56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4752 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_1434  beta-lactamase  70.84 
 
 		 452 aa  641    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.685838 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5138  putative lipoprotein LpqF  99.1 
 
 		 443 aa  894    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5353  beta-lactamase  72.37 
 
 		 454 aa  639    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4838  putative lipoprotein LpqF  99.77 
 
 		 443 aa  902    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4752  putative lipoprotein LpqF  100 
 
 		 443 aa  903    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.164946  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13626  lipoprotein lpqF  63.78 
 
 		 452 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.7641599999999997e-27  normal  0.0255048 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03960  hypothetical protein  40.72 
 
 		 453 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0388079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33460  hypothetical protein  32.36 
 
 		 424 aa  176  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7688  putative beta-lactamase  31.7 
 
 		 458 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3317  beta-lactamase class A-like protein  32.29 
 
 		 429 aa  127  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.313271  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1090  putative beta-lactamase  27.84 
 
 		 443 aa  101  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.9523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1000  putative beta-lactamase  29.93 
 
 		 390 aa  87  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.358949  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1646  beta lactamase-related protein, putative  30 
 
 		 399 aa  77.4  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.748601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3839  Beta-lactamase class A-like  23.64 
 
 		 402 aa  62.4  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000233386  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1603  beta-lactamase  42.86 
 
 		 375 aa  62  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.955317  normal  0.378927 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1634  beta-lactamase  39.29 
 
 		 425 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.54925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4774  beta-lactamase  38.71 
 
 		 442 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167145 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1608  beta-lactamase  38.1 
 
 		 425 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0602  beta-lactamase  28.1 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11351  Beta-lactamase class A  35.96 
 
 		 356 aa  57.4  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.470021  normal  0.82694 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1408  penicillin-binding protein, transpeptidase  36.9 
 
 		 504 aa  56.6  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3876  beta-lactamase  36.9 
 
 		 468 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0182  beta-lactamase  35.24 
 
 		 327 aa  55.1  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.689531 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08971  putative beta-lactamase  34.83 
 
 		 386 aa  55.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.712716 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0715  beta-lactamase family protein  34.83 
 
 		 388 aa  55.1  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1950  beta-lactamase family protein  35.96 
 
 		 381 aa  54.7  0.000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4223  beta-lactamase  33.33 
 
 		 508 aa  52  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0491  putative beta-lactamase protein  39.47 
 
 		 440 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1874  hypothetical protein  22.73 
 
 		 363 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1618  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  22.18 
 
 		 363 aa  50.4  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1748  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  35.11 
 
 		 414 aa  49.7  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1443  beta-lactamase  32.35 
 
 		 283 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69594  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1569  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  22.38 
 
 		 363 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1147  putative beta-lactamase  33.33 
 
 		 423 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5713  beta-lactamase  31.87 
 
 		 292 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1617  hypothetical protein  22.38 
 
 		 363 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.482442  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1743  hypothetical protein  22.38 
 
 		 363 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4436  beta-lactamase class A-like protein  31.25 
 
 		 293 aa  48.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101027  normal  0.450402 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1402  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  20.92 
 
 		 362 aa  47.8  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.761987  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6642  putative beta-lactamase precursor protein  32.56 
 
 		 287 aa  47.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1793  hypothetical protein  22.03 
 
 		 363 aa  47  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1578  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  22.03 
 
 		 363 aa  47  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000128652  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1712  beta-lactamase  35.11 
 
 		 576 aa  47  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2815  beta-lactamase  34.04 
 
 		 296 aa  46.2  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1291  beta-lactamase, putative  29.9 
 
 		 387 aa  45.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2055  peptidoglycan-binding LysM  27.03 
 
 		 333 aa  45.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000227262  normal  0.0328069 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3972  beta-lactamase  30.69 
 
 		 305 aa  45.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0506092  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1760  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  19.72 
 
 		 363 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0316  beta-lactamase  33.33 
 
 		 315 aa  45.1  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00360568 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  25.23 
 
 		 803 aa  44.7  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2092  penicillin-binding protein, transpeptidase  28.57 
 
 		 424 aa  45.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00783255  hitchhiker  0.00000266476 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0697  putative beta-lactamase  31.11 
 
 		 357 aa  45.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15311  putative beta-lactamase  31.11 
 
 		 357 aa  44.3  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.709796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3583  hypothetical protein  22.1 
 
 		 363 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1820  hypothetical protein  22.1 
 
 		 363 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.549767  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2437  putative beta-lactamase precursor protein  32.93 
 
 		 290 aa  43.1  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651142  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>