More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3420 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  100 
 
 		 342 aa  689    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  61.99 
 
 		 321 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  51.85 
 
 		 340 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  36.07 
 
 		 394 aa  177  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  35.45 
 
 		 306 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2686  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  33.03 
 
 		 330 aa  155  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377535  normal  0.257604 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6766  NLP/P60 protein  31.23 
 
 		 350 aa  152  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3124  NLP/P60 protein  32.62 
 
 		 327 aa  150  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0606455  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  33.93 
 
 		 337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0243  NLP/P60 protein  33.02 
 
 		 323 aa  146  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  55.65 
 
 		 417 aa  142  8e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  31.34 
 
 		 345 aa  142  8e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  33 
 
 		 337 aa  138  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  33.89 
 
 		 333 aa  136  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  32.03 
 
 		 333 aa  136  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9181  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  54.39 
 
 		 531 aa  135  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5880  NLP/P60 protein  32.89 
 
 		 315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  53.91 
 
 		 459 aa  134  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3579  NLP/P60 protein  34.6 
 
 		 323 aa  133  5e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  35.22 
 
 		 332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  30.56 
 
 		 319 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  27.48 
 
 		 366 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1508  NLP/P60 protein  28.24 
 
 		 348 aa  123  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  50.89 
 
 		 372 aa  123  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  50.89 
 
 		 372 aa  123  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  50.89 
 
 		 372 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  31.62 
 
 		 350 aa  122  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3958  NLP/P60 protein  32.13 
 
 		 323 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.068937  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  50.94 
 
 		 331 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4511  NLP/P60 protein  30.13 
 
 		 388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  33.01 
 
 		 335 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  49.15 
 
 		 222 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  53.06 
 
 		 378 aa  119  7e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  48.62 
 
 		 378 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  51.69 
 
 		 236 aa  117  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  29.7 
 
 		 340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  49.06 
 
 		 452 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  49.15 
 
 		 374 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1561  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  41.82 
 
 		 337 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0198  NLP/P60 protein  54.39 
 
 		 458 aa  113  6e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.193606 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  27.89 
 
 		 373 aa  112  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  29.59 
 
 		 334 aa  112  9e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  49.06 
 
 		 438 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  30.6 
 
 		 348 aa  110  5e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3713  NLP/P60 protein  29.56 
 
 		 348 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5385  NLP/P60 protein  28.41 
 
 		 363 aa  108  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  49.09 
 
 		 235 aa  108  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  28 
 
 		 347 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5350  NLP/P60 protein  29.65 
 
 		 348 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5661  NLP/P60 protein  29.97 
 
 		 348 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0888  NLP/P60 protein  30.4 
 
 		 363 aa  108  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  35.26 
 
 		 432 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12218  hypothetical protein  50 
 
 		 393 aa  105  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.327955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  47.46 
 
 		 162 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2808  NLP/P60 protein  27.65 
 
 		 348 aa  103  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8043  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  46.02 
 
 		 210 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433259  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  45.71 
 
 		 388 aa  102  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2096  NLP/P60 protein  52.04 
 
 		 375 aa  102  8e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.685486  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1435  NLP/P60  30.25 
 
 		 361 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0418485  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6528  NLP/P60 protein  40.77 
 
 		 392 aa  102  9e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1453  NLP/P60 protein  30.25 
 
 		 361 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4086  NLP/P60 protein  29.14 
 
 		 517 aa  102  9e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.296945 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  44.76 
 
 		 388 aa  101  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4506  NLP/P60 protein  41.8 
 
 		 501 aa  100  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.918319  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  47.57 
 
 		 180 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  44 
 
 		 453 aa  99.8  6e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4528  NLP/P60 protein  38.4 
 
 		 370 aa  99.8  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1820  NLP/P60 protein  26.16 
 
 		 330 aa  99.8  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0285  NLP/P60  33.17 
 
 		 368 aa  99.4  9e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  48.91 
 
 		 390 aa  98.2  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  51.14 
 
 		 368 aa  97.8  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4570  NLP/P60 protein  44.9 
 
 		 363 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  47.12 
 
 		 217 aa  97.4  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  41.23 
 
 		 347 aa  97.4  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  41.12 
 
 		 398 aa  97.1  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  39.13 
 
 		 337 aa  96.3  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0570  NLP/P60 protein  43.7 
 
 		 160 aa  95.9  9e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  43.12 
 
 		 329 aa  95.1  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2333  NLP/P60 protein  40.41 
 
 		 432 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554645  normal  0.0124113 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5739  NLP/P60 protein  39.06 
 
 		 367 aa  94  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1936  NLP/P60 protein  43.4 
 
 		 333 aa  94  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.782262  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  52.04 
 
 		 308 aa  93.2  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  48.42 
 
 		 349 aa  93.2  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  51.69 
 
 		 327 aa  92.8  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1461  NLP/P60  39.47 
 
 		 366 aa  92  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495869  decreased coverage  0.00837381 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2451  NLP/P60  42.02 
 
 		 475 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.629046  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0148  NLP/P60 protein  45.56 
 
 		 392 aa  92.4  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 204 aa  92  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2496  NLP/P60 protein  42.02 
 
 		 475 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2488  NLP/P60 protein  42.02 
 
 		 475 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1427  NLP/P60 protein  30.8 
 
 		 301 aa  91.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3235  NLP/P60 protein  39.45 
 
 		 446 aa  91.7  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.177919  hitchhiker  0.000140663 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1543  NlpC/P60 family protein  42.06 
 
 		 275 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.179042 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2367  NlpC/P60 family protein  42.06 
 
 		 271 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00414236  normal  0.27776 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01625  predicted lipoprotein  42.06 
 
 		 271 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1985  NLP/P60 protein  42.06 
 
 		 271 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.778309  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1974  NLP/P60 protein  42.06 
 
 		 271 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117191 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01615  hypothetical protein  42.06 
 
 		 271 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1868  NlpC/P60 family protein  42.06 
 
 		 271 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206609  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1734  NlpC/P60 family protein  42.06 
 
 		 271 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>