More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1554 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1554  NLP/P60  100 
 
 		 208 aa  421  1e-117  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.68889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  46.23 
 
 		 303 aa  153  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  41.54 
 
 		 217 aa  145  6e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  38.28 
 
 		 208 aa  132  5e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  39.69 
 
 		 255 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1247  putative cell-wall associated endopeptidase  36.76 
 
 		 257 aa  126  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  36.95 
 
 		 298 aa  126  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  32.43 
 
 		 341 aa  121  7e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  37.77 
 
 		 285 aa  121  7e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  33.78 
 
 		 342 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  34.68 
 
 		 342 aa  118  6e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2639  NLP/P60 protein  34.96 
 
 		 349 aa  118  6e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3056  NLP/P60 protein  33.19 
 
 		 347 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000688808  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  45.31 
 
 		 265 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  37.44 
 
 		 301 aa  116  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  37.56 
 
 		 341 aa  115  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  46.96 
 
 		 391 aa  115  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  31.88 
 
 		 346 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  32.88 
 
 		 342 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  33.64 
 
 		 295 aa  113  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0958  NLP/P60 protein  34.65 
 
 		 202 aa  112  4.0000000000000004e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000015981  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1159  NLP/P60 protein  36.97 
 
 		 210 aa  109  2.0000000000000002e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.944138  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  41.43 
 
 		 257 aa  106  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3022  NLP/P60 protein  33.64 
 
 		 289 aa  106  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  40.28 
 
 		 183 aa  106  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  41.61 
 
 		 274 aa  105  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  47.46 
 
 		 232 aa  105  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3648  NLP/P60 protein  49.57 
 
 		 391 aa  103  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0577  NLP/P60 protein  42.96 
 
 		 242 aa  103  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  34.95 
 
 		 338 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0173  NlpC/P60 family protein  41.18 
 
 		 458 aa  102  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  41.3 
 
 		 246 aa  102  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 476 aa  102  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  42.42 
 
 		 246 aa  102  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  37.43 
 
 		 223 aa  101  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  45.69 
 
 		 224 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  38.89 
 
 		 223 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0828  NLP/P60 protein  43.59 
 
 		 240 aa  100  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000898283  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  46.15 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  46.15 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0433  NLP/P60 protein  45.38 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.895953  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  46.15 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  45.61 
 
 		 202 aa  100  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  45.3 
 
 		 224 aa  99  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  41.07 
 
 		 333 aa  99  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  45.3 
 
 		 223 aa  99  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1177  putative transmembrane protein  45.95 
 
 		 222 aa  98.6  6e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0196017  normal  0.188955 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  45.22 
 
 		 221 aa  98.6  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  45.22 
 
 		 234 aa  98.6  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3603  NLP/P60 protein  46.02 
 
 		 164 aa  98.2  8e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2321  NLP/P60 protein  44.92 
 
 		 266 aa  98.2  8e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02105  predicted peptidase, outer membrane lipoprotein  46.85 
 
 		 188 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1482  NLP/P60 protein  46.85 
 
 		 188 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736883  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  45.22 
 
 		 218 aa  97.8  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02064  hypothetical protein  46.85 
 
 		 188 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3313  putative outer membrane lipoprotein  46.85 
 
 		 188 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0116683  normal  0.115135 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  45.22 
 
 		 234 aa  97.8  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0435  NLP/P60 protein  42.52 
 
 		 232 aa  97.4  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  45.22 
 
 		 234 aa  97.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2324  putative outer membrane lipoprotein  46.85 
 
 		 188 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669952 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0091  NLP/P60  40.17 
 
 		 170 aa  97.4  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  45.22 
 
 		 234 aa  97.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  45.22 
 
 		 221 aa  97.4  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0783  putative outer membrane lipoprotein  46.85 
 
 		 188 aa  97.4  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2313  putative outer membrane lipoprotein  46.85 
 
 		 188 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.871525  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2473  putative outer membrane lipoprotein  46.85 
 
 		 188 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.303091  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  45.22 
 
 		 218 aa  97.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1472  putative outer membrane lipoprotein  46.85 
 
 		 188 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000135569  normal  0.0170642 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  45.22 
 
 		 218 aa  97.8  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  45.22 
 
 		 218 aa  97.8  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2830  NLP/P60 protein  44.35 
 
 		 220 aa  97.4  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.704353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2519  cell wall-associated hydrolase-like protein  47.01 
 
 		 225 aa  96.7  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  44.35 
 
 		 424 aa  95.9  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2565  putative outer membrane lipoprotein  45.95 
 
 		 190 aa  96.3  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.159761  hitchhiker  0.000144355 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2454  putative outer membrane lipoprotein  45.95 
 
 		 190 aa  96.3  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00195047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2451  putative outer membrane lipoprotein  45.95 
 
 		 190 aa  96.3  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000518421 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1201  NLP/P60  36.94 
 
 		 169 aa  95.9  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1118  NLP/P60 protein  42.07 
 
 		 189 aa  95.9  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.579853  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2363  putative outer membrane lipoprotein  45.95 
 
 		 147 aa  95.1  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000243067  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2408  putative outer membrane lipoprotein  45.95 
 
 		 147 aa  95.1  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210623 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2577  cell wall-associated hydrolase  36.87 
 
 		 333 aa  94  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164117  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 192 aa  94  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2855  NLP/P60 family protein  36.87 
 
 		 333 aa  94  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2432  NLP/P60 family protein  36.87 
 
 		 333 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.899635 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2667  peptidace C40 NLP/P60  44.64 
 
 		 187 aa  94.4  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.411217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1679  NLP/P60 protein  45.05 
 
 		 210 aa  94  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  42.86 
 
 		 370 aa  93.6  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2658  NLP/P60 family protein  36.87 
 
 		 333 aa  93.6  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2849  NLP/P60 family protein  36.87 
 
 		 333 aa  93.6  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2224  NLP/P60  42.52 
 
 		 309 aa  93.6  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.231098  hitchhiker  0.0000179311 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2091  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 192 aa  93.2  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.315099  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2609  cell wall-associated hydrolase  44.25 
 
 		 333 aa  93.2  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.652367  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1018  NLP/P60 protein  43.24 
 
 		 215 aa  92.8  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.121174  normal  0.0409551 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1112  NLP/P60 protein  43.24 
 
 		 215 aa  92.8  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.893499 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  43.9 
 
 		 532 aa  93.2  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0388  NLP/P60  44.44 
 
 		 170 aa  92.8  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.815605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4200  NLP/P60 protein  37.88 
 
 		 156 aa  92.4  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0958  NLP/P60 protein  36.18 
 
 		 167 aa  92.4  4e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.414472  normal  0.258055 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2897  NLP/P60 family protein  36.31 
 
 		 333 aa  92.4  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>