152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1855 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_1855  Peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 414 aa  841    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4900  hypothetical protein  29.72 
 
 		 296 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2696  hypothetical protein  36.41 
 
 		 325 aa  100  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.243231  normal  0.199741 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1541  penicillin-binding protein, transpeptidase  32.88 
 
 		 265 aa  96.7  7e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4045  hypothetical protein  28.97 
 
 		 283 aa  87.8  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79255  normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1520  Beta-lactamase class A  32.31 
 
 		 297 aa  83.6  0.000000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0507  putative secreted protein  28.45 
 
 		 326 aa  77.4  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6105  hypothetical protein  28.5 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0158  hypothetical protein  32.69 
 
 		 259 aa  75.1  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7334  hypothetical protein  30.3 
 
 		 317 aa  74.3  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0063  peptidoglycan-binding LysM  44.35 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0180593  normal  0.117773 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8336  Beta-lactamase class A-like protein  27.56 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2311  putative secreted protein  32.54 
 
 		 316 aa  62.8  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4013  peptidoglycan-binding LysM  38.84 
 
 		 203 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0332681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0014  glycoside hydrolase family 18  58.7 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2729  peptidase M23B  52.17 
 
 		 389 aa  57  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.8886 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1712  beta-lactamase  27.11 
 
 		 576 aa  56.6  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  52.27 
 
 		 620 aa  56.6  0.0000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1800  peptidase M23B  36.54 
 
 		 412 aa  56.2  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0541473  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1147  putative beta-lactamase  28.77 
 
 		 423 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0017  glycoside hydrolase family 18  57.78 
 
 		 428 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350058  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1825  Peptidoglycan-binding LysM  43.18 
 
 		 128 aa  54.7  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07930  cell wall hydrolase SleB  40.58 
 
 		 310 aa  54.3  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1838  peptidoglycan-binding LysM  32.5 
 
 		 443 aa  53.9  0.000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.858327  unclonable  0.000000000675364 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2191  putative alanine rich lipoprotein LppW  28.23 
 
 		 312 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0244212  normal  0.331849 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2634  peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 		 302 aa  53.5  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.258799 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2149  Slt family transglycosylase  25.41 
 
 		 442 aa  53.5  0.000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.20197  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  38.96 
 
 		 727 aa  53.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  43.75 
 
 		 546 aa  53.1  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  38.96 
 
 		 727 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3876  beta-lactamase  25 
 
 		 468 aa  52.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0411  Lytic transglycosylase catalytic  48.98 
 
 		 447 aa  52.4  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000674118  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1069  peptidoglycan-binding LysM  50.98 
 
 		 168 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2401  peptidase M23B  46.3 
 
 		 297 aa  50.8  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0953  lytic transglycosylase, catalytic  48.84 
 
 		 556 aa  51.2  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0491  putative beta-lactamase protein  32 
 
 		 440 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  41.77 
 
 		 301 aa  50.4  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5916  beta-lactamase  30.12 
 
 		 310 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.545883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0884  M24/M37 family peptidase  37.14 
 
 		 427 aa  50.4  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5344  hypothetical protein  25.41 
 
 		 281 aa  50.1  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1767  peptidase M23B  42.59 
 
 		 465 aa  50.1  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1207  5'-nucleotidase domain-containing protein  43.86 
 
 		 596 aa  49.7  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1435  Beta-lactamase  27.27 
 
 		 295 aa  49.7  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0280  Beta-lactamase  26.82 
 
 		 353 aa  49.7  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0888  M24/M37 family peptidase  37.14 
 
 		 427 aa  49.7  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5336  putative alanine rich lipoprotein LppW  29.17 
 
 		 310 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5425  putative alanine rich lipoprotein LppW  29.17 
 
 		 310 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2920  lytic transglycosylase, catalytic  45.83 
 
 		 587 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.654046 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1913  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  37.5 
 
 		 298 aa  49.3  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0182  Peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 		 187 aa  49.3  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0026  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase  40 
 
 		 495 aa  48.5  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.250795  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5715  putative alanine rich lipoprotein LppW  29.45 
 
