More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2178 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_2178  NLP/P60 protein  100 
 
 		 193 aa  395  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2446  NLP/P60 protein  54.12 
 
 		 208 aa  194  7e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2584  NLP/P60 protein  39.59 
 
 		 205 aa  137  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.416294  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2476  NLP/P60 protein  47.06 
 
 		 214 aa  122  3e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.188506  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0791  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)-like  43.2 
 
 		 221 aa  121  6e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1274  NLP/P60 protein  43.22 
 
 		 207 aa  121  7e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.951335  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02105  predicted peptidase, outer membrane lipoprotein  37.99 
 
 		 188 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1482  NLP/P60 protein  37.99 
 
 		 188 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736883  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2324  putative outer membrane lipoprotein  37.99 
 
 		 188 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669952 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2473  putative outer membrane lipoprotein  37.99 
 
 		 188 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.303091  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2313  putative outer membrane lipoprotein  37.99 
 
 		 188 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.871525  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3313  putative outer membrane lipoprotein  37.99 
 
 		 188 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0116683  normal  0.115135 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1472  putative outer membrane lipoprotein  37.99 
 
 		 188 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000135569  normal  0.0170642 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02064  hypothetical protein  37.99 
 
 		 188 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0783  putative outer membrane lipoprotein  37.99 
 
 		 188 aa  120  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  46.15 
 
 		 188 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2451  putative outer membrane lipoprotein  37.16 
 
 		 190 aa  118  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000518421 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2454  putative outer membrane lipoprotein  37.16 
 
 		 190 aa  118  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00195047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2565  putative outer membrane lipoprotein  37.16 
 
 		 190 aa  118  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.159761  hitchhiker  0.000144355 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2771  putative outer membrane lipoprotein  38.55 
 
 		 189 aa  118  7e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.805322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2420  NLP/P60 protein  38.61 
 
 		 207 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0897  NLP/P60 family protein  46.22 
 
 		 231 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.624146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1293  NLP/P60  36.56 
 
 		 205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0496746  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  38.15 
 
 		 181 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2335  putative outer membrane lipoprotein  46.61 
 
 		 191 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1344  NLP/P60 protein  44.55 
 
 		 207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2707  putative outer membrane lipoprotein  37.43 
 
 		 194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0958  NLP/P60 protein  38.89 
 
 		 167 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.414472  normal  0.258055 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2784  putative outer membrane lipoprotein  37.43 
 
 		 194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1501  putative outer membrane lipoprotein  37.72 
 
 		 172 aa  112  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  46.67 
 
 		 424 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2363  putative outer membrane lipoprotein  42.06 
 
 		 147 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000243067  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2408  putative outer membrane lipoprotein  42.06 
 
 		 147 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210623 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2819  NLP/P60 protein  39.61 
 
 		 159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1118  NLP/P60 protein  44.35 
 
 		 189 aa  109  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.579853  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  46.02 
 
 		 342 aa  108  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  42.28 
 
 		 342 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0170  NLP/P60 protein  37.14 
 
 		 184 aa  107  8.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1646  putative outer membrane lipoprotein  44.44 
 
 		 194 aa  107  8.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79512  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  42.28 
 
 		 342 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  43.36 
 
 		 341 aa  107  9.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3244  putative outer membrane lipoprotein  35.93 
 
 		 191 aa  107  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0124301 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1917  putative outer membrane lipoprotein  44.44 
 
 		 193 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  47.06 
 
 		 255 aa  105  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2431  putative outer membrane lipoprotein  44.07 
 
 		 191 aa  105  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1454  putative lipoprotein nlpC  40.48 
 
 		 154 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.297729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1830  NlpC (ORF-17)  40.48 
 
 		 154 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1471  hypothetical protein  40.48 
 
 		 154 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.235317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2002  putative lipoprotein nlpC  40.48 
 
 		 154 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.303201 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1438  NlpC (ORF-17)  40.48 
 
 		 154 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0813186 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3683  NLP/P60  43.9 
 
 		 181 aa  105  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1637  NLP/P60  36.22 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58461  normal  0.048116 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1734  NLP/P60 protein  39.88 
 
 		 154 aa  104  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0428  NLP/P60 protein  35.12 
 
 		 173 aa  103  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1638  NLP/P60  38.73 
 
 		 178 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52996  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  33.16 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2639  NLP/P60 protein  39.86 
 
 		 349 aa  102  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  37.06 
 
 		 216 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3056  NLP/P60 protein  43.86 
 
 		 347 aa  102  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000688808  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1884  NLP/P60 protein  41.28 
 
 		 174 aa  102  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.715704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2772  NLP/P60 protein  38.69 
 
 		 157 aa  102  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  42.24 
 
 		 246 aa  102  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1659  hypothetical protein  38.92 
 
 		 209 aa  102  4e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.255203  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  35.19 
 
 		 177 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1606  NLP/P60 protein  38.92 
 
 		 209 aa  101  7e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1142  lipoprotein NlpC  34.34 
 
 		 166 aa  101  7e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0142689  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  43.64 
 
 		 246 aa  100  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2466  NLP/P60 protein  35.33 
 
 		 162 aa  100  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.291366  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0595  NLP/P60 protein  36.76 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  42.98 
 
 		 346 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1912  lipoprotein, NlpC/P60 family  40.58 
 
 		 154 aa  99.8  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1387  putative lipoprotein  34.57 
 
 		 162 aa  99.4  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0376898  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01677  predicted lipoprotein  40.58 
 
 		 154 aa  99  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0294155  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1934  NLP/P60 protein  40.58 
 
 		 154 aa  99  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0636747  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1669  NLP/P60 protein  34.02 
 
 		 214 aa  99  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1923  NLP/P60 protein  40.58 
 
 		 154 aa  99  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.468553 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2426  lipoprotein, NlpC/P60 family  40.58 
 
 		 154 aa  99  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0828  NLP/P60 protein  44.07 
 
 		 240 aa  99  4e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000898283  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1482  NlpC/P60 family lipoprotein  40.58 
 
 		 154 aa  99  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1927  NlpC/P60 family lipoprotein  40.58 
 
 		 154 aa  99  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00858399  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4049  NLP/P60 protein  34.02 
 
 		 212 aa  99  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1788  NlpC/P60 family lipoprotein  40.58 
 
 		 154 aa  99  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01666  hypothetical protein  40.58 
 
 		 154 aa  99  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0178073  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  44.35 
 
 		 235 aa  98.6  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3992  NLP/P60 protein  41.86 
 
 		 196 aa  98.6  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000856339  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02243  hypothetical protein  34.15 
 
 		 162 aa  98.2  7e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3984  NLP/P60 protein  36.71 
 
 		 173 aa  97.8  9e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  31.12 
 
 		 224 aa  97.8  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  35.26 
 
 		 177 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1267  NLP/P60 protein  33.67 
 
 		 214 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  37.35 
 
 		 173 aa  97.4  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1014  NLP/P60 protein  40.19 
 
 		 211 aa  97.1  1e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2161  NLP/P60 protein  42.61 
 
 		 154 aa  97.1  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.854022 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1628  NLP/P60 protein  46.3 
 
 		 155 aa  97.4  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  40.31 
 
 		 205 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  40.34 
 
 		 224 aa  97.4  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4200  NLP/P60 protein  39.02 
 
 		 156 aa  97.1  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  40.34 
 
 		 223 aa  96.3  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0781  NLP/P60 protein  37.43 
 
 		 260 aa  97.1  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4872  NLP/P60 protein  38.76 
 
 		 183 aa  96.3  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>