More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2128 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  100 
 
 		 235 aa  476  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  50.93 
 
 		 370 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  45.15 
 
 		 424 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  44.88 
 
 		 319 aa  154  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1956  NLP/P60 protein  37.44 
 
 		 296 aa  131  6.999999999999999e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0747  NLP/P60 protein  36.49 
 
 		 298 aa  129  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000792578  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2017  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 536 aa  125  6e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.474847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  33.94 
 
 		 532 aa  122  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  42.36 
 
 		 265 aa  122  7e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4127  NLP/P60 protein  32.58 
 
 		 532 aa  121  9e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2700  NLP/P60 protein  49.18 
 
 		 188 aa  116  3e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000637216  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  46.1 
 
 		 295 aa  113  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1652  NLP/P60 protein  41.18 
 
 		 178 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  47.24 
 
 		 257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  42.57 
 
 		 232 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  44.09 
 
 		 298 aa  109  5e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  40.56 
 
 		 342 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1189  NLP/P60 protein  43.94 
 
 		 249 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103363  normal  0.0364754 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  43.9 
 
 		 333 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1250  NLP/P60 protein  43.2 
 
 		 248 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000552171  normal  0.790948 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  42.98 
 
 		 341 aa  107  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  42.54 
 
 		 150 aa  107  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1314  lipoprotein transmembrane  42.86 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  47.79 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  46.9 
 
 		 246 aa  106  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  43.09 
 
 		 150 aa  105  6e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  30.99 
 
 		 335 aa  105  6e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  48.28 
 
 		 303 aa  105  7e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0751  NLP/P60 protein  41.79 
 
 		 173 aa  105  8e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  44.8 
 
 		 255 aa  104  9e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  47.97 
 
 		 274 aa  104  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  40 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  44.63 
 
 		 391 aa  103  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2609  cell wall-associated hydrolase  38.64 
 
 		 333 aa  103  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.652367  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2577  cell wall-associated hydrolase  38.64 
 
 		 333 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164117  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2855  NLP/P60 family protein  38.64 
 
 		 333 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  42.4 
 
 		 1048 aa  103  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2639  NLP/P60 protein  40.83 
 
 		 349 aa  104  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  39.71 
 
 		 181 aa  103  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2520  NLP/P60 family protein  39.46 
 
 		 365 aa  102  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.509627  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  39.86 
 
 		 346 aa  102  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2149  NLP/P60 protein  39.46 
 
 		 365 aa  102  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000521128  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2888  NLP/P60 protein  45.31 
 
 		 234 aa  102  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  32.86 
 
 		 342 aa  102  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  35.03 
 
 		 342 aa  102  7e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2658  NLP/P60 family protein  37.88 
 
 		 333 aa  101  8e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2849  NLP/P60 family protein  37.88 
 
 		 333 aa  101  8e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2897  NLP/P60 family protein  37.88 
 
 		 333 aa  101  8e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  43.85 
 
 		 217 aa  101  9e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1972  NLP/P60  41.67 
 
 		 212 aa  101  9e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107958  normal  0.172208 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2862  NLP/P60 family protein  37.88 
 
 		 333 aa  100  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1936  NLP/P60 protein  35.17 
 
 		 333 aa  101  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.782262  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  39.73 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2887  NLP/P60 protein  44.07 
 
 		 179 aa  100  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.171139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  37.5 
 
 		 235 aa  100  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1999  NLP/P60  37.25 
 
 		 226 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.762084  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  41.22 
 
 		 193 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2432  NLP/P60 family protein  37.12 
 
 		 333 aa  99.4  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.899635 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2878  NLP/P60 family protein  37.12 
 
 		 333 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0584446  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1493  NLP/P60 protein  32.2 
 
 		 418 aa  99.4  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000786314  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  45.38 
 
 		 476 aa  99.4  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3768  NLP/P60 protein  28.78 
 
 		 575 aa  99  6e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000116427  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3648  NLP/P60 protein  29.8 
 
 		 391 aa  99  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2651  NLP/P60 protein  36.36 
 
 		 333 aa  99  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  38.46 
 
 		 216 aa  98.6  7e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  36.99 
 
 		 338 aa  98.6  7e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2178  NLP/P60 protein  44.35 
 
 		 193 aa  98.6  7e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5353  enterotoxin  29.38 
 
 		 582 aa  98.2  9e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000381193  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4384  NLP/P60 protein  30.32 
 
 		 556 aa  97.8  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000240419  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  42.64 
 
 		 183 aa  97.8  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2446  NLP/P60 protein  44.83 
 
 		 208 aa  98.2  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1247  putative cell-wall associated endopeptidase  42.98 
 
 		 257 aa  97.4  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1659  hypothetical protein  40.16 
 
 		 209 aa  96.7  3e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.255203  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  45.22 
 
 		 223 aa  96.3  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1606  NLP/P60 protein  40.16 
 
 		 209 aa  96.7  3e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4930  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase; enterotoxin  28.85 
 
 		 579 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000272032  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  45.22 
 
 		 223 aa  96.3  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  45.22 
 
 		 223 aa  96.3  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  43.59 
 
 		 188 aa  96.7  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  42.31 
 
 		 341 aa  96.3  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5406  putative cell wall hydrolase  28.44 
 
 		 582 aa  95.9  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02243  hypothetical protein  39.33 
 
 		 162 aa  96.3  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5084  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, C-terminus  29.19 
 
 		 341 aa  95.5  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.143081  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  39.01 
 
 		 177 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  39.01 
 
 		 198 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01906  outer membrane lipoprotein  42.86 
 
 		 221 aa  95.5  7e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.211693  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  44.35 
 
 		 224 aa  95.5  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4915  cell wall hydrolase; N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.54 
 
 		 580 aa  95.1  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  9.30619e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0828  NLP/P60 protein  42.28 
 
 		 240 aa  94.7  9e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000898283  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02105  predicted peptidase, outer membrane lipoprotein  39.58 
 
 		 188 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1482  NLP/P60 protein  39.58 
 
 		 188 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736883  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0783  putative outer membrane lipoprotein  39.58 
 
 		 188 aa  94.4  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2313  putative outer membrane lipoprotein  39.58 
 
 		 188 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.871525  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1472  putative outer membrane lipoprotein  39.58 
 
 		 188 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000135569  normal  0.0170642 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1747  NLP/P60 protein  42.52 
 
 		 174 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2324  putative outer membrane lipoprotein  39.58 
 
 		 188 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669952 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02064  hypothetical protein  39.58 
 
 		 188 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1293  NLP/P60  36.43 
 
 		 205 aa  94.7  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0496746  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3313  putative outer membrane lipoprotein  39.58 
 
 		 188 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0116683  normal  0.115135 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2473  putative outer membrane lipoprotein  39.58 
 
 		 188 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.303091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>