More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3172 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  100 
 
 		 335 aa  702    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2897  NLP/P60 family protein  56.8 
 
 		 333 aa  402  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2651  NLP/P60 protein  56.19 
 
 		 333 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2577  cell wall-associated hydrolase  56.19 
 
 		 333 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164117  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2432  NLP/P60 family protein  55.59 
 
 		 333 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.899635 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2862  NLP/P60 family protein  55.59 
 
 		 333 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2658  NLP/P60 family protein  55.89 
 
 		 333 aa  397  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2609  cell wall-associated hydrolase  55.89 
 
 		 333 aa  397  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.652367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2849  NLP/P60 family protein  55.89 
 
 		 333 aa  397  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2855  NLP/P60 family protein  55.59 
 
 		 333 aa  396  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1936  NLP/P60 protein  56.19 
 
 		 333 aa  396  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.782262  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2878  NLP/P60 family protein  55.59 
 
 		 333 aa  392  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0584446  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3326  NLP/P60 protein  51.46 
 
 		 346 aa  325  5e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0910486  normal  0.729051 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03360  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  45.66 
 
 		 580 aa  268  7e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03920  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  43.03 
 
 		 297 aa  203  4e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3759  NLP/P60 protein  34.75 
 
 		 314 aa  149  6e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2224  NLP/P60  33.86 
 
 		 309 aa  143  4e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.231098  hitchhiker  0.0000179311 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  46.04 
 
 		 273 aa  126  5e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4057  NLP/P60  32.05 
 
 		 292 aa  125  7e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144265  normal  0.145245 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2830  NLP/P60 protein  43.17 
 
 		 220 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.704353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  43.75 
 
 		 476 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  46.67 
 
 		 391 aa  109  6e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  47.22 
 
 		 318 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  45.9 
 
 		 332 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2413  NLP/P60  27.78 
 
 		 337 aa  107  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000144369  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  42.74 
 
 		 307 aa  107  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  40.46 
 
 		 257 aa  105  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  30.99 
 
 		 235 aa  105  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  41.91 
 
 		 192 aa  105  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2091  NLP/P60 protein  41.91 
 
 		 192 aa  105  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.315099  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2291  NLP/P60 protein  46.4 
 
 		 242 aa  103  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  42.02 
 
 		 232 aa  103  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3592  NLP/P60 protein  26.19 
 
 		 345 aa  103  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  32.18 
 
 		 1048 aa  103  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  43.8 
 
 		 217 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0297  hypothetical protein  29.88 
 
 		 286 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.633779  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2100  NLP/P60  42.57 
 
 		 201 aa  101  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.995227  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  40 
 
 		 265 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0433  NLP/P60 protein  31.35 
 
 		 245 aa  102  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.895953  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  27.76 
 
 		 424 aa  101  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3968  NLP/P60 protein  42.4 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12193  normal  0.0821241 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  42.28 
 
 		 202 aa  101  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0033  NLP/P60 protein  26.51 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  45.04 
 
 		 295 aa  100  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2384  NLP/P60 protein  29.5 
 
 		 364 aa  100  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000473535  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2166  NLP/P60 protein  42.34 
 
 		 194 aa  99.8  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343346  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  40 
 
 		 183 aa  100  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  38.46 
 
 		 278 aa  99.8  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  41.67 
 
 		 274 aa  99.4  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  42.52 
 
 		 303 aa  99  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  40.46 
 
 		 335 aa  99  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  35.71 
 
 		 267 aa  97.8  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  37.61 
 
 		 269 aa  97.8  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2365  NLP/P60:sporulation-related protein  35.11 
 
 		 266 aa  97.8  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2041  NLP/P60 protein  39.32 
 
 		 284 aa  98.2  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000350881  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  43.12 
 
 		 345 aa  97.4  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  40 
 
 		 173 aa  96.7  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  39.2 
 
 		 370 aa  96.7  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  42.2 
 
 		 368 aa  96.7  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  35.51 
 
 		 181 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  34.56 
 
 		 269 aa  96.3  7e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  40.83 
 
 		 234 aa  96.3  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2519  cell wall-associated hydrolase-like protein  44.35 
 
 		 225 aa  96.3  7e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  40.83 
 
 		 218 aa  95.9  9e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  40.83 
 
 		 234 aa  95.9  9e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3683  NLP/P60  37.4 
 
 		 181 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1132  NLP/P60 protein  42.61 
 
 		 556 aa  95.9  9e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000155845  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  40.83 
 
 		 234 aa  95.9  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  40.83 
 
 		 218 aa  95.9  9e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  40.83 
 
 		 218 aa  95.9  9e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  40.83 
 
 		 234 aa  95.9  9e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  40.83 
 
 		 218 aa  95.9  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  46.74 
 
 		 331 aa  95.1  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  40.83 
 
 		 224 aa  95.5  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1679  NLP/P60 protein  43.8 
 
 		 210 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  38.71 
 
 		 150 aa  95.1  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  44.64 
 
 		 308 aa  94  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1100  NLP/P60 protein  39.53 
 
 		 215 aa  94.4  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0724  NLP/P60 protein  43.85 
 
 		 419 aa  93.6  5e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673085  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  40 
 
 		 221 aa  93.2  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1233  NLP/P60 protein  39.53 
 
 		 214 aa  93.2  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.783126  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  40.83 
 
 		 223 aa  92.8  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  40.83 
 
 		 223 aa  93.2  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  40.83 
 
 		 223 aa  93.2  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  38.06 
 
 		 319 aa  92.8  7e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2125  NLP/P60  37.78 
 
 		 228 aa  92.8  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839892  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  38.4 
 
 		 298 aa  92.8  7e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  40 
 
 		 223 aa  92.8  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  40 
 
 		 224 aa  92.8  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  40.16 
 
 		 255 aa  92.8  7e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2667  peptidace C40 NLP/P60  40 
 
 		 187 aa  92.8  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.411217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  44.04 
 
 		 340 aa  92.8  8e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2387  NLP/P60 protein  41.74 
 
 		 283 aa  92.4  9e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.05451  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0781  NLP/P60 protein  43.59 
 
 		 260 aa  92.4  9e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  40.65 
 
 		 193 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  36.92 
 
 		 150 aa  92  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  40 
 
 		 285 aa  92  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  40 
 
 		 221 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1274  NLP/P60 protein  31.28 
 
 		 207 aa  92  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.951335  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4198  NLP/P60 protein  27.93 
 
 		 285 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>