38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13626 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13626  lipoprotein lpqF  100 
 
 		 452 aa  920    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.7641599999999997e-27  normal  0.0255048 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4752  putative lipoprotein LpqF  63.78 
 
 		 443 aa  577  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.164946  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4838  putative lipoprotein LpqF  63.55 
 
 		 443 aa  575  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5138  putative lipoprotein LpqF  63.78 
 
 		 443 aa  576  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5353  beta-lactamase  64.08 
 
 		 454 aa  554  1e-156  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1434  beta-lactamase  64.05 
 
 		 452 aa  546  1e-154  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.685838 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03960  hypothetical protein  39.25 
 
 		 453 aa  207  3e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0388079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33460  hypothetical protein  32.8 
 
 		 424 aa  164  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7688  putative beta-lactamase  29.85 
 
 		 458 aa  113  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3317  beta-lactamase class A-like protein  33.45 
 
 		 429 aa  110  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.313271  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1090  putative beta-lactamase  27.44 
 
 		 443 aa  99  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.9523  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1646  beta lactamase-related protein, putative  26.33 
 
 		 399 aa  73.9  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.748601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1000  putative beta-lactamase  29.27 
 
 		 390 aa  68.6  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.358949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1603  beta-lactamase  41.67 
 
 		 375 aa  60.1  0.00000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.955317  normal  0.378927 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3839  Beta-lactamase class A-like  28.57 
 
 		 402 aa  55.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000233386  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0602  beta-lactamase  34.34 
 
 		 274 aa  53.9  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1408  penicillin-binding protein, transpeptidase  35.79 
 
 		 504 aa  51.6  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1634  beta-lactamase  31.15 
 
 		 425 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.54925  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4223  beta-lactamase  32.95 
 
 		 508 aa  48.9  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3876  beta-lactamase  38.16 
 
 		 468 aa  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1874  hypothetical protein  19.93 
 
 		 363 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4774  beta-lactamase  35.42 
 
 		 442 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167145 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1608  beta-lactamase  30.33 
 
 		 425 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0715  beta-lactamase family protein  32.29 
 
 		 388 aa  47.4  0.0006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0491  putative beta-lactamase protein  33.33 
 
 		 440 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1267  Beta-lactamase  31.03 
 
 		 425 aa  45.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00143172  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5713  beta-lactamase  35.16 
 
 		 292 aa  44.3  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1760  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  21.18 
 
 		 363 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1569  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  19.69 
 
 		 363 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11351  Beta-lactamase class A  31.58 
 
 		 356 aa  44.3  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.470021  normal  0.82694 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1743  hypothetical protein  19.69 
 
 		 363 aa  43.9  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1617  hypothetical protein  19.69 
 
 		 363 aa  43.9  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.482442  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1618  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  20.41 
 
 		 363 aa  43.9  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1820  hypothetical protein  20.07 
 
 		 363 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.549767  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1402  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  20.36 
 
 		 362 aa  43.9  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.761987  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08971  putative beta-lactamase  29.91 
 
 		 386 aa  43.5  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.712716 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0182  beta-lactamase  30.7 
 
 		 327 aa  43.5  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.689531 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1443  beta-lactamase  31.58 
 
 		 283 aa  43.1  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69594  normal  0.126584 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>