More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0480 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  100 
 
 		 285 aa  583  1e-166  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  43.18 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  36.33 
 
 		 298 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  33.55 
 
 		 342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3056  NLP/P60 protein  35.41 
 
 		 347 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000688808  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1247  putative cell-wall associated endopeptidase  35.82 
 
 		 257 aa  163  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  44.68 
 
 		 216 aa  162  6e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  31.85 
 
 		 346 aa  161  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  32.79 
 
 		 342 aa  160  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  34.21 
 
 		 341 aa  151  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2639  NLP/P60 protein  34.54 
 
 		 349 aa  151  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  42.19 
 
 		 217 aa  148  8e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  32.76 
 
 		 342 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  36.19 
 
 		 301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  36.57 
 
 		 295 aa  142  8e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  36.97 
 
 		 303 aa  138  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  42.47 
 
 		 208 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  51.52 
 
 		 274 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  45 
 
 		 265 aa  136  4e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  50.43 
 
 		 391 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3133  NLP/P60 protein  46.72 
 
 		 454 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000296935  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  30.87 
 
 		 476 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1554  NLP/P60  37.77 
 
 		 208 aa  121  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.68889  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  43.51 
 
 		 246 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  51.72 
 
 		 181 aa  117  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  41.33 
 
 		 232 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  29.75 
 
 		 338 aa  116  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  42.75 
 
 		 246 aa  115  6e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  40.31 
 
 		 333 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2195  NLP/P60 protein  46.15 
 
 		 168 aa  115  7.999999999999999e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  42 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  42 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0173  NlpC/P60 family protein  48.7 
 
 		 458 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  42 
 
 		 218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  42 
 
 		 218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  42 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  42 
 
 		 218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  42 
 
 		 218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2365  NLP/P60:sporulation-related protein  40.79 
 
 		 266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  48.06 
 
 		 224 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  46.51 
 
 		 234 aa  112  9e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0388  NLP/P60  45.16 
 
 		 170 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.815605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  48.06 
 
 		 223 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  48.06 
 
 		 223 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  48.06 
 
 		 223 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  34.06 
 
 		 341 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  47.29 
 
 		 224 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1344  NLP/P60 protein  46.4 
 
 		 207 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  47.29 
 
 		 223 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  42.4 
 
 		 150 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  47.29 
 
 		 223 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  42.86 
 
 		 267 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3022  NLP/P60 protein  30.85 
 
 		 289 aa  109  6e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1274  NLP/P60 protein  39.73 
 
 		 207 aa  108  7.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.951335  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  45.76 
 
 		 424 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1954  NLP/P60 protein  29.47 
 
 		 384 aa  108  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  40 
 
 		 450 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  42.98 
 
 		 177 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  43.31 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  45 
 
 		 205 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  40.46 
 
 		 150 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0828  NLP/P60 protein  47.41 
 
 		 240 aa  107  3e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000898283  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1794  NLP/P60 protein  46.72 
 
 		 418 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435053  hitchhiker  0.00883906 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  42.98 
 
 		 198 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  39.49 
 
 		 269 aa  106  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  44.19 
 
 		 221 aa  106  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6213  NLP/P60  48.28 
 
 		 363 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1866  NLP/P60 protein  48.28 
 
 		 363 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  42.28 
 
 		 188 aa  106  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1890  NLP/P60 protein  48.28 
 
 		 363 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00780805  hitchhiker  0.0000000811276 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  44.19 
 
 		 221 aa  105  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1999  NLP/P60  45.08 
 
 		 226 aa  105  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.762084  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2520  NLP/P60 family protein  50 
 
 		 365 aa  105  9e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.509627  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2149  NLP/P60 protein  50 
 
 		 365 aa  105  9e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000521128  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2393  putative transmembrane lipoprotein  47.37 
 
 		 404 aa  105  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.951834  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0992  hypothetical protein  48.72 
 
 		 170 aa  104  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.480266  normal  0.532227 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0919  NLP/P60 protein  46.55 
 
 		 382 aa  104  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0475791  normal  0.21921 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  43.41 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  45.76 
 
 		 332 aa  103  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5167  NLP/P60 family lipoprotein  46.55 
 
 		 364 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0897  NLP/P60 family protein  43.71 
 
 		 231 aa  104  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.624146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2224  NLP/P60  47.06 
 
 		 309 aa  104  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.231098  hitchhiker  0.0000179311 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2041  NLP/P60 protein  45.52 
 
 		 284 aa  103  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000350881  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2476  NLP/P60 protein  39.04 
 
 		 214 aa  104  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.188506  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  38.85 
 
 		 269 aa  103  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0433  NLP/P60 protein  45.38 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.895953  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1407  NLP/P60 protein  45.69 
 
 		 369 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.374528 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02105  predicted peptidase, outer membrane lipoprotein  43.75 
 
 		 188 aa  103  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1482  NLP/P60 protein  43.75 
 
 		 188 aa  103  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736883  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2313  putative outer membrane lipoprotein  43.75 
 
 		 188 aa  103  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.871525  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02064  hypothetical protein  43.75 
 
 		 188 aa  103  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2473  putative outer membrane lipoprotein  43.75 
 
 		 188 aa  103  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.303091  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0783  putative outer membrane lipoprotein  43.75 
 
 		 188 aa  103  4e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3313  putative outer membrane lipoprotein  43.75 
 
 		 188 aa  103  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0116683  normal  0.115135 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1472  putative outer membrane lipoprotein  43.75 
 
 		 188 aa  103  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000135569  normal  0.0170642 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2324  putative outer membrane lipoprotein  43.75 
 
 		 188 aa  103  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669952 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0791  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)-like  42.75 
 
 		 221 aa  103  5e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  43.9 
 
 		 333 aa  102  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  43.59 
 
 		 307 aa  102  8e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1652  NLP/P60 protein  41.94 
 
 		 178 aa  102  9e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>