More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0122 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  100 
 
 		 301 aa  608  1e-173  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3022  NLP/P60 protein  54.01 
 
 		 289 aa  281  1e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  43.73 
 
 		 303 aa  172  5e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  39.85 
 
 		 255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  36.19 
 
 		 285 aa  150  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2639  NLP/P60 protein  31.93 
 
 		 349 aa  149  8e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  36.43 
 
 		 342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  33.22 
 
 		 346 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  36.94 
 
 		 298 aa  146  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  34.05 
 
 		 341 aa  143  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3056  NLP/P60 protein  34.15 
 
 		 347 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000688808  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  32.78 
 
 		 342 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1247  putative cell-wall associated endopeptidase  33.46 
 
 		 257 aa  139  4.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  32.78 
 
 		 342 aa  138  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  38.66 
 
 		 216 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  38.78 
 
 		 217 aa  129  5.0000000000000004e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1554  NLP/P60  37.44 
 
 		 208 aa  124  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.68889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  35.88 
 
 		 341 aa  124  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1954  NLP/P60 protein  29.66 
 
 		 384 aa  121  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  34.57 
 
 		 338 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  38.34 
 
 		 208 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  45.45 
 
 		 246 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  45 
 
 		 246 aa  107  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  31.49 
 
 		 295 aa  107  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  38.78 
 
 		 269 aa  107  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3603  NLP/P60 protein  50.85 
 
 		 164 aa  106  5e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1300  NLP/P60 protein  46.67 
 
 		 176 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  37.67 
 
 		 269 aa  102  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1201  NLP/P60  37.67 
 
 		 169 aa  100  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2830  NLP/P60 protein  40.16 
 
 		 220 aa  100  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.704353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  42.19 
 
 		 202 aa  99.4  7e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2887  NLP/P60 protein  41.22 
 
 		 179 aa  98.6  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.171139  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  46.9 
 
 		 181 aa  98.6  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  40.43 
 
 		 183 aa  98.6  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  36.13 
 
 		 192 aa  98.2  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2091  NLP/P60 protein  36.25 
 
 		 192 aa  99  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.315099  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2519  cell wall-associated hydrolase-like protein  42.75 
 
 		 225 aa  98.2  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0173  NlpC/P60 family protein  42.52 
 
 		 458 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  42.52 
 
 		 181 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2365  NLP/P60:sporulation-related protein  37.32 
 
 		 266 aa  98.2  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1159  NLP/P60 protein  36.18 
 
 		 210 aa  97.8  2e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.944138  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  40.38 
 
 		 173 aa  97.1  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0958  NLP/P60 protein  44.35 
 
 		 202 aa  97.1  3e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000015981  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  42.37 
 
 		 208 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2291  NLP/P60 protein  43.55 
 
 		 242 aa  97.1  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  42.37 
 
 		 208 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3968  NLP/P60 protein  40.16 
 
 		 211 aa  96.7  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12193  normal  0.0821241 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2125  NLP/P60  40.6 
 
 		 228 aa  96.3  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839892  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3683  NLP/P60  40.14 
 
 		 181 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0170  NLP/P60 protein  41.73 
 
 		 184 aa  95.9  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  41.27 
 
 		 208 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  40.68 
 
 		 424 aa  95.5  9e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  41.53 
 
 		 207 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2667  peptidace C40 NLP/P60  40.8 
 
 		 187 aa  94.7  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.411217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  41.27 
 
 		 257 aa  95.1  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2142  NLP/P60  36.71 
 
 		 226 aa  95.1  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0634754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1659  hypothetical protein  37.87 
 
 		 209 aa  95.1  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.255203  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0828  NLP/P60 protein  40 
 
 		 240 aa  94.7  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000898283  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  34.62 
 
 		 221 aa  94.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01907  lipoprotein  43.8 
 
 		 133 aa  94.7  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.324405  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  29.59 
 
 		 476 aa  93.6  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  41.07 
 
 		 230 aa  93.2  4e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  39.47 
 
 		 278 aa  93.2  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  39.67 
 
 		 224 aa  93.2  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  42.5 
 
 		 391 aa  93.2  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  35.37 
 
 		 307 aa  93.2  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  37.68 
 
 		 265 aa  93.2  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0184  NLP/P60  40.44 
 
 		 174 aa  92.8  6e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  35.21 
 
 		 234 aa  92.8  7e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  35.21 
 
 		 234 aa  92.8  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  38.84 
 
 		 234 aa  92.4  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  35.21 
 
 		 234 aa  92.8  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  34.44 
 
 		 221 aa  92.4  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  39.17 
 
 		 218 aa  92.4  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2041  NLP/P60 protein  39.52 
 
 		 284 aa  92.4  8e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000350881  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  39.17 
 
 		 218 aa  92.4  8e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  39.17 
 
 		 218 aa  92.4  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  39.17 
 
 		 218 aa  92.4  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  38.6 
 
 		 267 aa  91.7  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  38.84 
 
 		 224 aa  91.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  39.67 
 
 		 223 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  40 
 
 		 223 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  40 
 
 		 223 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0018  NLP/P60 protein  40 
 
 		 188 aa  92  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1679  NLP/P60 protein  38.64 
 
 		 210 aa  91.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4179  putative lipoprotein  41.13 
 
 		 197 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000450162  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5044  NLP/P60 family protein  39.68 
 
 		 226 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.982871  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0992  hypothetical protein  44.92 
 
 		 170 aa  90.9  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.480266  normal  0.532227 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1606  NLP/P60 protein  41.73 
 
 		 209 aa  91.7  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48790  putative lipoprotein  41.13 
 
 		 177 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.006644  hitchhiker  0.0000000144437 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3244  putative outer membrane lipoprotein  39.26 
 
 		 191 aa  91.3  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0124301 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2363  putative outer membrane lipoprotein  36.99 
 
 		 147 aa  90.5  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000243067  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  38.46 
 
 		 205 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2454  putative outer membrane lipoprotein  38.19 
 
 		 190 aa  90.9  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00195047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  38.84 
 
 		 223 aa  90.5  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2100  NLP/P60  39.17 
 
 		 201 aa  90.5  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.995227  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  36.03 
 
 		 335 aa  90.9  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1747  NLP/P60 protein  40.28 
 
 		 174 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  40.16 
 
 		 205 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2565  putative outer membrane lipoprotein  38.19 
 
 		 190 aa  90.9  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.159761  hitchhiker  0.000144355 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>