More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2747 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2747  NLP/P60 protein  100 
 
 		 327 aa  666    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2551  NLP/P60 protein  80.19 
 
 		 331 aa  499  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  66.67 
 
 		 302 aa  397  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  48.06 
 
 		 308 aa  219  7e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6731  NLP/P60 protein  48.35 
 
 		 308 aa  217  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00865661  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3054  NLP/P60 protein  41.44 
 
 		 381 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0610428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7119  NLP/P60 protein  47.8 
 
 		 182 aa  158  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8469  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  38.06 
 
 		 362 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  35.11 
 
 		 390 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1103  NLP/P60 protein  39.02 
 
 		 349 aa  146  6e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.107402  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3074  NLP/P60 protein  66.36 
 
 		 116 aa  136  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0148  NLP/P60 protein  34.62 
 
 		 392 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28410  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  34.85 
 
 		 378 aa  129  7.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3076  NLP/P60 protein  46.1 
 
 		 231 aa  122  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2555  NLP/P60 protein  46.1 
 
 		 199 aa  120  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2750  NLP/P60 protein  47.45 
 
 		 190 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.841293 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  33.02 
 
 		 374 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6778  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  40.85 
 
 		 429 aa  95.9  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2302  lytic transglycosylase catalytic  44.96 
 
 		 366 aa  93.2  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  45.79 
 
 		 345 aa  92.8  7e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1690  Lytic transglycosylase catalytic  44.53 
 
 		 378 aa  92.4  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.120979  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  44.92 
 
 		 394 aa  91.7  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  47.62 
 
 		 180 aa  89.7  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0184  NLP/P60  46.72 
 
 		 174 aa  89.4  7e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1157  lytic transglycosylase, catalytic  41.54 
 
 		 400 aa  88.2  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.798233  normal  0.63367 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  48.67 
 
 		 332 aa  87.4  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  50.5 
 
 		 349 aa  87  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1864  NLP/P60 protein  40.14 
 
 		 283 aa  86.7  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.617955  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  42.19 
 
 		 337 aa  85.9  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  44.04 
 
 		 331 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2041  NLP/P60 protein  36.42 
 
 		 284 aa  85.5  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000350881  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  52.94 
 
 		 340 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2570  NlpC/P60 family lipoprotein  43.86 
 
 		 283 aa  84  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1757  NlpC/P60 family lipoprotein  39.44 
 
 		 283 aa  84.3  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156191  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  42.11 
 
 		 334 aa  83.6  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  45.63 
 
 		 388 aa  83.2  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  36.55 
 
 		 198 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4629  NLP/P60 protein  28.95 
 
 		 411 aa  83.2  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.213725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  41.18 
 
 		 236 aa  82.8  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2139  NLP/P60 protein  42.2 
 
 		 374 aa  82.8  0.000000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.606148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  36.55 
 
 		 177 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 373 aa  82.8  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0285  NLP/P60  46.23 
 
 		 368 aa  82.8  0.000000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  42.2 
 
 		 432 aa  82.8  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11930  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  39.26 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.39384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8103  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  47.32 
 
 		 393 aa  82.4  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  45.45 
 
 		 306 aa  82  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  44.44 
 
 		 273 aa  82  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  52.56 
 
 		 333 aa  82.4  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  41.67 
 
 		 452 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  35.97 
 
 		 1048 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  42.02 
 
 		 391 aa  82.4  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  35.62 
 
 		 162 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01625  predicted lipoprotein  41.88 
 
 		 271 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1985  NLP/P60 protein  41.88 
 
 		 271 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.778309  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1868  NlpC/P60 family protein  41.88 
 
 		 271 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206609  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1852  NlpC/P60 family protein  41.88 
 
 		 271 aa  81.3  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000302623  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  46.08 
 
 		 333 aa  81.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1734  NlpC/P60 family protein  41.88 
 
 		 271 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2367  NlpC/P60 family protein  41.88 
 
 		 271 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00414236  normal  0.27776 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3000  NLP/P60 protein  39.84 
 
 		 463 aa  81.3  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.487438  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1974  NLP/P60 protein  41.88 
 
 		 271 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117191 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01615  hypothetical protein  41.88 
 
 		 271 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1543  NlpC/P60 family protein  41.88 
 
 		 275 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.179042 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  36.88 
 
 		 230 aa  81.6  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5736  NLP/P60 protein  45.71 
 
 		 326 aa  80.5  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8043  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  40.8 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  36.25 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  43.65 
 
 		 370 aa  79.7  0.00000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0315  peptidase M23B  38.13 
 
 		 346 aa  79.7  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.612531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  44.34 
 
 		 417 aa  79.7  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  53.85 
 
 		 335 aa  79.7  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  41.67 
 
 		 307 aa  79  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  36 
 
 		 221 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  45.45 
 
 		 319 aa  79  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  38.3 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1802  Lytic transglycosylase catalytic  42.98 
 
 		 384 aa  78.2  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.187771  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  45.54 
 
 		 222 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2144  NLP/P60 protein  40.5 
 
 		 374 aa  77.8  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  35.43 
 
 		 337 aa  78.2  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0609  NLP/P60 protein  45.63 
 
 		 495 aa  77.4  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00032953 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  45.83 
 
 		 398 aa  77.4  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1605  NLP/P60 protein  34.65 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2365  NLP/P60:sporulation-related protein  38.05 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  38.35 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3552  NLP/P60 protein  41.38 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.01109  normal  0.684862 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2197  NLP/P60 protein  42.99 
 
 		 273 aa  77  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.369734  hitchhiker  0.00000685507 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1528  NlpC/P60 family protein  41.88 
 
 		 273 aa  76.6  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  34.46 
 
 		 267 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2671  NLP/P60 protein  43.81 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.179494  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1658  hypothetical protein  34.65 
 
 		 287 aa  77  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.110646  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2387  NLP/P60 protein  43.81 
 
 		 283 aa  76.6  0.0000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.05451  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1542  NlpC/P60 family protein  41.88 
 
 		 273 aa  76.6  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0237599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1602  NlpC/P60 family protein  41.88 
 
 		 273 aa  76.6  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1911  NlpC/P60 family protein  41.88 
 
 		 273 aa  76.6  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.569551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1742  NlpC/P60 family protein  41.88 
 
 		 273 aa  76.6  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000022854  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3683  NLP/P60  43.75 
 
 		 181 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5739  NLP/P60 protein  43.4 
 
 		 367 aa  76.3  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  41.28 
 
 		 438 aa  76.3  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1243  NLP/P60 protein  34.31 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.215255  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>