281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0821 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0821  Peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 164 aa  328  2e-89  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0727806 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0063  peptidoglycan-binding LysM  30.86 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0180593  normal  0.117773 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  69.77 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0654  peptidoglycan-binding LysM:Lytic transglycosylase, catalytic (SLT family)  33.66 
 
 		 383 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0645436  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4013  peptidoglycan-binding LysM  29.41 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0332681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1694  peptidoglycan-binding LysM  54.9 
 
 		 444 aa  56.6  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.17683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2635  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.61 
 
 		 442 aa  56.6  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000028113  unclonable  0.00000000000694269 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1171  peptidase M23B  46.97 
 
 		 509 aa  56.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816034  normal  0.264871 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1982  LysM domain-containing protein  53.06 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  55.1 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2662  lipoprotein  47.17 
 
 		 538 aa  54.7  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0792091  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1800  peptidase M23B  39.5 
 
 		 412 aa  54.7  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0541473  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1413  peptidoglycan-binding LysM  53.19 
 
 		 323 aa  54.3  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00299984  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5743  peptidoglycan-binding LysM  61.36 
 
 		 571 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.538891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3283  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.26 
 
 		 476 aa  53.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000101703  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0411  Lytic transglycosylase catalytic  41.54 
 
 		 447 aa  53.9  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000674118  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  31.75 
 
 		 620 aa  53.5  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2034  rare lipoprotein A  54.55 
 
 		 168 aa  53.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3484  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  50 
 
 		 515 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0499239  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0147  cell wall hydrolase  54.35 
 
 		 265 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2218  Lytic transglycosylase catalytic  47.17 
 
 		 618 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.70593 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0521  LysM/M23 peptidase  33.06 
 
 		 397 aa  53.1  0.000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.939953  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1299  cell wall hydrolase SleB  42.25 
 
 		 216 aa  52.4  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420178 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1429  cell wall hydrolase, SleB  52.17 
 
 		 267 aa  52  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000499844  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  45.45 
 
 		 546 aa  52.4  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 		 544 aa  52.4  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0459  putative Signal recognition particle protein (Fifty-four-like protein)  56.52 
 
 		 403 aa  52.4  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  56.25 
 
 		 341 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 733 aa  52.4  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3314  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  41.82 
 
 		 447 aa  51.6  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000664916  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0595  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.26 
 
 		 462 aa  51.6  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000955274  hitchhiker  0.0000000140637 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3435  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.26 
 
 		 462 aa  51.6  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000801055  normal  0.0458053 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0555  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.36 
 
 		 473 aa  51.6  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000230448  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0625  MltD domain-containing protein  54.55 
 
 		 483 aa  51.2  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0652  MltD domain-containing protein  54.55 
 
 		 483 aa  51.2  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3896  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.36 
 
 		 473 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000116248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0648  MLTD_N domain protein  54.55 
 
 		 483 aa  51.2  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3713  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.36 
 
 		 473 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000484801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3770  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.36 
 
 		 473 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000747673  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3737  MltD domain-containing protein  54.55 
 
 		 483 aa  51.2  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  54 
 
 		 271 aa  50.4  0.000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  54 
 
 		 271 aa  50.8  0.000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0305  Lytic transglycosylase catalytic  52.08 
 
 		 440 aa  50.4  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4173  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  48.89 
 
 		 439 aa  50.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3974  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50.94 
 
 		 270 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000260277  unclonable  0.000000000113169 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1306  CHAP domain-containing protein  46.43 
 
 		 372 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.387302  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2055  peptidoglycan-binding LysM  53.06 
 
 		 333 aa  50.4  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000227262  normal  0.0328069 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3414  MltD domain-containing protein  53.33 
 
 		 474 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.387896 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0538  MltD domain-containing protein  54.55 
 
 		 474 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2755  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  51.02 
 
 		 581 aa  50.4  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00949544  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1331  CHAP domain-containing protein  46.43 
 
 		 372 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.745429  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3584  MltD domain-containing protein  54.55 
 
