More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_07310 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  100 
 
 		 329 aa  668    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  61.64 
 
 		 337 aa  368  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0487  Peptidase M23  54.26 
 
 		 379 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4302  hypothetical protein  40.99 
 
 		 305 aa  133  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.628164 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  51.28 
 
 		 475 aa  127  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1090  hypothetical protein  52.5 
 
 		 256 aa  125  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.018463  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2527  hypothetical protein  39.52 
 
 		 272 aa  124  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000287689 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1131  hypothetical protein  50 
 
 		 301 aa  124  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3460  hypothetical protein  41.52 
 
 		 284 aa  122  7e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.907261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3840  hypothetical protein  41.61 
 
 		 284 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.427443  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  50.47 
 
 		 438 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1141  hypothetical protein  39.01 
 
 		 309 aa  120  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.617877  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3442  Peptidase M23  32.77 
 
 		 546 aa  117  3.9999999999999997e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2807  hypothetical protein  42.04 
 
 		 283 aa  117  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0224369  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0633  Co/Zn/Cd efflux system component  49.59 
 
 		 312 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0706968  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0613  NLP/P60 protein  45.54 
 
 		 502 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.322284 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11160  hypothetical protein  42.65 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2144  NLP/P60 protein  50 
 
 		 374 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1194  hypothetical protein  48.8 
 
 		 320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0974  hypothetical protein  47.32 
 
 		 321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25980  hypothetical protein  37.29 
 
 		 287 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4566  hypothetical protein  44.7 
 
 		 203 aa  109  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.252363 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4506  NLP/P60 protein  50 
 
 		 501 aa  109  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.918319  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  50.53 
 
 		 452 aa  110  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  47.66 
 
 		 374 aa  108  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8932  NLP/P60 protein  34.47 
 
 		 367 aa  108  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00108547  normal  0.263686 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1845  hypothetical protein  46.9 
 
 		 281 aa  108  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.661954  normal  0.35188 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1977  hypothetical protein  43.94 
 
 		 194 aa  108  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2319  hypothetical protein  43.94 
 
 		 194 aa  108  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.229041  normal  0.0161406 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3348  hypothetical protein  43.94 
 
 		 194 aa  108  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.372059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3471  hypothetical protein  43.94 
 
 		 194 aa  108  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7951  hypothetical protein  49.06 
 
 		 312 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2244  peptidase M23B  43.06 
 
 		 1048 aa  107  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0072  hypothetical protein  44.44 
 
 		 200 aa  107  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.736738 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5428  Peptidase M23  40.91 
 
 		 349 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0244  hypothetical protein  37.16 
 
 		 192 aa  107  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0151406 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2414  hypothetical protein  43.18 
 
 		 203 aa  107  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.291745 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2042  hypothetical protein  43.94 
 
 		 194 aa  107  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.936652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2985  hypothetical protein  43.18 
 
 		 194 aa  106  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3850  hypothetical protein  43.18 
 
 		 194 aa  106  6e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5084  hypothetical protein  43.18 
 
 		 207 aa  105  9e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000555714 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  34.34 
 
 		 340 aa  105  9e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3999  hypothetical protein  43.18 
 
 		 194 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2417  hypothetical protein  43.18 
 
 		 194 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0954159 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  46.3 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  43.9 
 
 		 394 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2996  hypothetical protein  43.18 
 
 		 194 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4187  hypothetical protein  43.18 
 
 		 194 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  42.75 
 
 		 390 aa  104  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  43.31 
 
 		 340 aa  104  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2543  hypothetical protein  39.55 
 
 		 275 aa  104  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.578338  decreased coverage  0.00000438668 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  47.22 
 
 		 321 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0996  hypothetical protein  42.86 
 
 		 286 aa  104  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3211  hypothetical protein  43.18 
 
 		 193 aa  104  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.729102 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  43.24 
 
 		 432 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  47.27 
 
 		 347 aa  103  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  50.46 
 
 		 398 aa  103  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2110  NLP/P60 protein  42.73 
 
 		 491 aa  103  5e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0361918  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  46.23 
 
 		 388 aa  102  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3025  hypothetical protein  50.88 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144373  normal  0.932008 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  37.91 
 
 		 333 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8441  NLP/P60 protein  43.64 
 
 		 422 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.150929 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4086  NLP/P60 protein  48.62 
 
 		 517 aa  101  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.296945 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2139  NLP/P60 protein  44.07 
 
 		 374 aa  101  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.606148  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0148  NLP/P60 protein  40.14 
 
 		 392 aa  100  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3901  hypothetical protein  35.88 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0140637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1072  NLP/P60 protein  45.95 
 
 		 393 aa  99.8  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.191144  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2395  hypothetical protein  38.81 
 
 		 261 aa  99.8  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00354329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  45.16 
 
 		 366 aa  99  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1573  peptidase M23B  43.75 
 
 		 348 aa  98.6  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0724492  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3000  NLP/P60 protein  42.02 
 
 		 463 aa  98.6  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.487438  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4522  hypothetical protein  37.14 
 
 		 275 aa  97.8  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.594874 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3235  NLP/P60 protein  46.73 
 
 		 446 aa  97.4  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.177919  hitchhiker  0.000140663 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  38.89 
 
 		 331 aa  96.7  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  41.59 
 
 		 308 aa  96.7  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  43 
 
 		 337 aa  96.7  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  43.86 
 
 		 317 aa  96.3  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  45.37 
 
 		 388 aa  96.3  7e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 306 aa  95.9  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1461  NLP/P60  42.48 
 
 		 366 aa  95.1  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495869  decreased coverage  0.00837381 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  43.12 
 
 		 342 aa  95.1  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0198  NLP/P60 protein  42.75 
 
 		 458 aa  95.5  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.193606 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1170  hypothetical protein  44.19 
 
 		 280 aa  95.5  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0379591  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  39.34 
 
 		 417 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  44.95 
 
 		 180 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28410  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  40.13 
 
 		 378 aa  94.4  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  44.55 
 
 		 453 aa  94.4  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8432  hypothetical protein  45.61 
 
 		 274 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.774825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0493  hypothetical protein  37.72 
 
 		 281 aa  94  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.580154  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 345 aa  94.4  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  39.68 
 
 		 349 aa  93.6  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4738  peptidase M23B  40.6 
 
 		 388 aa  93.6  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000208513 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2275  hypothetical protein  38.13 
 
 		 282 aa  93.2  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.329742  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  41.51 
 
 		 335 aa  92.8  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4472  NLP/P60 protein  40.74 
 
 		 225 aa  92.8  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0041  NLP/P60  47.83 
 
 		 331 aa  92.4  8e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.430296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  42.72 
 
 		 236 aa  92  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  45 
 
 		 372 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  45 
 
 		 372 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4302  peptidase M23B  39.1 
 
 		 387 aa  92  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.416455  normal  0.37822 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>