 
 
 		 402 aa  53.5  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000233386  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2815  beta-lactamase  26.36 
 
 		 296 aa  53.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1408  penicillin-binding protein, transpeptidase  36.9 
 
 		 504 aa  53.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1291  beta-lactamase, putative  28.28 
 
 		 387 aa  52  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1748  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  37.23 
 
 		 414 aa  52.4  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0715  beta-lactamase family protein  30.7 
 
 		 388 aa  52  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08971  putative beta-lactamase  29.06 
 
 		 386 aa  51.6  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.712716 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11351  Beta-lactamase class A  33.71 
 
 		 356 aa  51.2  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.470021  normal  0.82694 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15311  putative beta-lactamase  34.48 
 
 		 357 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.709796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1443  beta-lactamase  32.98 
 
 		 283 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69594  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4223  beta-lactamase  30.95 
 
 		 508 aa  48.9  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0697  putative beta-lactamase  34.48 
 
 		 357 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1950  beta-lactamase family protein  30.77 
 
 		 381 aa  48.5  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0316  beta-lactamase  31.25 
 
 		 315 aa  48.9  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00360568 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0327  penicillin-binding transmembrane protein  34.91 
 
 		 397 aa  48.5  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2055  peptidoglycan-binding LysM  26.14 
 
 		 333 aa  48.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000227262  normal  0.0328069 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0189  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  35.85 
 
 		 400 aa  47.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0133986  normal  0.43472 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2092  penicillin-binding protein, transpeptidase  26.98 
 
 		 424 aa  47.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00783255  hitchhiker  0.00000266476 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0183  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  35.85 
 
 		 400 aa  47.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1712  beta-lactamase  31.73 
 
 		 576 aa  46.2  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1147  putative beta-lactamase  33.33 
 
 		 423 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6642  putative beta-lactamase precursor protein  32.56 
 
 		 287 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2437  putative beta-lactamase precursor protein  30.43 
 
 		 290 aa  44.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1660  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  34.65 
 
 		 333 aa  44.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3443  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  41.67 
 
 		 380 aa  44.7  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0238  peptidase  34.65 
 
 		 333 aa  44.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2063  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  35.37 
 
 		 392 aa  44.3  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0436268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1267  Beta-lactamase  33.98 
 
 		 425 aa  43.9  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00143172  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1931  Beta-lactamase  36.26 
 
 		 335 aa  43.9  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4436  beta-lactamase class A-like protein  33.33 
 
 		 293 aa  43.9  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101027  normal  0.450402 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>