 		 474 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1604  M24/M37 family peptidase  37.5 
 
 		 204 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000000454274  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4017  Slt family transglycosylase  54.55 
 
 		 477 aa  50.1  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0883  peptidase M23B  48 
 
 		 278 aa  49.3  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3208  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  46.67 
 
 		 455 aa  50.1  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058641  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03214  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  40 
 
 		 528 aa  49.7  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  37.5 
 
 		 324 aa  48.9  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03310  Peptidoglycan-binding LysM  55.56 
 
 		 523 aa  48.9  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1389  M24/M37 family peptidase  40.74 
 
 		 204 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000798303  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1534  peptidase, M23/M37 family  40.74 
 
 		 204 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000161202  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1500  M23/37 family peptidase  40.74 
 
 		 204 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000118576  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3811  peptidase, M23/M37 family  40.74 
 
 		 204 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000746797  unclonable  9.38185e-26 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0889  LysM domain-containing protein  49.09 
 
 		 253 aa  48.9  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000446725 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2339  peptidase M23B  50 
 
 		 438 aa  48.9  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002769  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  30 
 
 		 527 aa  48.9  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0709625  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1572  peptidase, M23/M37 family  35.71 
 
 		 204 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.42945e-48 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1362  cell wall endopeptidase  35.71 
 
 		 204 aa  48.5  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.83171e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1361  cell wall endopeptidase  35.71 
 
 		 204 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000286273  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3257  lytic transglycosylase, catalytic  52.27 
 
 		 471 aa  48.5  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0894  cell wall hydrolase, SleB  39.24 
 
 		 235 aa  48.5  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3231  Peptidoglycan-binding LysM  52.17 
 
 		 390 aa  48.5  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0309569 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1640  peptidase, M23/M37 family  35.71 
 
 		 204 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000676143  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2798  cell wall hydrolase, SleB  50 
 
 		 277 aa  48.1  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1855  Peptidoglycan-binding LysM  41.79 
 
 		 414 aa  48.1  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  47.92 
 
 		 301 aa  47.8  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  47.92 
 
 		 271 aa  48.1  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2239  MltD domain-containing protein  39.06 
 
 		 515 aa  47.8  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000290674  normal  0.325041 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11320  Peptidoglycan-binding LysM  44.9 
 
 		 173 aa  48.1  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00223945  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  47.73 
 
 		 797 aa  47.8  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2162  MltD domain-containing protein  39.06 
 
 		 515 aa  47.8  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000015187  normal  0.0463947 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1537  lytic transglycosylase, catalytic  46.81 
 
 		 580 aa  47.8  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.324928  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3656  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  48.89 
 
 		 593 aa  47.4  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106561  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  54.76 
 
 		 216 aa  47.8  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0139  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  53.33 
 
 		 451 aa  47.4  0.00008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.518176 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1775  MltD domain-containing protein  39.06 
 
 		 514 aa  47.4  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000157284  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3022  NLP/P60 protein  47.73 
 
 		 289 aa  47.4  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0498  Lytic transglycosylase catalytic  51.11 
 
 		 527 aa  47.4  0.00009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0702  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  48.89 
 
 		 631 aa  47.4  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00039621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1767  peptidase M23B  45.1 
 
 		 465 aa  47.4  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3802  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  48.89 
 
 		 637 aa  47.4  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0514476  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1542  lysM domain protein  38.98 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.001251  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1612  lysM domain-containing protein  38.98 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000378837  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0794  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  44.44 
 
 		 440 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345459 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  46.81 
 
 		 727 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3724  cell wall hydrolase/autolysin  35.94 
 
 		 557 aa  47  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0816524  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0428  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  48.08 
 
 		 597 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000317907  hitchhiker  0.000000852685 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41090  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  45.65 
 
 		 534 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2370  MltD domain-containing protein  39.06 
 
 		 515 aa  47  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000191622  normal  0.0274164 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15830  soluble lytic murein transglycosylase-like protein  55.56 
 
 		 414 aa  47  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103964  normal  0.0951382 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>