More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1755 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  100 
 
 		 255 aa  522  1e-147  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  42.05 
 
 		 285 aa  183  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1247  putative cell-wall associated endopeptidase  40.87 
 
 		 257 aa  179  4e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  40.22 
 
 		 298 aa  172  5e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  44.88 
 
 		 216 aa  158  7e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  48.4 
 
 		 208 aa  158  8e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  39.1 
 
 		 301 aa  155  6e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  38.95 
 
 		 303 aa  154  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  36.01 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  43.08 
 
 		 217 aa  143  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  32.5 
 
 		 338 aa  135  4e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  32.75 
 
 		 342 aa  133  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  33.45 
 
 		 342 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  32.08 
 
 		 342 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  35.42 
 
 		 341 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2639  NLP/P60 protein  30.9 
 
 		 349 aa  128  9.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1554  NLP/P60  39.69 
 
 		 208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.68889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  30.88 
 
 		 341 aa  125  7e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  54.47 
 
 		 319 aa  125  8.000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  28.91 
 
 		 346 aa  124  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  42.55 
 
 		 218 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  42.55 
 
 		 218 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  42.55 
 
 		 218 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  42.55 
 
 		 218 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  42.55 
 
 		 234 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  42.55 
 
 		 234 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  43.54 
 
 		 224 aa  123  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  42.55 
 
 		 234 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  41.92 
 
 		 370 aa  122  5e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  49.6 
 
 		 424 aa  122  7e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  44.22 
 
 		 183 aa  122  7e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 223 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0388  NLP/P60  49.18 
 
 		 170 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.815605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 223 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  41.96 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4049  NLP/P60 protein  41.95 
 
 		 212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  42.86 
 
 		 223 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  49.15 
 
 		 391 aa  119  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 223 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  42.47 
 
 		 224 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1669  NLP/P60 protein  41.38 
 
 		 214 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  38.15 
 
 		 205 aa  119  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3056  NLP/P60 protein  31.47 
 
 		 347 aa  118  9e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000688808  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1267  NLP/P60 protein  40.8 
 
 		 214 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0992  hypothetical protein  50.43 
 
 		 170 aa  115  5e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.480266  normal  0.532227 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1227  NLP/P60 protein  46.15 
 
 		 214 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  43.86 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  43.86 
 
 		 221 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  41.78 
 
 		 265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  42 
 
 		 188 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  43.86 
 
 		 221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1679  NLP/P60 protein  46.22 
 
 		 210 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2520  NLP/P60 family protein  44.53 
 
 		 365 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.509627  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2149  NLP/P60 protein  44.53 
 
 		 365 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000521128  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1018  NLP/P60 protein  45.61 
 
 		 215 aa  112  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.121174  normal  0.0409551 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1112  NLP/P60 protein  45.61 
 
 		 215 aa  112  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.893499 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2291  NLP/P60 protein  50.43 
 
 		 242 aa  112  7.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  43.33 
 
 		 208 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2519  cell wall-associated hydrolase-like protein  44.06 
 
 		 225 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1999  NLP/P60  39.6 
 
 		 226 aa  111  9e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.762084  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2142  NLP/P60  44.74 
 
 		 226 aa  111  9e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0634754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  43.33 
 
 		 208 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  43.33 
 
 		 207 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  43.33 
 
 		 208 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1637  NLP/P60  50.41 
 
 		 226 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58461  normal  0.048116 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0747  NLP/P60 protein  43.9 
 
 		 298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000792578  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1233  NLP/P60 protein  44.17 
 
 		 214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.783126  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2888  NLP/P60 protein  46.4 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215701  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1250  NLP/P60 protein  40.46 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000552171  normal  0.790948 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1972  NLP/P60  39.46 
 
 		 212 aa  109  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107958  normal  0.172208 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4127  NLP/P60 protein  47.9 
 
 		 532 aa  110  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  44.85 
 
 		 181 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  43.65 
 
 		 230 aa  109  4.0000000000000004e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1705  NLP/P60 family protein  46.67 
 
 		 242 aa  108  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1100  NLP/P60 protein  43.33 
 
 		 215 aa  108  6e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1652  NLP/P60 protein  37.78 
 
 		 178 aa  108  7.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0828  NLP/P60 protein  50 
 
 		 240 aa  108  7.000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000898283  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2125  NLP/P60  44.74 
 
 		 228 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839892  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  47.06 
 
 		 532 aa  108  8.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33180  NLP/P60 family lipoprotein  49.57 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.38174  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1670  NLP/P60 protein  43.17 
 
 		 177 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  42.36 
 
 		 177 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  43.09 
 
 		 181 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0479  NLP/P60  41.48 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3968  NLP/P60 protein  46.49 
 
 		 211 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12193  normal  0.0821241 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  43.06 
 
 		 173 aa  107  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  44.07 
 
 		 177 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0091  NLP/P60  46.22 
 
 		 170 aa  107  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6213  NLP/P60  46.49 
 
 		 363 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935456  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  44.07 
 
 		 198 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1866  NLP/P60 protein  46.49 
 
 		 363 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1890  NLP/P60 protein  46.49 
 
 		 363 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00780805  hitchhiker  0.0000000811276 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3684  NLP/P60  45.83 
 
 		 242 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49515  hitchhiker  0.00130241 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1804  NLP/P60 protein  45.61 
 
 		 354 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1228  NLP/P60 protein  41.61 
 
 		 177 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1344  NLP/P60 protein  42.15 
 
 		 207 aa  106  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1314  lipoprotein transmembrane  38.93 
 
 		 258 aa  106  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1268  NLP/P60 protein  41.67 
 
 		 177 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.200264 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1528  NlpC/P60 family protein  42.42 
 
 		 273 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>