More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3133 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_3133  NLP/P60 protein  100 
 
 		 454 aa  925    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000296935  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  61.59 
 
 		 450 aa  560  1e-158  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1246  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.85 
 
 		 508 aa  172  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2188  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  27.87 
 
 		 549 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1886  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.56 
 
 		 635 aa  153  5.9999999999999996e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1440  SpoIID/LytB domain-containing protein  33.05 
 
 		 762 aa  149  7e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  53.6 
 
 		 265 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  46.72 
 
 		 285 aa  123  6e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1959  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.28 
 
 		 487 aa  123  8e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315261  normal  0.0108797 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  49.17 
 
 		 391 aa  122  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  51.69 
 
 		 150 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  39.81 
 
 		 232 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  51.79 
 
 		 274 aa  116  8.999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  49.57 
 
 		 150 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0173  NlpC/P60 family protein  46.49 
 
 		 458 aa  114  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  48.28 
 
 		 181 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  47.41 
 
 		 333 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  48.82 
 
 		 298 aa  110  5e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5027  NLP/P60 protein  49.14 
 
 		 578 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000376094  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  50.89 
 
 		 173 aa  108  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  48.31 
 
 		 223 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  46.15 
 
 		 224 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5603  putative cell wall hydrolase  48.28 
 
 		 582 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000253963  unclonable  5.14343e-25 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  48.31 
 
 		 223 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  48.31 
 
 		 234 aa  107  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  48.72 
 
 		 476 aa  107  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  47.46 
 
 		 224 aa  106  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4988  NLP/P60 protein  46.09 
 
 		 448 aa  106  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1493  NLP/P60 protein  48.72 
 
 		 418 aa  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000786314  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  46.61 
 
 		 223 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  48.31 
 
 		 218 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  48.31 
 
 		 234 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  48.31 
 
 		 234 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  48.31 
 
 		 234 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  46.61 
 
 		 221 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  48.31 
 
 		 218 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  45.3 
 
 		 223 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  45.3 
 
 		 223 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  45.3 
 
 		 223 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3648  NLP/P60 protein  47.41 
 
 		 391 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  48.31 
 
 		 218 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  48.31 
 
 		 218 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3731  NLP/P60 protein  45.69 
 
 		 409 aa  104  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000196287  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5357  putative cell wall hydrolase  46.55 
 
 		 577 aa  104  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000860779  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  46.61 
 
 		 221 aa  104  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  47.5 
 
 		 193 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  43.8 
 
 		 216 aa  103  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  29.23 
 
 		 372 aa  103  6e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5283  putative cell wall endopeptidase, NlpC/P60 family  45.69 
 
 		 436 aa  103  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000121595 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5043  endopeptidase lytE  45.69 
 
 		 436 aa  103  9e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5427  endopeptidase lytE  45.69 
 
 		 436 aa  103  9e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101585  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2149  NLP/P60 protein  45.69 
 
 		 365 aa  102  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000521128  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5353  enterotoxin  45.69 
 
 		 582 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000381193  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3684  NLP/P60  47.79 
 
 		 242 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49515  hitchhiker  0.00130241 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  42.64 
 
 		 255 aa  102  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0388  NLP/P60  42.74 
 
 		 170 aa  102  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.815605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2520  NLP/P60 family protein  45.69 
 
 		 365 aa  102  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.509627  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33180  NLP/P60 family lipoprotein  46.9 
 
 		 205 aa  102  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.38174  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  48.28 
 
 		 205 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3768  NLP/P60 protein  46.43 
 
 		 575 aa  102  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000116427  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5644  putative cell wall endopeptidase, NlpC/P60 family  43.22 
 
 		 476 aa  102  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000146181  decreased coverage  1.76624e-19 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  43.86 
 
 		 246 aa  102  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  45.83 
 
 		 257 aa  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1960  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.18 
 
 		 360 aa  102  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  51.3 
 
 		 177 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4915  cell wall hydrolase; N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  47.32 
 
 		 580 aa  101  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  9.30619e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4930  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase; enterotoxin  47.32 
 
 		 579 aa  101  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000272032  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  44.64 
 
 		 246 aa  100  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  43.97 
 
 		 217 aa  100  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4179  putative lipoprotein  47.83 
 
 		 197 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000450162  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48790  putative lipoprotein  47.83 
 
 		 177 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.006644  hitchhiker  0.0000000144437 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  41.18 
 
 		 342 aa  100  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1670  NLP/P60 protein  50.43 
 
 		 177 aa  100  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1016  NlpC/P60 family protein  34.78 
 
 		 446 aa  100  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000775164  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  48.7 
 
 		 181 aa  100  8e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2365  NLP/P60:sporulation-related protein  38.76 
 
 		 266 aa  99.8  8e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2037  NLP/P60 family protein  45.9 
 
 		 426 aa  99.8  9e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000532667  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3369  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  45.9 
 
 		 432 aa  99.8  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000232864  unclonable  2.00404e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2059  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  45.9 
 
 		 426 aa  99.8  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000850665  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1828  lipoprotein, NLP/P60 family  45.76 
 
 		 188 aa  99.4  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.996382  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0427  NLP/P60 protein  42.42 
 
 		 177 aa  99  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00285469  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1228  NLP/P60 protein  50.43 
 
 		 177 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5406  putative cell wall hydrolase  46.43 
 
 		 582 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3683  NLP/P60  48.7 
 
 		 181 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1637  NLP/P60  48.25 
 
 		 226 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58461  normal  0.048116 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1959  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  45.9 
 
 		 413 aa  99  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  41.86 
 
 		 208 aa  99  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1247  putative cell-wall associated endopeptidase  37.42 
 
 		 257 aa  99.4  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2195  NLP/P60 protein  43.1 
 
 		 168 aa  99  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1504  NLP/P60 protein  45.76 
 
 		 188 aa  99.4  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0399794  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1250  NLP/P60 protein  42.11 
 
 		 248 aa  99  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000552171  normal  0.790948 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1705  NLP/P60 family protein  46.9 
 
 		 242 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1100  NLP/P60 protein  43.59 
 
 		 215 aa  99  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5314  putative cell wall endopeptidase, NlpC/P60 family  43.1 
 
 		 473 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00085857  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  35.33 
 
 		 342 aa  98.6  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2197  NLP/P60 protein  40.83 
 
 		 273 aa  98.6  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.369734  hitchhiker  0.00000685507 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5324  enterotoxin  46.43 
 
 		 598 aa  99  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.216360000000001e-60 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  43.86 
 
 		 198 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1821  NLP/P60 protein  47.01 
 
 		 430 aa  99  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000102093  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  43.86 
 
 		 177 aa  99  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>