More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1274 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1274  NLP/P60 protein  100 
 
 		 207 aa  424  1e-118  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.951335  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  65.71 
 
 		 188 aa  246  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0897  NLP/P60 family protein  61.27 
 
 		 231 aa  231  6e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.624146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1344  NLP/P60 protein  58.16 
 
 		 207 aa  224  6e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2476  NLP/P60 protein  49.24 
 
 		 214 aa  198  5e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.188506  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0791  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)-like  43.3 
 
 		 221 aa  194  9e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2420  NLP/P60 protein  42.55 
 
 		 207 aa  136  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2819  NLP/P60 protein  47.93 
 
 		 159 aa  131  6.999999999999999e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2584  NLP/P60 protein  46.15 
 
 		 205 aa  131  7.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.416294  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  49.11 
 
 		 216 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2446  NLP/P60 protein  45.76 
 
 		 208 aa  125  6e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2178  NLP/P60 protein  43.22 
 
 		 193 aa  120  9.999999999999999e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  40.97 
 
 		 234 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  42.45 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  42.45 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  42.45 
 
 		 218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  42.45 
 
 		 218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  42.45 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  42.45 
 
 		 218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  42.45 
 
 		 218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  38 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3244  putative outer membrane lipoprotein  40.79 
 
 		 191 aa  116  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0124301 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  46.43 
 
 		 221 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  38 
 
 		 223 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  46.85 
 
 		 223 aa  115  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  46.43 
 
 		 221 aa  116  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  37.33 
 
 		 223 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  37.33 
 
 		 223 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  38 
 
 		 223 aa  116  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  37.33 
 
 		 223 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2142  NLP/P60  34.76 
 
 		 226 aa  115  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0634754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  46.85 
 
 		 224 aa  115  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2707  putative outer membrane lipoprotein  46.36 
 
 		 194 aa  114  7.999999999999999e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2784  putative outer membrane lipoprotein  46.36 
 
 		 194 aa  114  7.999999999999999e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1501  putative outer membrane lipoprotein  46.36 
 
 		 172 aa  114  8.999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2125  NLP/P60  46.15 
 
 		 228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839892  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2022  NLP/P60 family protein  42.36 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1112  NLP/P60 protein  40.69 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.893499 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1018  NLP/P60 protein  35.26 
 
 		 215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.121174  normal  0.0409551 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  41.53 
 
 		 150 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1250  NLP/P60 protein  31.46 
 
 		 248 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000552171  normal  0.790948 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  38.41 
 
 		 333 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2771  putative outer membrane lipoprotein  37.36 
 
 		 189 aa  112  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.805322  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1314  lipoprotein transmembrane  34.52 
 
 		 258 aa  111  7.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1652  NLP/P60 protein  38.46 
 
 		 178 aa  111  7.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  42.31 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2186  NLP/P60 family lipoprotein  45.95 
 
 		 407 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0062  NLP/P60 protein  37.66 
 
 		 154 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02105  predicted peptidase, outer membrane lipoprotein  37.57 
 
 		 188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1482  NLP/P60 protein  37.57 
 
 		 188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736883  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1472  putative outer membrane lipoprotein  37.57 
 
 		 188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000135569  normal  0.0170642 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  41.18 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1397  NLP/P60 family lipoprotein  46.43 
 
 		 407 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.929375  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0063  NLP/P60 protein  37.66 
 
 		 164 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.694655  hitchhiker  0.00200651 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2473  putative outer membrane lipoprotein  37.57 
 
 		 188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.303091  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2408  NLP/P60 family lipoprotein  46.43 
 
 		 407 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.166866  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0052  NLP/P60 protein  38.06 
 
 		 154 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00304715  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0388  NLP/P60  39.2 
 
 		 170 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.815605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2324  putative outer membrane lipoprotein  37.57 
 
 		 188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669952 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 150 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3313  putative outer membrane lipoprotein  37.57 
 
 		 188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0116683  normal  0.115135 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0783  putative outer membrane lipoprotein  37.57 
 
 		 188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02064  hypothetical protein  37.57 
 
 		 188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1887  NLP/P60 family lipoprotein  46.43 
 
 		 407 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.850579  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2313  putative outer membrane lipoprotein  37.57 
 
 		 188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.871525  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0009  NLP/P60 family lipoprotein  46.43 
 
 		 407 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30529  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2244  NlpC/P60 family lipoprotein  46.43 
 
 		 404 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1160  NLP/P60 family lipoprotein  46.43 
 
 		 407 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.812731  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  37.67 
 
 		 183 aa  109  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2283  NlpC/P60 family lipoprotein  46.43 
 
 		 404 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  37.93 
 
 		 265 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  41.18 
 
 		 208 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  41.48 
 
 		 208 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  40.65 
 
 		 208 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0170  NLP/P60 protein  38.02 
 
 		 184 aa  108  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2393  putative transmembrane lipoprotein  46.85 
 
 		 404 aa  108  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.951834  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0058  NLP/P60 protein  38.85 
 
 		 164 aa  108  6e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0061  NLP/P60 family lipoprotein  37.66 
 
 		 154 aa  108  6e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  39.73 
 
 		 285 aa  108  6e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4296  NLP/P60 protein  38.85 
 
 		 164 aa  108  6e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.346407  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1646  putative outer membrane lipoprotein  43.64 
 
 		 194 aa  107  8.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79512  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  43.86 
 
 		 424 aa  107  9.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  36.71 
 
 		 173 aa  107  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0061  NLP/P60 protein  37.18 
 
 		 159 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000041841 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0059  NLP/P60 protein  37.18 
 
 		 159 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.560848  hitchhiker  0.000388338 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1794  NLP/P60 protein  46.85 
 
 		 418 aa  107  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435053  hitchhiker  0.00883906 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0063  NLP/P60 protein  37.18 
 
 		 159 aa  107  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000156196 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5044  NLP/P60 family protein  45.61 
 
 		 226 aa  106  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.982871  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1917  putative outer membrane lipoprotein  43.24 
 
 		 193 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2431  putative outer membrane lipoprotein  45.45 
 
 		 191 aa  106  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2335  putative outer membrane lipoprotein  45.45 
 
 		 191 aa  106  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1189  NLP/P60 protein  38.28 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103363  normal  0.0364754 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0479  NLP/P60  45.61 
 
 		 225 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1407  NLP/P60 protein  45.05 
 
 		 369 aa  105  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.374528 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2454  putative outer membrane lipoprotein  43.1 
 
 		 190 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00195047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2565  putative outer membrane lipoprotein  43.1 
 
 		 190 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.159761  hitchhiker  0.000144355 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2451  putative outer membrane lipoprotein  43.1 
 
 		 190 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000518421 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1637  NLP/P60  44.44 
 
 		 226 aa  105  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58461  normal  0.048116 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 192 aa  105  7e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1999  NLP/P60  40 
 
 		 226 aa  104  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.762084  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>