More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1652 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1652  NLP/P60 protein  100 
 
 		 178 aa  359  1e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0747  NLP/P60 protein  68.33 
 
 		 298 aa  178  2.9999999999999997e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000792578  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1956  NLP/P60 protein  66.41 
 
 		 296 aa  170  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  52.46 
 
 		 319 aa  117  6e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  48.2 
 
 		 370 aa  117  7e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  43.42 
 
 		 216 aa  117  9e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  50 
 
 		 265 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  46.72 
 
 		 150 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  43.85 
 
 		 424 aa  111  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1274  NLP/P60 protein  38.46 
 
 		 207 aa  111  5e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.951335  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  41.18 
 
 		 235 aa  109  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  37.78 
 
 		 255 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  48.31 
 
 		 257 aa  107  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  43.44 
 
 		 150 aa  108  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1679  NLP/P60 protein  44.26 
 
 		 210 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0781  NLP/P60 protein  44.2 
 
 		 260 aa  107  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  41.22 
 
 		 232 aa  107  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  35.98 
 
 		 188 aa  105  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0791  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)-like  38.41 
 
 		 221 aa  105  5e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  45 
 
 		 181 aa  104  7e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  42.96 
 
 		 274 aa  103  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  40.56 
 
 		 183 aa  103  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  36.16 
 
 		 198 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  41.94 
 
 		 285 aa  102  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1344  NLP/P60 protein  34.27 
 
 		 207 aa  102  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2476  NLP/P60 protein  38.97 
 
 		 214 aa  102  4e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.188506  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1267  NLP/P60 protein  40.26 
 
 		 214 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  41.94 
 
 		 177 aa  100  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4049  NLP/P60 protein  40.26 
 
 		 212 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  42.02 
 
 		 476 aa  99.4  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2771  putative outer membrane lipoprotein  36.25 
 
 		 189 aa  99.8  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.805322  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1669  NLP/P60 protein  44 
 
 		 214 aa  99  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  45.3 
 
 		 173 aa  99.4  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  42.37 
 
 		 303 aa  99  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1637  NLP/P60  43.55 
 
 		 226 aa  98.2  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58461  normal  0.048116 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1227  NLP/P60 protein  39.87 
 
 		 214 aa  98.2  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0897  NLP/P60 family protein  37.27 
 
 		 231 aa  97.4  9e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.624146  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02105  predicted peptidase, outer membrane lipoprotein  35.62 
 
 		 188 aa  97.1  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1482  NLP/P60 protein  35.62 
 
 		 188 aa  97.1  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736883  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1472  putative outer membrane lipoprotein  35.62 
 
 		 188 aa  97.1  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000135569  normal  0.0170642 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02064  hypothetical protein  35.62 
 
 		 188 aa  97.1  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2324  putative outer membrane lipoprotein  35.62 
 
 		 188 aa  97.1  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669952 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2451  putative outer membrane lipoprotein  36.25 
 
 		 190 aa  97.1  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000518421 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3313  putative outer membrane lipoprotein  35.62 
 
 		 188 aa  97.1  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0116683  normal  0.115135 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0783  putative outer membrane lipoprotein  35.62 
 
 		 188 aa  97.1  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2454  putative outer membrane lipoprotein  36.25 
 
 		 190 aa  97.1  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00195047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2313  putative outer membrane lipoprotein  35.62 
 
 		 188 aa  97.1  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.871525  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2473  putative outer membrane lipoprotein  35.62 
 
 		 188 aa  97.1  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.303091  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  37.04 
 
 		 205 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2565  putative outer membrane lipoprotein  36.25 
 
 		 190 aa  97.1  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.159761  hitchhiker  0.000144355 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  42.03 
 
 		 298 aa  96.7  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1705  NLP/P60 family protein  42.74 
 
 		 242 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0751  NLP/P60 protein  38.57 
 
 		 173 aa  96.3  2e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2408  putative outer membrane lipoprotein  36.25 
 
 		 147 aa  96.3  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210623 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2363  putative outer membrane lipoprotein  36.25 
 
 		 147 aa  96.3  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000243067  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1747  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 174 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  43.55 
 
 		 193 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  41.46 
 
 		 205 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3133  NLP/P60 protein  39.07 
 
 		 454 aa  95.5  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000296935  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  36.36 
 
 		 230 aa  95.5  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  40 
 
 		 333 aa  95.1  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1746  NLP/P60 protein  37.35 
 
 		 203 aa  95.1  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  41.8 
 
 		 224 aa  95.1  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1247  putative cell-wall associated endopeptidase  37.9 
 
 		 257 aa  94.7  5e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  39.5 
 
 		 391 aa  94.7  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3244  putative outer membrane lipoprotein  36.31 
 
 		 191 aa  94.7  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0124301 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  46.53 
 
 		 208 aa  94.4  8e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3684  NLP/P60  41.26 
 
 		 242 aa  94.4  8e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49515  hitchhiker  0.00130241 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  40.46 
 
 		 295 aa  94.4  9e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  43.64 
 
 		 1048 aa  94  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  44 
 
 		 450 aa  94  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  40.98 
 
 		 223 aa  93.6  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2149  NLP/P60 protein  39.02 
 
 		 365 aa  94  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000521128  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  40.98 
 
 		 223 aa  93.6  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2520  NLP/P60 family protein  39.02 
 
 		 365 aa  94  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.509627  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  40.98 
 
 		 223 aa  93.6  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  40.16 
 
 		 224 aa  92.8  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4127  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 532 aa  92.8  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0388  NLP/P60  36.69 
 
 		 170 aa  93.2  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.815605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2819  NLP/P60 protein  42.24 
 
 		 159 aa  92.8  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1008  cell wall-associated hydrolase  42.34 
 
 		 197 aa  93.2  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000147737  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2446  NLP/P60 protein  40.58 
 
 		 208 aa  92  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0173  NlpC/P60 family protein  34.34 
 
 		 458 aa  92.4  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2195  NLP/P60 protein  44.26 
 
 		 168 aa  92.4  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 208 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  40.16 
 
 		 223 aa  92  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4554  NLP/P60 protein  39.05 
 
 		 286 aa  92  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  40.16 
 
 		 223 aa  92  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2387  NLP/P60 protein  40.17 
 
 		 283 aa  92  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.05451  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  41.13 
 
 		 208 aa  91.7  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2784  putative outer membrane lipoprotein  36.94 
 
 		 194 aa  91.3  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  40.71 
 
 		 342 aa  91.3  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  41.13 
 
 		 208 aa  91.3  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  40.48 
 
 		 532 aa  91.7  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2707  putative outer membrane lipoprotein  36.94 
 
 		 194 aa  91.3  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  36.96 
 
 		 246 aa  91.7  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  41.03 
 
 		 181 aa  91.3  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5044  NLP/P60 family protein  41.13 
 
 		 226 aa  91.3  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.982871  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  42.61 
 
 		 217 aa  91.3  7e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  39.34 
 
 		 234 aa  91.3  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>