More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_1936 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_1936  NLP/P60 protein  100 
 
 
333 aa  689    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.782262  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2432  NLP/P60 family protein  83.78 
 
 
333 aa  599  1e-170  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.899635 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2651  NLP/P60 protein  83.18 
 
 
333 aa  598  1e-170  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2897  NLP/P60 family protein  82.88 
 
 
333 aa  594  1e-169  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2862  NLP/P60 family protein  83.18 
 
 
333 aa  595  1e-169  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2878  NLP/P60 family protein  82.28 
 
 
333 aa  591  1e-168  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0584446  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2577  cell wall-associated hydrolase  82.58 
 
 
333 aa  593  1e-168  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164117  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2855  NLP/P60 family protein  82.28 
 
 
333 aa  590  1e-168  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2658  NLP/P60 family protein  81.98 
 
 
333 aa  589  1e-167  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2609  cell wall-associated hydrolase  81.98 
 
 
333 aa  589  1e-167  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.652367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2849  NLP/P60 family protein  81.98 
 
 
333 aa  589  1e-167  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  56.19 
 
 
335 aa  396  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3326  NLP/P60 protein  47.42 
 
 
346 aa  300  2e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0910486  normal  0.729051 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03360  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  41.64 
 
 
580 aa  230  3e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03920  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  40.62 
 
 
297 aa  191  2e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3759  NLP/P60 protein  32.89 
 
 
314 aa  150  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2224  NLP/P60  33.2 
 
 
309 aa  140  3.9999999999999997e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.231098  hitchhiker  0.0000179311 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  45.59 
 
 
273 aa  122  7e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2413  NLP/P60  32.14 
 
 
337 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000144369  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4057  NLP/P60  29.96 
 
 
292 aa  115  7.999999999999999e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144265  normal  0.145245 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0433  NLP/P60 protein  30.59 
 
 
245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.895953  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  42.86 
 
 
307 aa  109  6e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0033  NLP/P60 protein  30.67 
 
 
308 aa  108  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2041  NLP/P60 protein  37.67 
 
 
284 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000350881  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  43.55 
 
 
476 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  34.38 
 
 
370 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  43.44 
 
 
318 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2321  NLP/P60 protein  30.86 
 
 
266 aa  102  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3592  NLP/P60 protein  24.8 
 
 
345 aa  102  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  38.52 
 
 
1048 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  35.17 
 
 
235 aa  101  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  37.6 
 
 
265 aa  101  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  43 
 
 
257 aa  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  36.44 
 
 
269 aa  100  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  38.14 
 
 
278 aa  100  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  28.09 
 
 
424 aa  100  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  37.29 
 
 
267 aa  100  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2830  NLP/P60 protein  41.8 
 
 
220 aa  100  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.704353  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1679  NLP/P60 protein  45.83 
 
 
210 aa  99.8  6e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2365  NLP/P60:sporulation-related protein  36.59 
 
 
266 aa  99  9e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  40.83 
 
 
274 aa  99  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2639  NLP/P60 protein  42.61 
 
 
349 aa  97.8  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  35.59 
 
 
269 aa  98.2  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  41.94 
 
 
232 aa  97.8  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  41.27 
 
 
335 aa  97.4  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  40.34 
 
 
192 aa  97.4  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2091  NLP/P60 protein  40.34 
 
 
192 aa  97.1  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.315099  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0297  hypothetical protein  30.09 
 
 
286 aa  95.5  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.633779  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  43.64 
 
 
347 aa  95.5  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  44.04 
 
 
340 aa  95.1  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0781  NLP/P60 protein  42.02 
 
 
260 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2291  NLP/P60 protein  44 
 
 
242 aa  94.4  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  36.5 
 
 
181 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  41.32 
 
 
391 aa  94  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3056  NLP/P60 protein  39.09 
 
 
347 aa  94  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000688808  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  38.71 
 
 
332 aa  94  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3683  NLP/P60  37.69 
 
 
181 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  42.11 
 
 
331 aa  93.6  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3968  NLP/P60 protein  39.17 
 
 
211 aa  93.6  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12193  normal  0.0821241 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  36.09 
 
 
285 aa  93.6  4e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  43.4 
 
 
342 aa  94  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  40.16 
 
 
202 aa  93.2  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  40.8 
 
 
217 aa  93.2  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0173  NlpC/P60 family protein  39.66 
 
 
458 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2667  peptidace C40 NLP/P60  42.5 
 
 
187 aa  92  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.411217  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  34.15 
 
 
532 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1954  lipoprotein; cell wall-associated hydrolase  28.26 
 
 
259 aa  91.3  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.370488  normal  0.0479966 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  37.4 
 
 
150 aa  91.3  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  40.52 
 
 
368 aa  90.9  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1768  NLP/P60 protein  38.02 
 
 
325 aa  90.5  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2100  NLP/P60  41.67 
 
 
201 aa  89.7  5e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.995227  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0773  NLP/P60 protein  39.09 
 
 
256 aa  90.1  5e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2166  NLP/P60 protein  40.98 
 
 
194 aa  90.1  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343346  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  41.59 
 
 
438 aa  89.7  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1008  cell wall-associated hydrolase  43.75 
 
 
197 aa  89.7  6e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000147737  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4613  NLP/P60 protein  26.36 
 
 
253 aa  89.4  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000101547  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  40.95 
 
 
327 aa  89.4  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1554  NLP/P60  44.25 
 
 
208 aa  89.4  8e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.68889  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  38.98 
 
 
341 aa  89.4  9e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1670  NLP/P60 protein  36.92 
 
 
177 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3552  NLP/P60 protein  36.89 
 
 
297 aa  88.6  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.01109  normal  0.684862 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  40.62 
 
 
333 aa  89  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  36.92 
 
 
177 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  40.2 
 
 
394 aa  89  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2519  cell wall-associated hydrolase-like protein  40.98 
 
 
225 aa  88.6  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1132  NLP/P60 protein  39.29 
 
 
556 aa  88.6  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000155845  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  38.53 
 
 
306 aa  87.8  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0479  NLP/P60  33.56 
 
 
225 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  40 
 
 
342 aa  87.8  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  37.5 
 
 
246 aa  87.4  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1268  NLP/P60 protein  36.23 
 
 
177 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.200264 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  42.27 
 
 
373 aa  87.4  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0696  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  38.89 
 
 
300 aa  87.4  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  38.98 
 
 
342 aa  87  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2017  NLP/P60 protein  33.33 
 
 
536 aa  87  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.474847  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  40.86 
 
 
321 aa  87  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  32.28 
 
 
337 aa  87  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  40 
 
 
291 aa  87  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  41.41 
 
 
417 aa  86.7  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  38.02 
 
 
246 aa  86.7  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>