33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_03960 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_03960  hypothetical protein  100 
 
 
453 aa  876    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0388079  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4838  putative lipoprotein LpqF  40.72 
 
 
443 aa  227  3e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4752  putative lipoprotein LpqF  40.72 
 
 
443 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.164946  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5138  putative lipoprotein LpqF  40.42 
 
 
443 aa  225  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5353  beta-lactamase  35.68 
 
 
454 aa  218  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1434  beta-lactamase  41 
 
 
452 aa  216  5e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.685838 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13626  lipoprotein lpqF  39.25 
 
 
452 aa  207  4e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.7641599999999997e-27  normal  0.0255048 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33460  hypothetical protein  33.24 
 
 
424 aa  181  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7688  putative beta-lactamase  35 
 
 
458 aa  179  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3317  beta-lactamase class A-like protein  37.54 
 
 
429 aa  156  7e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.313271  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1000  putative beta-lactamase  33.33 
 
 
390 aa  113  7.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.358949  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1646  beta lactamase-related protein, putative  35.94 
 
 
399 aa  105  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.748601  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1090  putative beta-lactamase  31.82 
 
 
443 aa  97.4  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.9523  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1603  beta-lactamase  46.91 
 
 
375 aa  73.2  0.000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.955317  normal  0.378927 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1634  beta-lactamase  38.24 
 
 
425 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.54925  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08971  putative beta-lactamase  38.64 
 
 
386 aa  61.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.712716 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1608  beta-lactamase  37.25 
 
 
425 aa  60.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1408  penicillin-binding protein, transpeptidase  38.1 
 
 
504 aa  58.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4223  beta-lactamase  38.2 
 
 
508 aa  56.6  0.0000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11351  Beta-lactamase class A  30.84 
 
 
356 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.470021  normal  0.82694 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0491  putative beta-lactamase protein  35.65 
 
 
440 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0715  beta-lactamase family protein  35.44 
 
 
388 aa  55.1  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1950  beta-lactamase family protein  34.74 
 
 
381 aa  54.7  0.000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0602  beta-lactamase  29.79 
 
 
274 aa  54.3  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4774  beta-lactamase  36.9 
 
 
442 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167145 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1147  putative beta-lactamase  34.48 
 
 
423 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3876  beta-lactamase  32.45 
 
 
468 aa  50.1  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0697  putative beta-lactamase  30.21 
 
 
357 aa  48.5  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15311  putative beta-lactamase  30.21 
 
 
357 aa  47.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.709796  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2092  penicillin-binding protein, transpeptidase  32 
 
 
424 aa  46.6  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00783255  hitchhiker  0.00000266476 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0182  beta-lactamase  38.96 
 
 
327 aa  45.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.689531 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4009  Beta-lactamase  35.65 
 
 
315 aa  44.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0183  beta-lactamase  38.96 
 
 
436 aa  43.9  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.975829 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>