More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2739 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  100 
 
 		 216 aa  441  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  44.86 
 
 		 208 aa  171  9e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  43.59 
 
 		 217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1247  putative cell-wall associated endopeptidase  47.34 
 
 		 257 aa  163  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  44.68 
 
 		 285 aa  161  6e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  44.88 
 
 		 255 aa  158  5e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  47.37 
 
 		 265 aa  145  5e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  40.91 
 
 		 298 aa  143  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1554  NLP/P60  37.5 
 
 		 208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.68889  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  52.14 
 
 		 333 aa  132  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0791  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)-like  34.76 
 
 		 221 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1274  NLP/P60 protein  49.11 
 
 		 207 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.951335  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  46.56 
 
 		 150 aa  126  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  47.01 
 
 		 391 aa  123  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  49.11 
 
 		 188 aa  122  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  40.61 
 
 		 303 aa  122  3e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  38.66 
 
 		 301 aa  122  4e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  49.57 
 
 		 150 aa  122  6e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  48.46 
 
 		 424 aa  121  9e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  39.8 
 
 		 341 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  33.48 
 
 		 342 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1344  NLP/P60 protein  47.86 
 
 		 207 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  37.5 
 
 		 370 aa  119  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  47.66 
 
 		 257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0897  NLP/P60 family protein  43.15 
 
 		 231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.624146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3244  putative outer membrane lipoprotein  44.72 
 
 		 191 aa  118  6e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0124301 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  34.4 
 
 		 342 aa  118  7e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1652  NLP/P60 protein  43.42 
 
 		 178 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  32.3 
 
 		 346 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  46.03 
 
 		 274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  32.58 
 
 		 342 aa  116  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2431  putative outer membrane lipoprotein  47.01 
 
 		 191 aa  115  5e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2476  NLP/P60 protein  39.44 
 
 		 214 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.188506  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  40.49 
 
 		 319 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0388  NLP/P60  42.65 
 
 		 170 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.815605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1956  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 296 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  40.56 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3648  NLP/P60 protein  47.97 
 
 		 391 aa  113  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2707  putative outer membrane lipoprotein  43.09 
 
 		 194 aa  112  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  31.98 
 
 		 341 aa  112  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2784  putative outer membrane lipoprotein  43.09 
 
 		 194 aa  112  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  47.62 
 
 		 223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2420  NLP/P60 protein  43.75 
 
 		 207 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1501  putative outer membrane lipoprotein  43.09 
 
 		 172 aa  112  5e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  47.62 
 
 		 234 aa  112  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  36.63 
 
 		 338 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  45.9 
 
 		 532 aa  110  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4127  NLP/P60 protein  44.53 
 
 		 532 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  44.62 
 
 		 192 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  46.83 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  46.83 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1018  NLP/P60 protein  45.19 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.121174  normal  0.0409551 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  46.83 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1112  NLP/P60 protein  45.19 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.893499 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  46.83 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  44.76 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  46.83 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  46.83 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  46.83 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02105  predicted peptidase, outer membrane lipoprotein  43.9 
 
 		 188 aa  109  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1482  NLP/P60 protein  43.9 
 
 		 188 aa  109  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736883  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3313  putative outer membrane lipoprotein  43.9 
 
 		 188 aa  109  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0116683  normal  0.115135 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0783  putative outer membrane lipoprotein  43.9 
 
 		 188 aa  109  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2473  putative outer membrane lipoprotein  43.9 
 
 		 188 aa  109  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.303091  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2313  putative outer membrane lipoprotein  43.9 
 
 		 188 aa  109  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.871525  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2324  putative outer membrane lipoprotein  43.9 
 
 		 188 aa  109  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669952 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1472  putative outer membrane lipoprotein  43.9 
 
 		 188 aa  109  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000135569  normal  0.0170642 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02064  hypothetical protein  43.9 
 
 		 188 aa  109  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2091  NLP/P60 protein  44.62 
 
 		 192 aa  109  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.315099  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2771  putative outer membrane lipoprotein  42.74 
 
 		 189 aa  109  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.805322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  46.83 
 
 		 224 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3056  NLP/P60 protein  31.22 
 
 		 347 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000688808  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1637  NLP/P60  44.8 
 
 		 226 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58461  normal  0.048116 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2142  NLP/P60  46.15 
 
 		 226 aa  107  9.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0634754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2125  NLP/P60  51.82 
 
 		 228 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839892  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  39.31 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  44.63 
 
 		 232 aa  106  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2520  NLP/P60 family protein  46.02 
 
 		 365 aa  107  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.509627  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  40.38 
 
 		 224 aa  106  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0781  NLP/P60 protein  33.76 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  46.03 
 
 		 223 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2149  NLP/P60 protein  46.02 
 
 		 365 aa  107  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000521128  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  41.35 
 
 		 205 aa  106  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4200  NLP/P60 protein  41.09 
 
 		 156 aa  107  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  43.44 
 
 		 183 aa  106  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  46.03 
 
 		 223 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  46.03 
 
 		 223 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  46.03 
 
 		 223 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2830  NLP/P60 protein  42.06 
 
 		 220 aa  106  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.704353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  41.27 
 
 		 476 aa  106  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2454  putative outer membrane lipoprotein  34.3 
 
 		 190 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00195047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2565  putative outer membrane lipoprotein  34.3 
 
 		 190 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.159761  hitchhiker  0.000144355 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2451  putative outer membrane lipoprotein  34.3 
 
 		 190 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000518421 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2335  putative outer membrane lipoprotein  42.28 
 
 		 191 aa  105  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  41.35 
 
 		 193 aa  105  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2017  NLP/P60 protein  48.76 
 
 		 536 aa  105  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.474847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2639  NLP/P60 protein  31.86 
 
 		 349 aa  105  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1646  putative outer membrane lipoprotein  41.46 
 
 		 194 aa  105  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79512  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1917  putative outer membrane lipoprotein  41.46 
 
 		 193 aa  105  7e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3968  NLP/P60 protein  42.31 
 
 		 211 aa  104  9e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12193  normal  0.0821241 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>