More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2365 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_2365  NLP/P60:sporulation-related protein  100 
 
 
266 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  73.03 
 
 
267 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  68.25 
 
 
278 aa  374  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  64.91 
 
 
269 aa  353  2e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  64.53 
 
 
269 aa  350  1e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  54.72 
 
 
307 aa  332  5e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2041  NLP/P60 protein  55.12 
 
 
284 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000350881  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  38.37 
 
 
273 aa  187  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  35.56 
 
 
224 aa  122  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  35.2 
 
 
224 aa  121  9e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  35.39 
 
 
223 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  35.39 
 
 
223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  41.03 
 
 
234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  34.22 
 
 
221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  34.44 
 
 
223 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  34.44 
 
 
223 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  34.44 
 
 
223 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  44.74 
 
 
274 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  46.9 
 
 
234 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  46.9 
 
 
234 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  46.9 
 
 
234 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  46.9 
 
 
218 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  46.9 
 
 
218 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  46.9 
 
 
218 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  46.9 
 
 
218 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  46.9 
 
 
221 aa  118  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  38.69 
 
 
265 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3968  NLP/P60 protein  45.61 
 
 
211 aa  117  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12193  normal  0.0821241 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  46.02 
 
 
223 aa  116  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  48.21 
 
 
181 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  40.79 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1201  NLP/P60  36.55 
 
 
169 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1543  NlpC/P60 family protein  32.59 
 
 
275 aa  113  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.179042 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2830  NLP/P60 protein  42.24 
 
 
220 aa  113  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.704353  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3683  NLP/P60  47.32 
 
 
181 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  43.86 
 
 
192 aa  112  5e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  39.57 
 
 
230 aa  112  5e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  41.33 
 
 
177 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2149  NLP/P60 protein  45.13 
 
 
365 aa  112  9e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000521128  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2291  NLP/P60 protein  46.55 
 
 
242 aa  111  9e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2520  NLP/P60 family protein  45.13 
 
 
365 aa  112  9e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.509627  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01625  predicted lipoprotein  43.75 
 
 
271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1985  NLP/P60 protein  43.75 
 
 
271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.778309  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1852  NlpC/P60 family protein  43.75 
 
 
271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000302623  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0433  NLP/P60 protein  42.34 
 
 
245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.895953  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1734  NlpC/P60 family protein  43.75 
 
 
271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01615  hypothetical protein  43.75 
 
 
271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1974  NLP/P60 protein  43.75 
 
 
271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117191 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2367  NlpC/P60 family protein  43.75 
 
 
271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00414236  normal  0.27776 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1868  NlpC/P60 family protein  43.75 
 
 
271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206609  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2091  NLP/P60 protein  43.86 
 
 
192 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.315099  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  43.36 
 
 
183 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  45.61 
 
 
342 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  42.48 
 
 
476 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  45.05 
 
 
198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  45.05 
 
 
177 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1670  NLP/P60 protein  41.38 
 
 
177 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2186  NLP/P60 family lipoprotein  46.9 
 
 
407 aa  110  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  44.74 
 
 
391 aa  110  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  39.42 
 
 
342 aa  110  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  40.16 
 
 
205 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2393  putative transmembrane lipoprotein  46.02 
 
 
404 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.951834  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2166  NLP/P60 protein  43.1 
 
 
194 aa  109  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343346  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1794  NLP/P60 protein  46.02 
 
 
418 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435053  hitchhiker  0.00883906 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0184  NLP/P60  42.73 
 
 
174 aa  109  5e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2667  peptidace C40 NLP/P60  42.73 
 
 
187 aa  109  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.411217  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1742  NlpC/P60 family protein  43.75 
 
 
273 aa  108  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000022854  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1250  NLP/P60 protein  45.45 
 
 
248 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000552171  normal  0.790948 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2639  NLP/P60 protein  33.97 
 
 
349 aa  108  7.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1528  NlpC/P60 family protein  43.75 
 
 
273 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1268  NLP/P60 protein  40.69 
 
 
177 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.200264 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1602  NlpC/P60 family protein  43.75 
 
 
273 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1911  NlpC/P60 family protein  43.75 
 
 
273 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.569551  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1542  NlpC/P60 family protein  43.75 
 
 
273 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0237599  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2244  NlpC/P60 family lipoprotein  46.02 
 
 
404 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5044  NLP/P60 family protein  42.28 
 
 
226 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.982871  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1397  NLP/P60 family lipoprotein  46.02 
 
 
407 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.929375  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2408  NLP/P60 family lipoprotein  46.02 
 
 
407 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.166866  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2283  NlpC/P60 family lipoprotein  46.02 
 
 
404 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  39.6 
 
 
173 aa  107  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  44.74 
 
 
341 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  42.15 
 
 
246 aa  107  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1160  NLP/P60 family lipoprotein  46.02 
 
 
407 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.812731  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  38.69 
 
 
342 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  42.73 
 
 
202 aa  107  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1887  NLP/P60 family lipoprotein  46.02 
 
 
407 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.850579  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0009  NLP/P60 family lipoprotein  46.02 
 
 
407 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30529  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1228  NLP/P60 protein  39.73 
 
 
177 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771322  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0479  NLP/P60  41.67 
 
 
225 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  44.74 
 
 
150 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2142  NLP/P60  45.45 
 
 
226 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0634754  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1717  NLP/P60 protein  43.75 
 
 
324 aa  107  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00794283  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1314  lipoprotein transmembrane  46.36 
 
 
258 aa  107  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1407  NLP/P60 protein  45.13 
 
 
369 aa  107  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.374528 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2321  NLP/P60 protein  44.04 
 
 
266 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1638  NLP/P60  44.64 
 
 
178 aa  106  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52996  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6213  NLP/P60  46.02 
 
 
363 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935456  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48790  putative lipoprotein  44.64 
 
 
177 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.006644  hitchhiker  0.0000000144437 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1866  NLP/P60 protein  46.02 
 
 
363 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  43.36 
 
 
246 aa  107  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>