More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1233 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1233  NLP/P60 protein  100 
 
 		 214 aa  434  1e-121  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.783126  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1100  NLP/P60 protein  84.65 
 
 		 215 aa  371  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  45.15 
 
 		 234 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  45.15 
 
 		 234 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  45.15 
 
 		 234 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  48.19 
 
 		 224 aa  181  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  46.46 
 
 		 234 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  45.79 
 
 		 221 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  46.73 
 
 		 221 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  47.67 
 
 		 224 aa  179  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  49.22 
 
 		 223 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  49.22 
 
 		 223 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  49.22 
 
 		 223 aa  178  7e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  49.22 
 
 		 223 aa  177  8e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  56.29 
 
 		 218 aa  177  8e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  56.29 
 
 		 218 aa  177  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  56.29 
 
 		 218 aa  177  8e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  56.29 
 
 		 218 aa  177  8e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  49.22 
 
 		 223 aa  177  9e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2125  NLP/P60  53.29 
 
 		 228 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839892  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1112  NLP/P60 protein  52.56 
 
 		 215 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.893499 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  59.38 
 
 		 223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1018  NLP/P60 protein  52.56 
 
 		 215 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.121174  normal  0.0409551 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2142  NLP/P60  51.61 
 
 		 226 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0634754  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1177  putative transmembrane protein  42.86 
 
 		 222 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0196017  normal  0.188955 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  45.1 
 
 		 183 aa  148  5e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3968  NLP/P60 protein  47.1 
 
 		 211 aa  146  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12193  normal  0.0821241 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2100  NLP/P60  50.74 
 
 		 201 aa  145  6e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.995227  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1201  NLP/P60  53.72 
 
 		 169 aa  144  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2291  NLP/P60 protein  48.43 
 
 		 242 aa  143  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2667  peptidace C40 NLP/P60  47.92 
 
 		 187 aa  142  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.411217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  50.4 
 
 		 192 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  50.38 
 
 		 202 aa  140  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2091  NLP/P60 protein  50.4 
 
 		 192 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.315099  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0388  NLP/P60  47.58 
 
 		 170 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.815605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2519  cell wall-associated hydrolase-like protein  48.2 
 
 		 225 aa  137  8.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2830  NLP/P60 protein  46.56 
 
 		 220 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.704353  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2166  NLP/P60 protein  49.24 
 
 		 194 aa  134  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343346  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0919  NLP/P60 protein  47.69 
 
 		 382 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0475791  normal  0.21921 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1397  NLP/P60 family lipoprotein  43.21 
 
 		 407 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.929375  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2408  NLP/P60 family lipoprotein  43.21 
 
 		 407 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.166866  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2186  NLP/P60 family lipoprotein  42.94 
 
 		 407 aa  123  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2393  putative transmembrane lipoprotein  48.33 
 
 		 404 aa  123  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.951834  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2283  NlpC/P60 family lipoprotein  43.21 
 
 		 404 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2244  NlpC/P60 family lipoprotein  43.21 
 
 		 404 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1160  NLP/P60 family lipoprotein  43.21 
 
 		 407 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.812731  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1887  NLP/P60 family lipoprotein  43.21 
 
 		 407 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.850579  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0009  NLP/P60 family lipoprotein  43.21 
 
 		 407 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30529  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1250  NLP/P60 protein  44.96 
 
 		 248 aa  122  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000552171  normal  0.790948 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1794  NLP/P60 protein  48.33 
 
 		 418 aa  122  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435053  hitchhiker  0.00883906 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3747  NLP/P60  46.34 
 
 		 166 aa  121  8e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.60725  normal  0.715068 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1189  NLP/P60 protein  44.19 
 
 		 249 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103363  normal  0.0364754 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6213  NLP/P60  48.33 
 
 		 363 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1866  NLP/P60 protein  48.33 
 
 		 363 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1407  NLP/P60 protein  48.33 
 
 		 369 aa  119  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.374528 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1890  NLP/P60 protein  48.33 
 
 		 363 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00780805  hitchhiker  0.0000000811276 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5167  NLP/P60 family lipoprotein  41.72 
 
 		 364 aa  117  9e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1999  NLP/P60  44.8 
 
 		 226 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.762084  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1804  NLP/P60 protein  48.33 
 
 		 354 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1314  lipoprotein transmembrane  43.75 
 
 		 258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1776  NLP/P60 protein  47.5 
 
 		 353 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1669  NLP/P60 protein  43.45 
 
 		 214 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1972  NLP/P60  42.52 
 
 		 212 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107958  normal  0.172208 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1267  NLP/P60 protein  45.53 
 
 		 214 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4049  NLP/P60 protein  45.53 
 
 		 212 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  37.72 
 
 		 177 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  42.52 
 
 		 181 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1227  NLP/P60 protein  45.53 
 
 		 214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2888  NLP/P60 protein  46.88 
 
 		 234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  37.28 
 
 		 198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3683  NLP/P60  41.73 
 
 		 181 aa  113  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  42.31 
 
 		 173 aa  112  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2520  NLP/P60 family protein  46.34 
 
 		 365 aa  111  8.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.509627  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0992  hypothetical protein  46.96 
 
 		 170 aa  111  8.000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.480266  normal  0.532227 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2149  NLP/P60 protein  46.34 
 
 		 365 aa  111  8.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000521128  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  44.17 
 
 		 255 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1665  NLP/P60 protein  41.27 
 
 		 194 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1543  NlpC/P60 family protein  41.43 
 
 		 275 aa  109  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.179042 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01625  predicted lipoprotein  41.43 
 
 		 271 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1985  NLP/P60 protein  41.43 
 
 		 271 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.778309  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1747  NLP/P60 protein  41.54 
 
 		 174 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1974  NLP/P60 protein  41.43 
 
 		 271 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117191 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1868  NlpC/P60 family protein  41.43 
 
 		 271 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206609  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2367  NlpC/P60 family protein  41.43 
 
 		 271 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00414236  normal  0.27776 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1852  NlpC/P60 family protein  41.43 
 
 		 271 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000302623  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1734  NlpC/P60 family protein  41.43 
 
 		 271 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01615  hypothetical protein  41.43 
 
 		 271 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0479  NLP/P60  34.3 
 
 		 225 aa  108  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1637  NLP/P60  44.35 
 
 		 226 aa  108  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58461  normal  0.048116 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0018  NLP/P60 protein  39.34 
 
 		 188 aa  108  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2733  NLP/P60 protein  39.23 
 
 		 190 aa  108  9.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0192428  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5044  NLP/P60 family protein  33.53 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.982871  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0019  NLP/P60 protein  42.15 
 
 		 160 aa  107  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0865382  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1638  NLP/P60  36.76 
 
 		 178 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52996  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0427  NLP/P60 protein  39.55 
 
 		 177 aa  107  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00285469  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 150 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0001  NLP/P60 protein  41.32 
 
 		 160 aa  107  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.309085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1606  NLP/P60 protein  40.16 
 
 		 209 aa  106  3e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1659  hypothetical protein  40.16 
 
 		 209 aa  106  3e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.255203  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1792  NLP/P60 protein  38 
 
 		 256 aa  105  4e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.851858  normal  0.0301658 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>