More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2446 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2446  NLP/P60 protein  100 
 
 		 208 aa  431  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2178  NLP/P60 protein  55.77 
 
 		 193 aa  187  1e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2584  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 205 aa  128  6e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.416294  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2420  NLP/P60 protein  39.02 
 
 		 207 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1274  NLP/P60 protein  45.76 
 
 		 207 aa  125  6e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.951335  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0791  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)-like  35.86 
 
 		 221 aa  124  8.000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 188 aa  124  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0897  NLP/P60 family protein  43.88 
 
 		 231 aa  122  3e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.624146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2819  NLP/P60 protein  43.48 
 
 		 159 aa  122  3e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1344  NLP/P60 protein  45.97 
 
 		 207 aa  122  5e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2476  NLP/P60 protein  43.7 
 
 		 214 aa  118  6e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.188506  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1118  NLP/P60 protein  40 
 
 		 189 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.579853  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  48.8 
 
 		 424 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  44.64 
 
 		 223 aa  109  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  44.64 
 
 		 223 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02105  predicted peptidase, outer membrane lipoprotein  34.12 
 
 		 188 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1482  NLP/P60 protein  34.12 
 
 		 188 aa  107  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736883  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02064  hypothetical protein  34.12 
 
 		 188 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  43.75 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  43.75 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1472  putative outer membrane lipoprotein  34.12 
 
 		 188 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000135569  normal  0.0170642 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2324  putative outer membrane lipoprotein  34.12 
 
 		 188 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669952 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  43.75 
 
 		 223 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0783  putative outer membrane lipoprotein  34.12 
 
 		 188 aa  107  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3313  putative outer membrane lipoprotein  34.12 
 
 		 188 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0116683  normal  0.115135 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  43.75 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2473  putative outer membrane lipoprotein  34.12 
 
 		 188 aa  107  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.303091  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2313  putative outer membrane lipoprotein  34.12 
 
 		 188 aa  107  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.871525  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1438  NlpC (ORF-17)  37.95 
 
 		 154 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0813186 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1830  NlpC (ORF-17)  37.95 
 
 		 154 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1454  putative lipoprotein nlpC  37.95 
 
 		 154 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.297729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2002  putative lipoprotein nlpC  37.95 
 
 		 154 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.303201 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1471  hypothetical protein  37.95 
 
 		 154 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.235317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  32.31 
 
 		 224 aa  105  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2335  putative outer membrane lipoprotein  45.38 
 
 		 191 aa  105  7e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2771  putative outer membrane lipoprotein  32.94 
 
 		 189 aa  104  7e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.805322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0170  NLP/P60 protein  39.84 
 
 		 184 aa  105  7e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1628  NLP/P60 protein  37.8 
 
 		 155 aa  104  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0595  NLP/P60 protein  42.02 
 
 		 201 aa  103  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1293  NLP/P60  35.95 
 
 		 205 aa  104  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0496746  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1734  NLP/P60 protein  38.92 
 
 		 154 aa  104  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  43.44 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  37.4 
 
 		 221 aa  102  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  42.86 
 
 		 205 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  41.04 
 
 		 208 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3689  NLP/P60 family lipoprotein  40.65 
 
 		 179 aa  102  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2161  NLP/P60 protein  39.16 
 
 		 154 aa  103  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.854022 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1606  NLP/P60 protein  38.79 
 
 		 209 aa  102  4e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2100  NLP/P60 protein  45.45 
 
 		 302 aa  102  4e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.660776  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2887  NLP/P60 protein  40.54 
 
 		 179 aa  102  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.171139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2451  putative outer membrane lipoprotein  41.88 
 
 		 190 aa  101  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000518421 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2454  putative outer membrane lipoprotein  41.88 
 
 		 190 aa  101  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00195047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2565  putative outer membrane lipoprotein  41.88 
 
 		 190 aa  101  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.159761  hitchhiker  0.000144355 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  39.29 
 
 		 223 aa  101  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  40.18 
 
 		 234 aa  101  8e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  40.18 
 
 		 234 aa  101  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  45.76 
 
 		 150 aa  101  8e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  42.62 
 
 		 208 aa  101  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  40.54 
 
 		 218 aa  101  8e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  40.54 
 
 		 218 aa  101  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  40.18 
 
 		 234 aa  101  8e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  40.54 
 
 		 218 aa  101  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  40.54 
 
 		 218 aa  101  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  42.62 
 
 		 208 aa  101  8e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2363  putative outer membrane lipoprotein  41.88 
 
 		 147 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000243067  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  38.28 
 
 		 246 aa  100  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1637  NLP/P60  40.43 
 
 		 226 aa  100  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58461  normal  0.048116 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2466  NLP/P60 protein  38.73 
 
 		 162 aa  100  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.291366  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  36.09 
 
 		 221 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2408  putative outer membrane lipoprotein  41.88 
 
 		 147 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210623 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0479  NLP/P60  37.25 
 
 		 225 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0388  NLP/P60  41.94 
 
 		 170 aa  100  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.815605  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  41.6 
 
 		 342 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  41.6 
 
 		 342 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1659  hypothetical protein  38.18 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.255203  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0751  NLP/P60 protein  40.94 
 
 		 173 aa  100  2e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4708  NLP/P60 protein  40.17 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.341111  normal  0.0906731 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1669  NLP/P60 protein  41.54 
 
 		 214 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1014  NLP/P60 protein  42.99 
 
 		 211 aa  99.8  3e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1267  NLP/P60 protein  41.54 
 
 		 214 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1142  lipoprotein NlpC  41.18 
 
 		 166 aa  99.4  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0142689  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1426  NLP/P60 protein  34.86 
 
 		 165 aa  99.4  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4049  NLP/P60 protein  41.54 
 
 		 212 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  43.12 
 
 		 265 aa  99.8  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1482  NlpC/P60 family lipoprotein  45.3 
 
 		 154 aa  99  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1927  NlpC/P60 family lipoprotein  45.3 
 
 		 154 aa  99  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00858399  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1788  NlpC/P60 family lipoprotein  45.3 
 
 		 154 aa  99.4  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1250  NLP/P60 protein  32.53 
 
 		 248 aa  99  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000552171  normal  0.790948 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  39.34 
 
 		 198 aa  99  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2426  lipoprotein, NlpC/P60 family  45.3 
 
 		 154 aa  99  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  39.34 
 
 		 257 aa  99  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  39.34 
 
 		 177 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1657  NLP/P60 protein  36.69 
 
 		 154 aa  99  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.983654  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2707  putative outer membrane lipoprotein  41.53 
 
 		 194 aa  98.6  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2784  putative outer membrane lipoprotein  41.53 
 
 		 194 aa  98.6  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  39.29 
 
 		 234 aa  99  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01677  predicted lipoprotein  44.44 
 
 		 154 aa  98.6  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0294155  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1934  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 154 aa  98.6  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0636747  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3902  NLP/P60 protein  42.06 
 
 		 171 aa  98.6  6e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1923  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 154 aa  98.6  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.468553 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>