More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0001 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0019  NLP/P60 protein  99.38 
 
 		 160 aa  321  2e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0865382  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0001  NLP/P60 protein  100 
 
 		 160 aa  322  2e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.309085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0020  NLP/P60 protein  72.41 
 
 		 184 aa  205  3e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2733  NLP/P60 protein  65.36 
 
 		 190 aa  190  7e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0192428  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0741  NLP/P60  60.61 
 
 		 167 aa  186  8e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.128662  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3984  NLP/P60 protein  62.58 
 
 		 173 aa  186  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  52.76 
 
 		 173 aa  156  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2393  putative transmembrane lipoprotein  46.67 
 
 		 404 aa  147  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.951834  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6213  NLP/P60  46.47 
 
 		 363 aa  147  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1866  NLP/P60 protein  46.47 
 
 		 363 aa  147  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1890  NLP/P60 protein  46.47 
 
 		 363 aa  146  9e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00780805  hitchhiker  0.0000000811276 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1659  hypothetical protein  48.68 
 
 		 209 aa  146  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.255203  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1606  NLP/P60 protein  50 
 
 		 209 aa  146  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5167  NLP/P60 family lipoprotein  45.88 
 
 		 364 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  49.1 
 
 		 177 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1268  NLP/P60 protein  55.73 
 
 		 177 aa  144  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.200264 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1670  NLP/P60 protein  55.73 
 
 		 177 aa  143  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1397  NLP/P60 family lipoprotein  44.83 
 
 		 407 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.929375  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2408  NLP/P60 family lipoprotein  44.83 
 
 		 407 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.166866  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1160  NLP/P60 family lipoprotein  44.83 
 
 		 407 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.812731  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1887  NLP/P60 family lipoprotein  44.83 
 
 		 407 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.850579  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0009  NLP/P60 family lipoprotein  44.83 
 
 		 407 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30529  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2283  NlpC/P60 family lipoprotein  44.83 
 
 		 404 aa  143  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2244  NlpC/P60 family lipoprotein  44.83 
 
 		 404 aa  143  9e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0919  NLP/P60 protein  57.98 
 
 		 382 aa  143  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0475791  normal  0.21921 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1804  NLP/P60 protein  45.56 
 
 		 354 aa  143  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1228  NLP/P60 protein  57.38 
 
 		 177 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771322  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1250  NLP/P60 protein  49.37 
 
 		 248 aa  142  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000552171  normal  0.790948 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1794  NLP/P60 protein  56.67 
 
 		 418 aa  142  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435053  hitchhiker  0.00883906 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1407  NLP/P60 protein  44.38 
 
 		 369 aa  142  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.374528 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2887  NLP/P60 protein  57.26 
 
 		 179 aa  142  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.171139  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  44.97 
 
 		 181 aa  141  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1776  NLP/P60 protein  44.97 
 
 		 353 aa  141  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0427  NLP/P60 protein  53.79 
 
 		 177 aa  141  4e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00285469  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3683  NLP/P60  55.12 
 
 		 181 aa  140  8e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2186  NLP/P60 family lipoprotein  56.78 
 
 		 407 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1747  NLP/P60 protein  60.66 
 
 		 174 aa  138  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1314  lipoprotein transmembrane  47.17 
 
 		 258 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1638  NLP/P60  54.92 
 
 		 178 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52996  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1189  NLP/P60 protein  49.66 
 
 		 249 aa  136  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103363  normal  0.0364754 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4179  putative lipoprotein  56.56 
 
 		 197 aa  134  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000450162  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48790  putative lipoprotein  56.56 
 
 		 177 aa  134  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.006644  hitchhiker  0.0000000144437 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1999  NLP/P60  54.17 
 
 		 226 aa  130  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.762084  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01907  lipoprotein  54.84 
 
 		 133 aa  130  6e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.324405  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1112  NLP/P60 protein  37.64 
 
 		 215 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.893499 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1018  NLP/P60 protein  37.08 
 
 		 215 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.121174  normal  0.0409551 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1972  NLP/P60  52.5 
 
 		 212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107958  normal  0.172208 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  43.17 
 
 		 234 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  46.28 
 
 		 234 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  46.28 
 
 		 234 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  42.14 
 
 		 221 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  46.28 
 
 		 218 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  46.28 
 
 		 218 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  46.28 
 
 		 218 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  46.28 
 
 		 218 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  46.28 
 
 		 234 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  42.45 
 
 		 221 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  45.45 
 
 		 224 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  42.96 
 
 		 223 aa  124  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1665  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 194 aa  124  6e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  44.63 
 
 		 224 aa  123  9e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  45.45 
 
 		 223 aa  123  9e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  45.45 
 
 		 223 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  45.45 
 
 		 223 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  43.8 
 
 		 223 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2142  NLP/P60  44.63 
 
 		 226 aa  122  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0634754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  43.8 
 
 		 223 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2888  NLP/P60 protein  53.45 
 
 		 234 aa  122  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3968  NLP/P60 protein  43.44 
 
 		 211 aa  121  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12193  normal  0.0821241 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2125  NLP/P60  44.63 
 
 		 228 aa  120  9e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839892  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1201  NLP/P60  40.69 
 
 		 169 aa  117  9e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1177  putative transmembrane protein  34.05 
 
 		 222 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0196017  normal  0.188955 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3747  NLP/P60  40.28 
 
 		 166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.60725  normal  0.715068 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2166  NLP/P60 protein  35.59 
 
 		 194 aa  114  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343346  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  40.16 
 
 		 202 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  46.46 
 
 		 205 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  38.46 
 
 		 183 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2667  peptidace C40 NLP/P60  39.34 
 
 		 187 aa  111  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.411217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  41.48 
 
 		 208 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  40.44 
 
 		 207 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2830  NLP/P60 protein  40.16 
 
 		 220 aa  110  8.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.704353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  40.44 
 
 		 208 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33180  NLP/P60 family lipoprotein  42.06 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.38174  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1605  NLP/P60 protein  44.7 
 
 		 279 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  40.91 
 
 		 208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1658  hypothetical protein  44.7 
 
 		 287 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.110646  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0388  NLP/P60  41.53 
 
 		 170 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.815605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  45.67 
 
 		 193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2091  NLP/P60 protein  35.62 
 
 		 192 aa  107  5e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.315099  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01906  outer membrane lipoprotein  47.06 
 
 		 221 aa  107  7.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.211693  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1233  NLP/P60 protein  41.32 
 
 		 214 aa  107  9.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.783126  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0479  NLP/P60  43.07 
 
 		 225 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  35.62 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5044  NLP/P60 family protein  43.9 
 
 		 226 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.982871  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  37.6 
 
 		 205 aa  105  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4049  NLP/P60 protein  43.31 
 
 		 212 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1267  NLP/P60 protein  43.31 
 
 		 214 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1100  NLP/P60 protein  40.5 
 
 		 215 aa  105  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1669  NLP/P60 protein  42.06 
 
 		 214 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1227  NLP/P60 protein  42.06 
 
 		 214 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>