 		 310 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4171  putative alanine rich lipoprotein LppW  29.94 
 
 		 312 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0425  peptidoglycan-binding LysM  49.06 
 
 		 159 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00647142  normal  0.149845 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1583  lytic transglycosylase, catalytic  48.08 
 
 		 1079 aa  48.5  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000168341  normal  0.0166212 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2012  peptidoglycan-binding LysM  40.7 
 
 		 201 aa  48.9  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.340695  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0821  Peptidoglycan-binding LysM  41.79 
 
 		 164 aa  48.5  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0727806 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1945  lytic transglycosylase  53.7 
 
 		 445 aa  48.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106918  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1954  NLP/P60 protein  43.18 
 
 		 384 aa  48.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4463  Lytic transglycosylase catalytic  34.38 
 
 		 498 aa  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.689594  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1571  Lytic transglycosylase catalytic  29.27 
 
 		 539 aa  48.1  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.55441  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0697  putative beta-lactamase  22.76 
 
 		 357 aa  47.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1112  lytic transglycosylase, catalytic  35.48 
 
 		 1021 aa  47.8  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0269179  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13740  soluble lytic murein transglycosylase-like protein  39.66 
 
 		 390 aa  47.8  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1216  NLP/P60 protein  39.13 
 
 		 212 aa  47.8  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000177513  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2339  peptidase M23B  48.89 
 
 		 438 aa  47.8  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2218  Lytic transglycosylase catalytic  52.27 
 
 		 618 aa  47.4  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.70593 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.23 
 
 		 327 aa  47.4  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.19 
 
 		 422 aa  47.4  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3112  peptidase M23B  38.46 
 
 		 633 aa  47.4  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.233689 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1585  hypothetical protein  30.9 
 
 		 297 aa  47.4  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.644243  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0521  LysM/M23 peptidase  47.73 
 
 		 397 aa  47  0.0006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.939953  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2728  Lytic transglycosylase catalytic  43.18 
 
 		 547 aa  46.6  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2522  peptidase M23B  48.89 
 
 		 464 aa  47  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158439  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1777  M24/M37 family peptidase  34.48 
 
 		 347 aa  47  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193193  normal  0.0207649 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3005  peptidoglycan-binding LysM  45.45 
 
 		 423 aa  47  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000564074  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0071  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  33.33 
 
 		 303 aa  47  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.616993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4774  beta-lactamase  29.84 
 
 		 442 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167145 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6909  Mannosyl-glycoproteinendo-beta-N- acetylglucosami dase  30.21 
 
 		 619 aa  47  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.490682  normal  0.152044 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1273  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  42.22 
 
 		 1001 aa  46.6  0.0008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000430428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1608  beta-lactamase  35.19 
 
 		 425 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2753  LysM/M23/M37 peptidase  47.92 
 
 		 363 aa  46.2  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1634  beta-lactamase  29.52 
 
 		 425 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.54925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2162  MltD domain-containing protein  40 
 
 		 515 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000015187  normal  0.0463947 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41090  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  47.37 
 
 		 534 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11320  Peptidoglycan-binding LysM  45.83 
 
 		 173 aa  45.8  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00223945  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2798  cell wall hydrolase, SleB  38.36 
 
 		 277 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2833  hypothetical protein  26.4 
 
 		 253 aa  46.2  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.13197 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30927  predicted protein  43.18 
 
 		 285 aa  46.2  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3484  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  51.06 
 
 		 515 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0499239  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  31.86 
 
 		 733 aa  46.2  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0827  Peptidase M23  37.33 
 
 		 251 aa  45.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1297  LysM/M23/M37 peptidase  40.91 
 
 		 301 aa  45.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000265037  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  52.27 
 
 		 544 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  32.17 
 
 		 751 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1516  peptidase M23B  43.28 
 
 		 367 aa  45.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15311  putative beta-lactamase  23.58 
 
 		 357 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.709796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5325  hypothetical protein  25.87 
 
 		 253 aa  45.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02660  hypothetical protein  37.33 
 
 		 251 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002769  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  40.54 
 
 		 527 aa  45.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0709625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>