More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0184 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0184  NLP/P60  100 
 
 		 174 aa  354  3.9999999999999996e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  50.94 
 
 		 230 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2365  NLP/P60:sporulation-related protein  42.73 
 
 		 266 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01625  predicted lipoprotein  40.46 
 
 		 271 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1985  NLP/P60 protein  40.46 
 
 		 271 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.778309  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1543  NlpC/P60 family protein  40.46 
 
 		 275 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.179042 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1868  NlpC/P60 family protein  40.46 
 
 		 271 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206609  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1734  NlpC/P60 family protein  40.46 
 
 		 271 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1852  NlpC/P60 family protein  40.46 
 
 		 271 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000302623  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1974  NLP/P60 protein  40.46 
 
 		 271 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117191 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2367  NlpC/P60 family protein  40.46 
 
 		 271 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00414236  normal  0.27776 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01615  hypothetical protein  40.46 
 
 		 271 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  44.55 
 
 		 267 aa  107  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  42.34 
 
 		 269 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  43.97 
 
 		 205 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1602  NlpC/P60 family protein  40.46 
 
 		 273 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  42.31 
 
 		 173 aa  106  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1542  NlpC/P60 family protein  40.46 
 
 		 273 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0237599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1911  NlpC/P60 family protein  40.46 
 
 		 273 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.569551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  42.34 
 
 		 269 aa  106  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1742  NlpC/P60 family protein  40.46 
 
 		 273 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000022854  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  41.44 
 
 		 307 aa  107  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1528  NlpC/P60 family protein  40.46 
 
 		 273 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5044  NLP/P60 family protein  46.49 
 
 		 226 aa  106  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.982871  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0479  NLP/P60  46.49 
 
 		 225 aa  106  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  40.52 
 
 		 278 aa  105  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1606  NLP/P60 protein  38.24 
 
 		 209 aa  105  4e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1659  hypothetical protein  38.24 
 
 		 209 aa  104  5e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.255203  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1314  lipoprotein transmembrane  38.73 
 
 		 258 aa  104  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2197  NLP/P60 protein  35.14 
 
 		 273 aa  104  7e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.369734  hitchhiker  0.00000685507 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2570  NlpC/P60 family lipoprotein  41.96 
 
 		 283 aa  102  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1250  NLP/P60 protein  39.38 
 
 		 248 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000552171  normal  0.790948 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  43.97 
 
 		 208 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  43.97 
 
 		 208 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01907  lipoprotein  47.37 
 
 		 133 aa  102  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.324405  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  43.97 
 
 		 208 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2888  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 234 aa  102  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1757  NlpC/P60 family lipoprotein  41.96 
 
 		 283 aa  101  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156191  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2671  NLP/P60 protein  35.81 
 
 		 283 aa  101  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.179494  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2387  NLP/P60 protein  42.73 
 
 		 283 aa  100  9e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.05451  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  44.07 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1864  NLP/P60 protein  41.07 
 
 		 283 aa  100  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.617955  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  36.88 
 
 		 198 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  38.36 
 
 		 181 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  36.88 
 
 		 177 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1792  NLP/P60 protein  42.73 
 
 		 256 aa  99  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.851858  normal  0.0301658 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2667  peptidace C40 NLP/P60  44.83 
 
 		 187 aa  99  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.411217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1972  NLP/P60  45.74 
 
 		 212 aa  99  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107958  normal  0.172208 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2041  NLP/P60 protein  39.64 
 
 		 284 aa  99  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000350881  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2887  NLP/P60 protein  45.69 
 
 		 179 aa  98.2  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.171139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  39.83 
 
 		 273 aa  97.8  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  39.73 
 
 		 388 aa  97.1  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  33.97 
 
 		 150 aa  96.7  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2830  NLP/P60 protein  42.61 
 
 		 220 aa  97.1  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.704353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  43.48 
 
 		 192 aa  96.3  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  40.8 
 
 		 202 aa  95.9  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2091  NLP/P60 protein  43.48 
 
 		 192 aa  96.3  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.315099  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3683  NLP/P60  42.74 
 
 		 181 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  49.48 
 
 		 327 aa  95.5  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3968  NLP/P60 protein  43.48 
 
 		 211 aa  95.5  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12193  normal  0.0821241 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1300  NLP/P60 protein  35.33 
 
 		 176 aa  95.5  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  50 
 
 		 308 aa  95.5  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1717  NLP/P60 protein  41.82 
 
 		 324 aa  95.5  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00794283  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1684  NLP/P60 protein  42.73 
 
 		 356 aa  95.1  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  32.68 
 
 		 150 aa  94.7  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0199  NLP/P60 protein  35.1 
 
 		 191 aa  94.7  6e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1189  NLP/P60 protein  40 
 
 		 249 aa  94  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103363  normal  0.0364754 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01906  outer membrane lipoprotein  42.37 
 
 		 221 aa  93.2  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.211693  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1504  NLP/P60 protein  41.09 
 
 		 188 aa  93.6  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0399794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1638  NLP/P60  42.74 
 
 		 178 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52996  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1828  lipoprotein, NLP/P60 family  41.09 
 
 		 188 aa  93.6  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.996382  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  43.9 
 
 		 232 aa  92.8  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  43.1 
 
 		 301 aa  92.4  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0018  NLP/P60 protein  42.74 
 
 		 188 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0045  NlpC/P60 family domain protein  41.88 
 
 		 174 aa  92.4  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000018046  normal  0.424193 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0926  Tn916, NLP/P60 family protein  44.44 
 
 		 333 aa  91.7  4e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  40.87 
 
 		 265 aa  91.7  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  38.26 
 
 		 224 aa  91.7  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2519  cell wall-associated hydrolase-like protein  41.88 
 
 		 225 aa  91.7  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  36.94 
 
 		 177 aa  91.7  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0019  NLP/P60 protein  48.08 
 
 		 160 aa  91.3  6e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0865382  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  46.79 
 
 		 236 aa  90.9  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4179  putative lipoprotein  40.14 
 
 		 197 aa  91.3  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000450162  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0001  NLP/P60 protein  48.08 
 
 		 160 aa  91.3  7e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.309085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1605  NLP/P60 protein  35.98 
 
 		 279 aa  90.9  8e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2100  NLP/P60  40.87 
 
 		 201 aa  90.9  8e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.995227  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  46.96 
 
 		 391 aa  90.9  9e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1658  hypothetical protein  41.53 
 
 		 287 aa  90.9  9e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.110646  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0828  NLP/P60 protein  42.45 
 
 		 240 aa  90.9  9e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000898283  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3657  NLP/P60 protein  49.51 
 
 		 385 aa  90.9  9e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  43.75 
 
 		 342 aa  90.5  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  36.55 
 
 		 181 aa  90.5  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1999  NLP/P60  41.79 
 
 		 226 aa  90.5  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.762084  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0919  NLP/P60 protein  34.71 
 
 		 382 aa  90.1  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0475791  normal  0.21921 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  38.14 
 
 		 450 aa  90.1  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2195  NLP/P60 protein  41.74 
 
 		 168 aa  90.1  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2747  NLP/P60 protein  46.72 
 
 		 327 aa  89.4  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1201  NLP/P60  39.13 
 
 		 169 aa  89.4  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2186  NLP/P60 family lipoprotein  35.71 
 
 		 407 aa  89.7  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48790  putative lipoprotein  40.77 
 
 		 177 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.006644  hitchhiker  0.0000000144437 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>