33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1000 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1000  putative beta-lactamase  100 
 
 		 390 aa  774    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.358949  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1646  beta lactamase-related protein, putative  62.17 
 
 		 399 aa  460  9.999999999999999e-129  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.748601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1090  putative beta-lactamase  35.53 
 
 		 443 aa  169  5e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.9523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3317  beta-lactamase class A-like protein  40.26 
 
 		 429 aa  158  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.313271  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7688  putative beta-lactamase  35.44 
 
 		 458 aa  150  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03960  hypothetical protein  33.33 
 
 		 453 aa  113  7.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0388079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33460  hypothetical protein  33.56 
 
 		 424 aa  106  7e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4752  putative lipoprotein LpqF  29.93 
 
 		 443 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.164946  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4838  putative lipoprotein LpqF  29.93 
 
 		 443 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5138  putative lipoprotein LpqF  29.93 
 
 		 443 aa  87  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1434  beta-lactamase  30.35 
 
 		 452 aa  86.7  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.685838 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5353  beta-lactamase  29.96 
 
 		 454 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13626  lipoprotein lpqF  29.27 
 
 		 452 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.7641599999999997e-27  normal  0.0255048 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2092  penicillin-binding protein, transpeptidase  33.04 
 
 		 424 aa  63.9  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00783255  hitchhiker  0.00000266476 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1408  penicillin-binding protein, transpeptidase  36.67 
 
 		 504 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4223  beta-lactamase  32.97 
 
 		 508 aa  55.1  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4774  beta-lactamase  35.65 
 
 		 442 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167145 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3876  beta-lactamase  25.85 
 
 		 468 aa  54.7  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11351  Beta-lactamase class A  29.31 
 
 		 356 aa  54.3  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.470021  normal  0.82694 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2043  beta-lactamase  31.36 
 
 		 271 aa  53.5  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0136357  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1608  beta-lactamase  34.44 
 
 		 425 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08971  putative beta-lactamase  31.03 
 
 		 386 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.712716 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1634  beta-lactamase  34.44 
 
 		 425 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.54925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0316  beta-lactamase  31.36 
 
 		 315 aa  52  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00360568 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1147  putative beta-lactamase  26.99 
 
 		 423 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1603  beta-lactamase  30 
 
 		 375 aa  51.6  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.955317  normal  0.378927 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1950  beta-lactamase family protein  28.68 
 
 		 381 aa  50.4  0.00006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1443  beta-lactamase  31.91 
 
 		 283 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69594  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0715  beta-lactamase family protein  31.76 
 
 		 388 aa  49.3  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0183  beta-lactamase  34.58 
 
 		 436 aa  45.8  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975829 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0491  putative beta-lactamase protein  31.3 
 
 		 440 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2815  beta-lactamase  40.96 
 
 		 296 aa  45.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3334  Beta-lactamase  34.62 
 
 		 349 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>