More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0751 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0751  NLP/P60 protein  100 
 
 		 173 aa  348  2e-95  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2700  NLP/P60 protein  55.2 
 
 		 188 aa  157  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000637216  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  43.92 
 
 		 424 aa  119  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  41.79 
 
 		 235 aa  105  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  46.67 
 
 		 188 aa  104  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0091  NLP/P60  40.41 
 
 		 170 aa  103  8e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  47.62 
 
 		 319 aa  102  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1344  NLP/P60 protein  47.52 
 
 		 207 aa  102  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2476  NLP/P60 protein  43.81 
 
 		 214 aa  101  5e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.188506  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  41.5 
 
 		 370 aa  101  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  42.61 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  42.61 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  42.61 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  37.01 
 
 		 181 aa  99.8  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0871  NLP/P60 protein  50.94 
 
 		 175 aa  99.8  2e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5044  NLP/P60 family protein  40.68 
 
 		 226 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.982871  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0479  NLP/P60  40.68 
 
 		 225 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  40.95 
 
 		 223 aa  99.8  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2446  NLP/P60 protein  40.94 
 
 		 208 aa  99.4  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1164  NLP/P60 protein  53.92 
 
 		 171 aa  98.6  4e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  40.52 
 
 		 333 aa  98.6  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01906  outer membrane lipoprotein  41.38 
 
 		 221 aa  98.6  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.211693  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3275  NLP/P60 protein  38.67 
 
 		 181 aa  98.6  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.459641  normal  0.880258 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  40.95 
 
 		 221 aa  98.6  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1274  NLP/P60 protein  41.9 
 
 		 207 aa  98.2  5e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.951335  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2888  NLP/P60 protein  43.33 
 
 		 234 aa  98.2  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  40.95 
 
 		 221 aa  97.8  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  35.48 
 
 		 236 aa  97.4  8e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  40.95 
 
 		 223 aa  97.4  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  40.95 
 
 		 223 aa  97.4  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  40.95 
 
 		 223 aa  97.4  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  41.74 
 
 		 208 aa  97.4  8e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1652  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 178 aa  97.4  9e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  40 
 
 		 224 aa  96.7  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  40 
 
 		 234 aa  96.7  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  40 
 
 		 234 aa  96.7  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1637  NLP/P60  36.67 
 
 		 226 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58461  normal  0.048116 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1605  NLP/P60 protein  41.38 
 
 		 279 aa  95.9  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  40 
 
 		 218 aa  96.3  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  40.71 
 
 		 265 aa  96.3  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  40 
 
 		 223 aa  96.7  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  40 
 
 		 218 aa  96.3  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  40 
 
 		 223 aa  96.3  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  40 
 
 		 218 aa  96.3  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  40 
 
 		 218 aa  96.3  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  40 
 
 		 234 aa  96.7  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0919  NLP/P60 protein  37.7 
 
 		 382 aa  95.5  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0475791  normal  0.21921 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1705  NLP/P60 family protein  34.01 
 
 		 242 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2393  putative transmembrane lipoprotein  38.52 
 
 		 404 aa  95.5  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.951834  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1658  hypothetical protein  40.52 
 
 		 287 aa  95.9  3e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.110646  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  38.17 
 
 		 257 aa  95.1  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  37.8 
 
 		 150 aa  95.1  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  42.61 
 
 		 205 aa  95.1  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  40 
 
 		 224 aa  94.7  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2100  NLP/P60 protein  44.14 
 
 		 302 aa  95.1  5e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.660776  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2186  NLP/P60 family lipoprotein  39.34 
 
 		 407 aa  94.4  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1227  NLP/P60 protein  38.84 
 
 		 214 aa  94.7  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1397  NLP/P60 family lipoprotein  39.34 
 
 		 407 aa  94.4  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.929375  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2408  NLP/P60 family lipoprotein  39.34 
 
 		 407 aa  94.4  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.166866  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1160  NLP/P60 family lipoprotein  39.34 
 
 		 407 aa  94.4  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.812731  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1887  NLP/P60 family lipoprotein  39.34 
 
 		 407 aa  94.4  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.850579  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0009  NLP/P60 family lipoprotein  39.34 
 
 		 407 aa  94.4  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30529  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2244  NlpC/P60 family lipoprotein  39.34 
 
 		 404 aa  94.4  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2283  NlpC/P60 family lipoprotein  39.34 
 
 		 404 aa  94.4  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  43.1 
 
 		 150 aa  94  9e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0791  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)-like  46.23 
 
 		 221 aa  93.6  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  39.05 
 
 		 234 aa  94  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1228  NLP/P60 protein  32.09 
 
 		 177 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1267  NLP/P60 protein  38.02 
 
 		 214 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4049  NLP/P60 protein  38.02 
 
 		 212 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  27.98 
 
 		 177 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1669  NLP/P60 protein  38.02 
 
 		 214 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1247  putative cell-wall associated endopeptidase  43.59 
 
 		 257 aa  93.2  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1794  NLP/P60 protein  37.7 
 
 		 418 aa  92.4  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435053  hitchhiker  0.00883906 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  34.42 
 
 		 183 aa  92  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0018  NLP/P60 protein  35.29 
 
 		 188 aa  92  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  40.17 
 
 		 217 aa  92  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  34.75 
 
 		 306 aa  91.7  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  35.58 
 
 		 173 aa  92  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1189  NLP/P60 protein  36.79 
 
 		 249 aa  91.3  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103363  normal  0.0364754 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  30.51 
 
 		 331 aa  91.3  6e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4528  NLP/P60 protein  38.46 
 
 		 370 aa  91.3  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0897  NLP/P60 family protein  40.95 
 
 		 231 aa  91.3  6e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.624146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  30.59 
 
 		 198 aa  91.3  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  34.19 
 
 		 333 aa  90.9  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  39.83 
 
 		 274 aa  90.9  8e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  37.31 
 
 		 193 aa  90.9  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1890  NLP/P60 protein  36.07 
 
 		 363 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00780805  hitchhiker  0.0000000811276 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1670  NLP/P60 protein  30.6 
 
 		 177 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1250  NLP/P60 protein  35.85 
 
 		 248 aa  90.5  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000552171  normal  0.790948 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  38.21 
 
 		 273 aa  90.5  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5167  NLP/P60 family lipoprotein  36.89 
 
 		 364 aa  90.1  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1972  NLP/P60  36.79 
 
 		 212 aa  90.5  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107958  normal  0.172208 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6213  NLP/P60  36.07 
 
 		 363 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935456  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  36.84 
 
 		 205 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  39.82 
 
 		 285 aa  90.1  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1866  NLP/P60 protein  36.07 
 
 		 363 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2420  NLP/P60 protein  35.59 
 
 		 207 aa  90.5  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4966  NLP/P60 protein  37.21 
 
 		 169 aa  90.1  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.774801  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  39.45 
 
 		 202 aa  90.1  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0258261 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>