More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0433 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0433  NLP/P60 protein  100 
 
 
245 aa  494  1e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.895953  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2224  NLP/P60  42.75 
 
 
309 aa  183  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.231098  hitchhiker  0.0000179311 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2321  NLP/P60 protein  41.13 
 
 
266 aa  183  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2413  NLP/P60  35 
 
 
337 aa  143  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000144369  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  50 
 
 
265 aa  129  5.0000000000000004e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0033  NLP/P60 protein  31.68 
 
 
308 aa  123  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  51.72 
 
 
391 aa  122  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  47.01 
 
 
274 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  51.67 
 
 
476 aa  118  7.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3657  NLP/P60 protein  36.44 
 
 
385 aa  115  6.9999999999999995e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1936  NLP/P60 protein  30.59 
 
 
333 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.782262  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2365  NLP/P60:sporulation-related protein  44.44 
 
 
266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2897  NLP/P60 family protein  30.2 
 
 
333 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2609  cell wall-associated hydrolase  30.2 
 
 
333 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.652367  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2577  cell wall-associated hydrolase  30.2 
 
 
333 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164117  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  43.28 
 
 
307 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  37.71 
 
 
217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2658  NLP/P60 family protein  30.2 
 
 
333 aa  109  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2849  NLP/P60 family protein  30.2 
 
 
333 aa  109  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2862  NLP/P60 family protein  30.59 
 
 
333 aa  110  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3648  NLP/P60 protein  35.97 
 
 
391 aa  109  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2855  NLP/P60 family protein  30.2 
 
 
333 aa  109  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2432  NLP/P60 family protein  29.8 
 
 
333 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.899635 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  41.98 
 
 
267 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2878  NLP/P60 family protein  29.8 
 
 
333 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0584446  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2651  NLP/P60 protein  30.2 
 
 
333 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  29.77 
 
 
424 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  42.48 
 
 
342 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  42.48 
 
 
342 aa  107  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  40.98 
 
 
232 aa  106  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  43.8 
 
 
257 aa  104  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2041  NLP/P60 protein  44.8 
 
 
284 aa  104  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000350881  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  45.38 
 
 
285 aa  103  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  49.11 
 
 
341 aa  103  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0039  NLP/P60 protein  38.12 
 
 
270 aa  102  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  42.98 
 
 
278 aa  102  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  47.01 
 
 
303 aa  102  6e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  50 
 
 
246 aa  102  7e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  31.35 
 
 
335 aa  102  7e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  42.98 
 
 
269 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  47.86 
 
 
246 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1554  NLP/P60  45.38 
 
 
208 aa  100  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.68889  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  43.8 
 
 
269 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3056  NLP/P60 protein  50.93 
 
 
347 aa  100  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000688808  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4057  NLP/P60  27.14 
 
 
292 aa  100  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144265  normal  0.145245 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1247  putative cell-wall associated endopeptidase  33.7 
 
 
257 aa  100  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1644  lipoprotein NlpC  46.23 
 
 
153 aa  99  6e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  47.32 
 
 
342 aa  99  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  45.37 
 
 
346 aa  99  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11858  dipeptidyl peptidase VI  31.84 
 
 
249 aa  98.2  9e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.706852  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  45.53 
 
 
298 aa  98.2  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1825  lipoprotein NlpC  45.28 
 
 
152 aa  97.4  2e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1380  hypothetical protein  36.36 
 
 
271 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1628  NLP/P60 protein  48.6 
 
 
155 aa  97.4  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2195  NLP/P60 protein  50 
 
 
168 aa  97.4  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2639  NLP/P60 protein  46.09 
 
 
349 aa  97.1  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2166  NLP/P60 protein  46.21 
 
 
194 aa  96.7  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343346  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  41.53 
 
 
150 aa  96.7  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  44.44 
 
 
450 aa  96.3  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0045  NlpC/P60 family domain protein  39.04 
 
 
174 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000018046  normal  0.424193 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  45.45 
 
 
188 aa  95.9  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  43.1 
 
 
150 aa  95.5  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3759  NLP/P60 protein  32.28 
 
 
314 aa  95.5  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3133  NLP/P60 protein  45.3 
 
 
454 aa  95.5  7e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000296935  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3592  NLP/P60 protein  32 
 
 
345 aa  95.1  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0048  NLP/P60 protein  35.45 
 
 
270 aa  94.4  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0780825  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2466  NLP/P60 protein  46.73 
 
 
162 aa  94.7  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.291366  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0105  NLP/P60  32.47 
 
 
278 aa  94.7  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3326  NLP/P60 protein  28.29 
 
 
346 aa  94.7  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0910486  normal  0.729051 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2772  NLP/P60 protein  47.66 
 
 
157 aa  94.7  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0061  NLP/P60 family lipoprotein  49.06 
 
 
154 aa  94.4  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0173  NlpC/P60 family protein  42.74 
 
 
458 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  30.04 
 
 
370 aa  94  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1927  NlpC/P60 family lipoprotein  43.93 
 
 
154 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00858399  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1482  NlpC/P60 family lipoprotein  43.93 
 
 
154 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  41.27 
 
 
333 aa  93.2  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1788  NlpC/P60 family lipoprotein  43.93 
 
 
154 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2426  lipoprotein, NlpC/P60 family  43.93 
 
 
154 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1657  cell wall-associated hydrolase  41.67 
 
 
186 aa  93.2  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.388437  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01677  predicted lipoprotein  43.93 
 
 
154 aa  92.4  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0294155  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1934  NLP/P60 protein  43.93 
 
 
154 aa  92.4  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0636747  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1923  NLP/P60 protein  43.93 
 
 
154 aa  92.4  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.468553 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0828  NLP/P60 protein  42.59 
 
 
240 aa  92.4  5e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000898283  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01666  hypothetical protein  43.93 
 
 
154 aa  92.4  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0178073  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3992  NLP/P60 protein  45.28 
 
 
196 aa  92.8  5e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000856339  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1657  NLP/P60 protein  46.73 
 
 
154 aa  92.4  6e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.983654  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  42.98 
 
 
273 aa  92.4  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03360  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  34.11 
 
 
580 aa  92  7e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1768  NLP/P60 protein  42.86 
 
 
325 aa  92  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1830  NlpC (ORF-17)  45.37 
 
 
154 aa  91.7  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1438  NlpC (ORF-17)  45.37 
 
 
154 aa  91.7  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0813186 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2002  putative lipoprotein nlpC  45.37 
 
 
154 aa  91.7  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.303201 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1454  putative lipoprotein nlpC  45.37 
 
 
154 aa  91.7  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.297729  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1471  hypothetical protein  45.37 
 
 
154 aa  91.7  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.235317  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1912  lipoprotein, NlpC/P60 family  42.99 
 
 
154 aa  91.7  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0061  NLP/P60 protein  49.06 
 
 
159 aa  91.3  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000041841 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0059  NLP/P60 protein  49.06 
 
 
159 aa  91.3  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.560848  hitchhiker  0.000388338 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0063  NLP/P60 protein  49.06 
 
 
159 aa  91.3  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000156196 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2161  NLP/P60 protein  40.3 
 
 
154 aa  90.9  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.854022 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  45.08 
 
 
202 aa  90.5  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0258261 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>