More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1908 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  100 
 
 
298 aa  598  1e-170  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  41.33 
 
 
255 aa  181  9.000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  35.51 
 
 
342 aa  168  8e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  34.89 
 
 
342 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  36.33 
 
 
285 aa  166  5.9999999999999996e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  38.89 
 
 
303 aa  162  6e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  35.03 
 
 
295 aa  160  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  42.36 
 
 
217 aa  159  6e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  35.71 
 
 
338 aa  158  9e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  30.38 
 
 
346 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2639  NLP/P60 protein  34.12 
 
 
349 aa  154  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  58.62 
 
 
391 aa  154  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  37.37 
 
 
301 aa  153  2.9999999999999998e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  32.4 
 
 
342 aa  146  5e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  34.85 
 
 
341 aa  145  6e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  40 
 
 
216 aa  145  6e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1247  putative cell-wall associated endopeptidase  31.73 
 
 
257 aa  144  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  40 
 
 
208 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  29.49 
 
 
341 aa  143  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3056  NLP/P60 protein  34.03 
 
 
347 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000688808  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  48.98 
 
 
265 aa  138  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1554  NLP/P60  36.41 
 
 
208 aa  129  7.000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.68889  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  43.95 
 
 
274 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  48.74 
 
 
333 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  32.29 
 
 
476 aa  119  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2520  NLP/P60 family protein  48.18 
 
 
365 aa  119  9e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.509627  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2149  NLP/P60 protein  48.18 
 
 
365 aa  119  9e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000521128  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  45.76 
 
 
246 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3022  NLP/P60 protein  32.9 
 
 
289 aa  117  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  50 
 
 
232 aa  117  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  48.28 
 
 
424 aa  117  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  47.79 
 
 
246 aa  116  6e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06710  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  32.95 
 
 
292 aa  116  6e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  50 
 
 
257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1543  NlpC/P60 family protein  44.74 
 
 
275 aa  112  9e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.179042 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01625  predicted lipoprotein  44.74 
 
 
271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1852  NlpC/P60 family protein  44.74 
 
 
271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000302623  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1985  NLP/P60 protein  44.74 
 
 
271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.778309  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2367  NlpC/P60 family protein  44.74 
 
 
271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00414236  normal  0.27776 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1734  NlpC/P60 family protein  44.74 
 
 
271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  44.64 
 
 
150 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1868  NlpC/P60 family protein  44.74 
 
 
271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206609  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1974  NLP/P60 protein  44.74 
 
 
271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117191 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01615  hypothetical protein  44.74 
 
 
271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0173  NlpC/P60 family protein  43.59 
 
 
458 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3133  NLP/P60 protein  48.82 
 
 
454 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000296935  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  41.61 
 
 
208 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  43.75 
 
 
150 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1757  NlpC/P60 family lipoprotein  45.61 
 
 
283 aa  109  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156191  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  44.09 
 
 
235 aa  109  5e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1864  NLP/P60 protein  45.61 
 
 
283 aa  109  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.617955  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5167  NLP/P60 family lipoprotein  34.04 
 
 
364 aa  109  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  42.25 
 
 
207 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2671  NLP/P60 protein  36.97 
 
 
283 aa  108  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.179494  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1792  NLP/P60 protein  44.74 
 
 
256 aa  108  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.851858  normal  0.0301658 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  41.61 
 
 
208 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2570  NlpC/P60 family lipoprotein  44.74 
 
 
283 aa  107  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117101  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  45.9 
 
 
370 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1717  NLP/P60 protein  44.74 
 
 
324 aa  107  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00794283  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  50.88 
 
 
173 aa  106  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1528  NlpC/P60 family protein  36.08 
 
 
273 aa  106  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1602  NlpC/P60 family protein  36.08 
 
 
273 aa  106  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2197  NLP/P60 protein  44.74 
 
 
273 aa  106  6e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.369734  hitchhiker  0.00000685507 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1742  NlpC/P60 family protein  36.08 
 
 
273 aa  106  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000022854  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1542  NlpC/P60 family protein  36.08 
 
 
273 aa  106  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0237599  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1911  NlpC/P60 family protein  36.08 
 
 
273 aa  106  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.569551  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  44.25 
 
 
188 aa  105  7e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2387  NLP/P60 protein  43.86 
 
 
283 aa  105  7e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.05451  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6213  NLP/P60  46.49 
 
 
363 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1866  NLP/P60 protein  46.49 
 
 
363 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1890  NLP/P60 protein  46.49 
 
 
363 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00780805  hitchhiker  0.0000000811276 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  44.54 
 
 
205 aa  105  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1684  NLP/P60 protein  42.98 
 
 
356 aa  104  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1804  NLP/P60 protein  44.54 
 
 
354 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  41.21 
 
 
181 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  45 
 
 
208 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1407  NLP/P60 protein  45.61 
 
 
369 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.374528 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1776  NLP/P60 protein  44.54 
 
 
353 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  43.17 
 
 
235 aa  103  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2393  putative transmembrane lipoprotein  44.74 
 
 
404 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.951834  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1999  NLP/P60  39.86 
 
 
226 aa  103  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.762084  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  47.5 
 
 
306 aa  103  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2186  NLP/P60 family lipoprotein  45.61 
 
 
407 aa  102  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  48.72 
 
 
450 aa  102  7e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1794  NLP/P60 protein  44.74 
 
 
418 aa  102  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435053  hitchhiker  0.00883906 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0919  NLP/P60 protein  44.74 
 
 
382 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0475791  normal  0.21921 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1250  NLP/P60 protein  37.09 
 
 
248 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000552171  normal  0.790948 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2887  NLP/P60 protein  49.14 
 
 
179 aa  102  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.171139  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1954  NLP/P60 protein  27.99 
 
 
384 aa  100  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1397  NLP/P60 family lipoprotein  44.74 
 
 
407 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.929375  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1160  NLP/P60 family lipoprotein  44.74 
 
 
407 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.812731  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2408  NLP/P60 family lipoprotein  44.74 
 
 
407 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.166866  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  42.35 
 
 
177 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  37.16 
 
 
307 aa  101  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1504  NLP/P60 protein  45.37 
 
 
188 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0399794  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1828  lipoprotein, NLP/P60 family  45.37 
 
 
188 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.996382  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1887  NLP/P60 family lipoprotein  44.74 
 
 
407 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.850579  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0009  NLP/P60 family lipoprotein  44.74 
 
 
407 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30529  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2244  NlpC/P60 family lipoprotein  44.74 
 
 
404 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2283  NlpC/P60 family lipoprotein  44.74 
 
 
404 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>