More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0869 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  100 
 
 		 342 aa  691    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  72.22 
 
 		 341 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  58.21 
 
 		 346 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  60.9 
 
 		 342 aa  403  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  59.7 
 
 		 342 aa  397  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2639  NLP/P60 protein  53.87 
 
 		 349 aa  332  5e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3056  NLP/P60 protein  53.75 
 
 		 347 aa  332  6e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000688808  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  58.73 
 
 		 246 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  58.73 
 
 		 246 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  31.63 
 
 		 285 aa  157  3e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  34.63 
 
 		 301 aa  150  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  32.54 
 
 		 298 aa  146  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  37.28 
 
 		 217 aa  145  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3022  NLP/P60 protein  31.48 
 
 		 289 aa  144  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 255 aa  138  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0828  NLP/P60 protein  48 
 
 		 240 aa  137  2e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000898283  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  29.76 
 
 		 476 aa  129  6e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1954  NLP/P60 protein  33.11 
 
 		 384 aa  128  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0958  NLP/P60 protein  54.17 
 
 		 202 aa  127  4.0000000000000003e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000015981  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  50.44 
 
 		 265 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0091  NLP/P60  50.42 
 
 		 170 aa  123  4e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  34.22 
 
 		 216 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  30.2 
 
 		 303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  33.03 
 
 		 208 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1247  putative cell-wall associated endopeptidase  28.04 
 
 		 257 aa  120  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  31.55 
 
 		 341 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  40.91 
 
 		 278 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1159  NLP/P60 protein  50.83 
 
 		 210 aa  118  9.999999999999999e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.944138  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  45 
 
 		 424 aa  117  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  47.32 
 
 		 391 aa  117  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1554  NLP/P60  33.19 
 
 		 208 aa  115  7.999999999999999e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.68889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0173  NlpC/P60 family protein  39.16 
 
 		 458 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  43.9 
 
 		 274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  45.45 
 
 		 177 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  45.45 
 
 		 198 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  45.31 
 
 		 224 aa  114  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  31.21 
 
 		 295 aa  112  6e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  28.7 
 
 		 338 aa  112  9e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  47.06 
 
 		 223 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  48.31 
 
 		 333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  47.37 
 
 		 218 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  44.09 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  46.22 
 
 		 223 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  47.37 
 
 		 218 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  47.37 
 
 		 234 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  49.09 
 
 		 150 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  47.37 
 
 		 234 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2365  NLP/P60:sporulation-related protein  45.61 
 
 		 266 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  47.37 
 
 		 234 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  48.25 
 
 		 221 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  46.22 
 
 		 223 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  46.22 
 
 		 223 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  47.37 
 
 		 234 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  47.37 
 
 		 218 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  47.37 
 
 		 218 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  45.61 
 
 		 269 aa  110  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  48.25 
 
 		 221 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  44.09 
 
 		 223 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  44.74 
 
 		 267 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0170  NLP/P60 protein  42.19 
 
 		 184 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  45.61 
 
 		 269 aa  110  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  44.54 
 
 		 224 aa  109  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  44.63 
 
 		 150 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  40.56 
 
 		 235 aa  108  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2178  NLP/P60 protein  46.02 
 
 		 193 aa  108  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1201  NLP/P60  45.22 
 
 		 169 aa  108  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1637  NLP/P60  49.19 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58461  normal  0.048116 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2454  putative outer membrane lipoprotein  46.36 
 
 		 190 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00195047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2451  putative outer membrane lipoprotein  46.36 
 
 		 190 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000518421 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2565  putative outer membrane lipoprotein  46.36 
 
 		 190 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.159761  hitchhiker  0.000144355 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2408  putative outer membrane lipoprotein  46.36 
 
 		 147 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210623 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2363  putative outer membrane lipoprotein  46.36 
 
 		 147 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000243067  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2041  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 284 aa  107  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000350881  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  41.67 
 
 		 230 aa  106  6e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2324  putative outer membrane lipoprotein  45.45 
 
 		 188 aa  105  8e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669952 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2313  putative outer membrane lipoprotein  45.45 
 
 		 188 aa  105  8e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.871525  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02105  predicted peptidase, outer membrane lipoprotein  45.45 
 
 		 188 aa  105  8e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1482  NLP/P60 protein  45.45 
 
 		 188 aa  105  8e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736883  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02243  hypothetical protein  48.62 
 
 		 162 aa  105  8e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3313  putative outer membrane lipoprotein  45.45 
 
 		 188 aa  105  8e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0116683  normal  0.115135 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0783  putative outer membrane lipoprotein  45.45 
 
 		 188 aa  105  8e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1472  putative outer membrane lipoprotein  45.45 
 
 		 188 aa  105  8e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000135569  normal  0.0170642 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2473  putative outer membrane lipoprotein  45.45 
 
 		 188 aa  105  8e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.303091  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02064  hypothetical protein  45.45 
 
 		 188 aa  105  8e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1669  NLP/P60 protein  46 
 
 		 214 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1177  putative transmembrane protein  47.83 
 
 		 222 aa  105  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0196017  normal  0.188955 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2142  NLP/P60  44.54 
 
 		 226 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0634754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  45.38 
 
 		 183 aa  105  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  43.7 
 
 		 257 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  43.48 
 
 		 181 aa  104  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2335  putative outer membrane lipoprotein  45.95 
 
 		 191 aa  104  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1267  NLP/P60 protein  51.67 
 
 		 214 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4049  NLP/P60 protein  51.67 
 
 		 212 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2125  NLP/P60  44.54 
 
 		 228 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839892  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1705  NLP/P60 family protein  45.6 
 
 		 242 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1679  NLP/P60 protein  39.1 
 
 		 210 aa  103  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1112  NLP/P60 protein  46.49 
 
 		 215 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.893499 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1018  NLP/P60 protein  46.49 
 
 		 215 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.121174  normal  0.0409551 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  42.98 
 
 		 232 aa  103  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>