More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3253 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  100 
 
 		 257 aa  518  1e-146  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  41.75 
 
 		 232 aa  170  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  56.49 
 
 		 265 aa  168  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  45.28 
 
 		 274 aa  132  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 338 aa  128  8.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  48.28 
 
 		 333 aa  125  9e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  35.58 
 
 		 424 aa  123  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  38.1 
 
 		 269 aa  123  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  48.72 
 
 		 391 aa  122  6e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 269 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  43.79 
 
 		 341 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  47.66 
 
 		 216 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  41.57 
 
 		 295 aa  119  4.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 208 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  47.29 
 
 		 150 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  41.22 
 
 		 217 aa  117  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  41.98 
 
 		 298 aa  116  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2041  NLP/P60 protein  35.67 
 
 		 284 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000350881  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  34.78 
 
 		 278 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  43.85 
 
 		 246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  46.96 
 
 		 307 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  47.83 
 
 		 303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  46.56 
 
 		 150 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  43.26 
 
 		 476 aa  112  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  48.03 
 
 		 319 aa  112  7.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  46.72 
 
 		 340 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  40.91 
 
 		 273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1956  NLP/P60 protein  46.84 
 
 		 296 aa  110  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  46.09 
 
 		 246 aa  110  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0781  NLP/P60 protein  32.75 
 
 		 260 aa  110  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1344  NLP/P60 protein  39.74 
 
 		 207 aa  109  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  47.24 
 
 		 235 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01906  outer membrane lipoprotein  47.24 
 
 		 221 aa  108  7.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.211693  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1554  NLP/P60  35.33 
 
 		 208 aa  108  8.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.68889  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  33.13 
 
 		 267 aa  107  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  38.03 
 
 		 188 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3902  NLP/P60 protein  44.07 
 
 		 171 aa  108  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  43.31 
 
 		 285 aa  107  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  36.87 
 
 		 333 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  36.05 
 
 		 205 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1543  NlpC/P60 family protein  29.48 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.179042 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1652  NLP/P60 protein  48.31 
 
 		 178 aa  107  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  42.02 
 
 		 331 aa  107  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  38.5 
 
 		 221 aa  106  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2844  NLP/P60 protein  43.48 
 
 		 259 aa  105  5e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  48.33 
 
 		 1048 aa  105  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1227  NLP/P60 protein  37.1 
 
 		 214 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  40.46 
 
 		 335 aa  105  6e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2365  NLP/P60:sporulation-related protein  31.9 
 
 		 266 aa  105  7e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  46.15 
 
 		 181 aa  105  8e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  40.64 
 
 		 218 aa  105  8e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  40.64 
 
 		 218 aa  105  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  40.64 
 
 		 218 aa  105  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  40.64 
 
 		 218 aa  105  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  43.33 
 
 		 342 aa  105  9e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0433  NLP/P60 protein  43.8 
 
 		 245 aa  105  9e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.895953  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  41.72 
 
 		 234 aa  105  9e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2855  NLP/P60 family protein  39.84 
 
 		 333 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2609  cell wall-associated hydrolase  39.84 
 
 		 333 aa  104  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.652367  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2577  cell wall-associated hydrolase  39.84 
 
 		 333 aa  104  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164117  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  40.64 
 
 		 234 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  40.64 
 
 		 234 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  43.86 
 
 		 341 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  45.45 
 
 		 230 aa  105  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  45.38 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2639  NLP/P60 protein  43.09 
 
 		 349 aa  104  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  40.64 
 
 		 234 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  44.55 
 
 		 342 aa  104  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2658  NLP/P60 family protein  40 
 
 		 333 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2849  NLP/P60 family protein  40 
 
 		 333 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  40.97 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  35.47 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2195  NLP/P60 protein  47.06 
 
 		 168 aa  103  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  47.54 
 
 		 370 aa  103  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0045  NlpC/P60 family domain protein  42.36 
 
 		 174 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000018046  normal  0.424193 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1637  NLP/P60  43.9 
 
 		 226 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58461  normal  0.048116 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  44.55 
 
 		 342 aa  103  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2862  NLP/P60 family protein  39.02 
 
 		 333 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1132  NLP/P60 protein  46.62 
 
 		 556 aa  103  4e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000155845  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  37.33 
 
 		 173 aa  102  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  39.04 
 
 		 221 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  39.75 
 
 		 162 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01625  predicted lipoprotein  39.33 
 
 		 271 aa  102  5e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1985  NLP/P60 protein  39.33 
 
 		 271 aa  102  5e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.778309  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  44.55 
 
 		 346 aa  102  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1868  NlpC/P60 family protein  39.33 
 
 		 271 aa  102  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206609  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  37.58 
 
 		 224 aa  102  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2367  NlpC/P60 family protein  39.33 
 
 		 271 aa  102  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00414236  normal  0.27776 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  39.04 
 
 		 223 aa  102  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1118  NLP/P60 protein  43.36 
 
 		 189 aa  102  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.579853  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01615  hypothetical protein  39.33 
 
 		 271 aa  102  5e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1852  NlpC/P60 family protein  39.33 
 
 		 271 aa  102  5e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000302623  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  42.37 
 
 		 450 aa  102  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1974  NLP/P60 protein  39.33 
 
 		 271 aa  102  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117191 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1734  NlpC/P60 family protein  39.33 
 
 		 271 aa  102  5e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2897  NLP/P60 family protein  39.02 
 
 		 333 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  46.88 
 
 		 388 aa  102  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1936  NLP/P60 protein  43 
 
 		 333 aa  102  7e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.782262  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3648  NLP/P60 protein  40 
 
 		 391 aa  102  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2432  NLP/P60 family protein  39.17 
 
 		 333 aa  102  8e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.899635 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>