More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0586 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  100 
 
 
432 aa  874    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4086  NLP/P60 protein  31.07 
 
 
517 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.296945 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4506  NLP/P60 protein  42.17 
 
 
501 aa  133  6e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.918319  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  37.62 
 
 
394 aa  131  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  50.42 
 
 
417 aa  129  7.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  45.53 
 
 
438 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  43.09 
 
 
452 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  37.64 
 
 
321 aa  119  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  46.55 
 
 
453 aa  117  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9181  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  46.55 
 
 
531 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  49.53 
 
 
398 aa  116  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  42.15 
 
 
340 aa  113  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2144  NLP/P60 protein  45.87 
 
 
374 aa  113  8.000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  33.5 
 
 
342 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  44.26 
 
 
332 aa  108  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  46.36 
 
 
319 aa  108  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  41.94 
 
 
236 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  43.7 
 
 
459 aa  107  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  43.48 
 
 
329 aa  106  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  43.24 
 
 
337 aa  106  9e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  43.65 
 
 
331 aa  106  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  44.44 
 
 
340 aa  105  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  43.9 
 
 
306 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2085  NLP/P60 protein  39.69 
 
 
447 aa  104  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6528  NLP/P60 protein  44.74 
 
 
392 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  39.13 
 
 
345 aa  101  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  44.9 
 
 
366 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5739  NLP/P60 protein  43.51 
 
 
367 aa  101  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1461  NLP/P60  45.13 
 
 
366 aa  100  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495869  decreased coverage  0.00837381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  42.74 
 
 
162 aa  99.8  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2110  NLP/P60 protein  39.81 
 
 
491 aa  99.8  8e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0361918  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  40.2 
 
 
475 aa  99.4  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  45.54 
 
 
347 aa  99.4  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5736  NLP/P60 protein  44.07 
 
 
326 aa  97.8  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5880  NLP/P60 protein  43.12 
 
 
315 aa  97.4  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791829  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8043  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  38.26 
 
 
210 aa  97.4  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433259  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  31.8 
 
 
333 aa  97.8  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4629  NLP/P60 protein  45.63 
 
 
411 aa  96.7  7e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.213725  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  43.2 
 
 
222 aa  96.7  8e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3000  NLP/P60 protein  37.93 
 
 
463 aa  96.3  8e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.487438  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  32.04 
 
 
337 aa  96.7  8e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11930  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  40.5 
 
 
176 aa  95.9  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.39384 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  34.25 
 
 
374 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  43.86 
 
 
335 aa  95.9  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  43.81 
 
 
333 aa  95.1  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  44.19 
 
 
349 aa  95.5  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  44.6 
 
 
317 aa  94.4  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  41.03 
 
 
180 aa  94.4  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1072  NLP/P60 protein  33.33 
 
 
393 aa  94.7  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.191144  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  44.23 
 
 
350 aa  94.4  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0285  NLP/P60  43.36 
 
 
368 aa  94.4  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1427  NLP/P60 protein  34.2 
 
 
301 aa  94  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  42.37 
 
 
334 aa  93.6  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0613  NLP/P60 protein  39.39 
 
 
502 aa  93.6  7e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.322284 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  38.46 
 
 
388 aa  93.2  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4511  NLP/P60 protein  37.98 
 
 
388 aa  93.2  9e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0926  Tn916, NLP/P60 family protein  41.88 
 
 
333 aa  92.8  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  40.48 
 
 
302 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  37.88 
 
 
293 aa  92.8  1e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  32.12 
 
 
532 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  38.02 
 
 
308 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3235  NLP/P60 protein  41.12 
 
 
446 aa  91.7  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.177919  hitchhiker  0.000140663 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3124  NLP/P60 protein  41.28 
 
 
327 aa  91.7  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0606455  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0917  NLP/P60 protein  43.56 
 
 
173 aa  90.9  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.693605  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1864  NLP/P60 protein  37.69 
 
 
283 aa  90.9  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.617955  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2017  NLP/P60 protein  41.67 
 
 
536 aa  90.1  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.474847  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6731  NLP/P60 protein  41.98 
 
 
308 aa  89.7  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00865661  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8103  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  41.18 
 
 
393 aa  89.7  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  35.16 
 
 
232 aa  89.4  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  41.73 
 
 
370 aa  89  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1757  NlpC/P60 family lipoprotein  36.92 
 
 
283 aa  89  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156191  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  43.4 
 
 
372 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2555  NLP/P60 protein  41.8 
 
 
199 aa  89.4  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  43.4 
 
 
372 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  42.86 
 
 
378 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  38.6 
 
 
400 aa  88.6  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7119  NLP/P60 protein  40.67 
 
 
182 aa  89  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1561  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  43.64 
 
 
337 aa  88.2  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308616  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  39.52 
 
 
235 aa  87.8  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  31.74 
 
 
337 aa  87.8  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  38.52 
 
 
432 aa  88.2  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  42.45 
 
 
372 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6766  NLP/P60 protein  36.36 
 
 
350 aa  87.8  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  40.52 
 
 
368 aa  87.4  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2686  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  41.44 
 
 
330 aa  87.4  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377535  normal  0.257604 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3076  NLP/P60 protein  40.83 
 
 
231 aa  87.4  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2570  NlpC/P60 family lipoprotein  36.15 
 
 
283 aa  87  5e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117101  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8441  NLP/P60 protein  34.23 
 
 
422 aa  87  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.150929 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  37.7 
 
 
432 aa  87  6e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28410  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  38.89 
 
 
378 aa  87  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  41.28 
 
 
378 aa  86.7  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  36.3 
 
 
388 aa  86.7  8e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4127  NLP/P60 protein  42.15 
 
 
532 aa  86.7  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06710  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  41.94 
 
 
292 aa  86.3  9e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  38.4 
 
 
230 aa  86.3  9e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  43.4 
 
 
347 aa  85.9  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2750  NLP/P60 protein  40.68 
 
 
190 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.841293 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  39.67 
 
 
327 aa  85.9  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0388  NLP/P60 protein  39.25 
 
 
480 aa  85.5  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  39.71 
 
 
390 aa  84  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>