More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0878 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  100 
 
 		 246 aa  497  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  89.84 
 
 		 246 aa  426  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  48.53 
 
 		 342 aa  175  6e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  60.45 
 
 		 342 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  47.13 
 
 		 346 aa  169  4e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  58.73 
 
 		 342 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  59.06 
 
 		 341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2639  NLP/P60 protein  60.5 
 
 		 349 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3056  NLP/P60 protein  58.82 
 
 		 347 aa  155  4e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000688808  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0828  NLP/P60 protein  55.12 
 
 		 240 aa  137  1e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000898283  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  50.88 
 
 		 265 aa  134  9e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0958  NLP/P60 protein  53.39 
 
 		 202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000015981  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  51.33 
 
 		 391 aa  125  8.000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0173  NlpC/P60 family protein  45.65 
 
 		 458 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  50 
 
 		 424 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  40.79 
 
 		 298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  46.67 
 
 		 476 aa  120  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0091  NLP/P60  48.67 
 
 		 170 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  43.51 
 
 		 285 aa  119  4.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  48.28 
 
 		 274 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  47.41 
 
 		 217 aa  114  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  42.98 
 
 		 267 aa  112  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  47.5 
 
 		 301 aa  112  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1159  NLP/P60 protein  44.6 
 
 		 210 aa  112  7.000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.944138  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  47.01 
 
 		 183 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  40.71 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  40.67 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  37.29 
 
 		 224 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2830  NLP/P60 protein  45.97 
 
 		 220 aa  110  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.704353  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  46.55 
 
 		 333 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0958  NLP/P60 protein  37.58 
 
 		 167 aa  109  4.0000000000000004e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.414472  normal  0.258055 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  46.34 
 
 		 192 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0062  NLP/P60 protein  42.95 
 
 		 154 aa  108  5e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0063  NLP/P60 protein  42.95 
 
 		 164 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.694655  hitchhiker  0.00200651 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2431  putative outer membrane lipoprotein  48.28 
 
 		 191 aa  108  7.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02243  hypothetical protein  43.38 
 
 		 162 aa  108  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2091  NLP/P60 protein  46.34 
 
 		 192 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.315099  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0058  NLP/P60 protein  42.57 
 
 		 164 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0061  NLP/P60 family lipoprotein  41.61 
 
 		 154 aa  108  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2365  NLP/P60:sporulation-related protein  42.15 
 
 		 266 aa  107  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  40 
 
 		 269 aa  107  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4296  NLP/P60 protein  42.57 
 
 		 164 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.346407  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2041  NLP/P60 protein  42.98 
 
 		 284 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000350881  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  46.9 
 
 		 235 aa  106  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1274  NLP/P60 protein  37.84 
 
 		 207 aa  106  4e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.951335  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  44.92 
 
 		 232 aa  105  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  42.15 
 
 		 269 aa  105  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2454  putative outer membrane lipoprotein  45.53 
 
 		 190 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00195047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2451  putative outer membrane lipoprotein  45.53 
 
 		 190 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000518421 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  45.9 
 
 		 205 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2565  putative outer membrane lipoprotein  45.53 
 
 		 190 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.159761  hitchhiker  0.000144355 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  43.08 
 
 		 181 aa  105  7e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2125  NLP/P60  45 
 
 		 228 aa  105  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839892  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  45.9 
 
 		 193 aa  105  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2142  NLP/P60  45 
 
 		 226 aa  105  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0634754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1250  NLP/P60 protein  45.9 
 
 		 248 aa  105  8e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000552171  normal  0.790948 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  42.28 
 
 		 307 aa  105  8e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  36.16 
 
 		 223 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  36.16 
 
 		 223 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2408  putative outer membrane lipoprotein  44.19 
 
 		 147 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210623 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  35.64 
 
 		 221 aa  105  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2363  putative outer membrane lipoprotein  44.19 
 
 		 147 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000243067  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3313  putative outer membrane lipoprotein  45.53 
 
 		 188 aa  104  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0116683  normal  0.115135 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02105  predicted peptidase, outer membrane lipoprotein  45.53 
 
 		 188 aa  104  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1482  NLP/P60 protein  45.53 
 
 		 188 aa  104  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736883  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02064  hypothetical protein  45.53 
 
 		 188 aa  104  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2473  putative outer membrane lipoprotein  45.53 
 
 		 188 aa  104  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.303091  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0783  putative outer membrane lipoprotein  45.53 
 
 		 188 aa  104  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2313  putative outer membrane lipoprotein  45.53 
 
 		 188 aa  104  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.871525  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3689  NLP/P60 family lipoprotein  39.19 
 
 		 179 aa  104  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  36.16 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1247  putative cell-wall associated endopeptidase  45.76 
 
 		 257 aa  104  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1112  NLP/P60 protein  41.3 
 
 		 215 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.893499 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1472  putative outer membrane lipoprotein  45.53 
 
 		 188 aa  104  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000135569  normal  0.0170642 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2324  putative outer membrane lipoprotein  45.53 
 
 		 188 aa  104  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669952 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  45.83 
 
 		 370 aa  104  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1177  putative transmembrane protein  45.83 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0196017  normal  0.188955 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1501  putative outer membrane lipoprotein  46.61 
 
 		 172 aa  103  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2784  putative outer membrane lipoprotein  45.53 
 
 		 194 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1201  NLP/P60  46.9 
 
 		 169 aa  103  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1018  NLP/P60 protein  41.3 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.121174  normal  0.0409551 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0052  NLP/P60 protein  41.61 
 
 		 154 aa  103  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00304715  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0061  NLP/P60 protein  41.61 
 
 		 159 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000041841 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0059  NLP/P60 protein  41.61 
 
 		 159 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.560848  hitchhiker  0.000388338 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2707  putative outer membrane lipoprotein  45.53 
 
 		 194 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0063  NLP/P60 protein  41.61 
 
 		 159 aa  104  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000156196 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2519  cell wall-associated hydrolase-like protein  45.24 
 
 		 225 aa  104  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2335  putative outer membrane lipoprotein  46.55 
 
 		 191 aa  103  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1314  lipoprotein transmembrane  45.08 
 
 		 258 aa  103  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4200  NLP/P60 protein  41.09 
 
 		 156 aa  102  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1554  NLP/P60  41.3 
 
 		 208 aa  102  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.68889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  41.32 
 
 		 188 aa  102  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2178  NLP/P60 protein  42.24 
 
 		 193 aa  102  5e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  46.49 
 
 		 150 aa  102  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1293  NLP/P60  43.64 
 
 		 205 aa  102  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0496746  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3244  putative outer membrane lipoprotein  43.9 
 
 		 191 aa  102  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0124301 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1189  NLP/P60 protein  45.9 
 
 		 249 aa  102  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103363  normal  0.0364754 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  44.26 
 
 		 255 aa  102  6e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2166  NLP/P60 protein  47.41 
 
 		 194 aa  102  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343346  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2771  putative outer membrane lipoprotein  44.72 
 
 		 189 aa  102  7e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.805322  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>