More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_48800 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  97.41 
 
 		 193 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1637  NLP/P60  59.7 
 
 		 226 aa  237  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58461  normal  0.048116 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1669  NLP/P60 protein  56.59 
 
 		 214 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1267  NLP/P60 protein  56.59 
 
 		 214 aa  225  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1227  NLP/P60 protein  56.65 
 
 		 214 aa  224  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33180  NLP/P60 family lipoprotein  57.81 
 
 		 205 aa  223  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.38174  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4049  NLP/P60 protein  56.16 
 
 		 212 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3684  NLP/P60  53.43 
 
 		 242 aa  221  7e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49515  hitchhiker  0.00130241 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1746  NLP/P60 protein  58.46 
 
 		 203 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1705  NLP/P60 family protein  53.59 
 
 		 242 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  44.92 
 
 		 181 aa  159  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  45.13 
 
 		 173 aa  158  5e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  43.59 
 
 		 177 aa  155  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1638  NLP/P60  55.15 
 
 		 178 aa  153  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52996  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3683  NLP/P60  55.12 
 
 		 181 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1747  NLP/P60 protein  46.33 
 
 		 174 aa  150  8.999999999999999e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1670  NLP/P60 protein  54.62 
 
 		 177 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1228  NLP/P60 protein  54.62 
 
 		 177 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1268  NLP/P60 protein  53.85 
 
 		 177 aa  148  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.200264 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48790  putative lipoprotein  56.8 
 
 		 177 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.006644  hitchhiker  0.0000000144437 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4179  putative lipoprotein  56.8 
 
 		 197 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000450162  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  53.54 
 
 		 177 aa  141  7e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  53.54 
 
 		 198 aa  140  9e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0018  NLP/P60 protein  48.85 
 
 		 188 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2887  NLP/P60 protein  50 
 
 		 179 aa  131  7.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.171139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  48.89 
 
 		 150 aa  129  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01906  outer membrane lipoprotein  50.41 
 
 		 221 aa  125  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.211693  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  46.1 
 
 		 208 aa  124  9e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  43.75 
 
 		 208 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2888  NLP/P60 protein  49.29 
 
 		 234 aa  123  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215701  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  46.27 
 
 		 207 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0479  NLP/P60  45.97 
 
 		 225 aa  122  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1606  NLP/P60 protein  45.19 
 
 		 209 aa  122  5e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  46.21 
 
 		 208 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1659  hypothetical protein  45.19 
 
 		 209 aa  121  6e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.255203  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5044  NLP/P60 family protein  45.16 
 
 		 226 aa  121  9e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.982871  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01907  lipoprotein  48.84 
 
 		 133 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.324405  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  47.2 
 
 		 205 aa  119  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  41.07 
 
 		 192 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2091  NLP/P60 protein  41.42 
 
 		 192 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.315099  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  42.07 
 
 		 150 aa  118  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0992  hypothetical protein  48.33 
 
 		 170 aa  115  3e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.480266  normal  0.532227 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1605  NLP/P60 protein  41.18 
 
 		 279 aa  115  6e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1658  hypothetical protein  41.18 
 
 		 287 aa  115  6e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.110646  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02105  predicted peptidase, outer membrane lipoprotein  35.75 
 
 		 188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1482  NLP/P60 protein  35.75 
 
 		 188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736883  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02064  hypothetical protein  35.75 
 
 		 188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1472  putative outer membrane lipoprotein  35.75 
 
 		 188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000135569  normal  0.0170642 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0783  putative outer membrane lipoprotein  35.75 
 
 		 188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3313  putative outer membrane lipoprotein  35.75 
 
 		 188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0116683  normal  0.115135 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2324  putative outer membrane lipoprotein  35.75 
 
 		 188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669952 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1543  NlpC/P60 family protein  37.41 
 
 		 275 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.179042 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2473  putative outer membrane lipoprotein  35.75 
 
 		 188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.303091  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2313  putative outer membrane lipoprotein  35.75 
 
 		 188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.871525  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01625  predicted lipoprotein  37.41 
 
 		 271 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1985  NLP/P60 protein  37.41 
 
 		 271 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.778309  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01615  hypothetical protein  37.41 
 
 		 271 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2367  NlpC/P60 family protein  37.41 
 
 		 271 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00414236  normal  0.27776 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1974  NLP/P60 protein  37.41 
 
 		 271 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117191 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1868  NlpC/P60 family protein  37.41 
 
 		 271 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206609  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1734  NlpC/P60 family protein  37.41 
 
 		 271 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1852  NlpC/P60 family protein  37.41 
 
 		 271 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000302623  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2451  putative outer membrane lipoprotein  35.23 
 
 		 190 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000518421 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2565  putative outer membrane lipoprotein  35.23 
 
 		 190 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.159761  hitchhiker  0.000144355 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2454  putative outer membrane lipoprotein  35.23 
 
 		 190 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00195047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3244  putative outer membrane lipoprotein  34.54 
 
 		 191 aa  112  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0124301 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0001  NLP/P60 protein  46.46 
 
 		 160 aa  112  5e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.309085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1911  NlpC/P60 family protein  36.69 
 
 		 273 aa  111  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.569551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1602  NlpC/P60 family protein  36.69 
 
 		 273 aa  111  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1542  NlpC/P60 family protein  36.69 
 
 		 273 aa  111  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0237599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1742  NlpC/P60 family protein  36.69 
 
 		 273 aa  111  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000022854  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1528  NlpC/P60 family protein  36.69 
 
 		 273 aa  111  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0019  NLP/P60 protein  45.67 
 
 		 160 aa  111  9e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0865382  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3984  NLP/P60 protein  37.84 
 
 		 173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2771  putative outer membrane lipoprotein  36.27 
 
 		 189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.805322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  41.67 
 
 		 234 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2830  NLP/P60 protein  38.92 
 
 		 220 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.704353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1201  NLP/P60  44.09 
 
 		 169 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1792  NLP/P60 protein  42.74 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.851858  normal  0.0301658 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  42.47 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2519  cell wall-associated hydrolase-like protein  43.84 
 
 		 225 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  44.26 
 
 		 333 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0941  NLP/P60 family protein  46.77 
 
 		 159 aa  109  3e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.33367  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  44.85 
 
 		 224 aa  109  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5167  NLP/P60 family lipoprotein  38.71 
 
 		 364 aa  109  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0427  NLP/P60 protein  47.01 
 
 		 177 aa  109  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00285469  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2431  putative outer membrane lipoprotein  44.44 
 
 		 191 aa  109  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1407  NLP/P60 protein  37.17 
 
 		 369 aa  109  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.374528 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  46.56 
 
 		 274 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  43.65 
 
 		 183 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2197  NLP/P60 protein  38.58 
 
 		 273 aa  108  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.369734  hitchhiker  0.00000685507 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2291  NLP/P60 protein  45.16 
 
 		 242 aa  108  6e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  42.07 
 
 		 221 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  49.15 
 
 		 303 aa  108  7.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6213  NLP/P60  38.17 
 
 		 363 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1866  NLP/P60 protein  38.17 
 
 		 363 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  38.51 
 
 		 188 aa  108  8.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  45.97 
 
 		 476 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1890  NLP/P60 protein  38.17 
 
 		 363 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00780805  hitchhiker  0.0000000811276 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>