More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0480 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  100 
 
 		 390 aa  795    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0148  NLP/P60 protein  71.76 
 
 		 392 aa  558  1e-158  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8469  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  43.35 
 
 		 362 aa  293  3e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3054  NLP/P60 protein  46.36 
 
 		 381 aa  287  2e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0610428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1103  NLP/P60 protein  43.66 
 
 		 349 aa  264  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.107402  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6731  NLP/P60 protein  36.36 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00865661  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2551  NLP/P60 protein  37.59 
 
 		 331 aa  153  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5530  NLP/P60 protein  33.81 
 
 		 491 aa  149  7e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.479781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2747  NLP/P60 protein  35.11 
 
 		 327 aa  147  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  36.43 
 
 		 302 aa  147  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  35.56 
 
 		 308 aa  143  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  42.96 
 
 		 340 aa  113  5e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1690  Lytic transglycosylase catalytic  45.52 
 
 		 378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.120979  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  54.26 
 
 		 333 aa  106  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2302  lytic transglycosylase catalytic  37.79 
 
 		 366 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  42.75 
 
 		 329 aa  104  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  46.22 
 
 		 349 aa  102  9e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0041  NLP/P60  35.84 
 
 		 331 aa  101  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.430296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  48.54 
 
 		 332 aa  101  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  52.17 
 
 		 321 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  34.09 
 
 		 374 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7290  NLP/P60 protein  33.05 
 
 		 329 aa  101  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0724969  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  48.42 
 
 		 331 aa  100  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8043  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  43.08 
 
 		 210 aa  100  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  51.58 
 
 		 222 aa  99.4  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  45.76 
 
 		 394 aa  99.4  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6778  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  39.19 
 
 		 429 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  48.25 
 
 		 335 aa  98.2  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 340 aa  97.4  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  48.91 
 
 		 342 aa  97.8  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  45.38 
 
 		 345 aa  97.4  4e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  43.41 
 
 		 317 aa  96.3  8e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  47.47 
 
 		 452 aa  94.4  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  39.19 
 
 		 352 aa  94  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  41.8 
 
 		 337 aa  94  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  44.21 
 
 		 453 aa  92.8  8e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  48.39 
 
 		 236 aa  92.8  9e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  47.92 
 
 		 350 aa  92.8  9e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  45.65 
 
 		 306 aa  92.4  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0315  peptidase M23B  40.13 
 
 		 346 aa  92.8  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.612531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  39.05 
 
 		 265 aa  92  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10024  hypothetical protein  51.09 
 
 		 281 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  47.83 
 
 		 475 aa  90.9  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6766  NLP/P60 protein  40 
 
 		 350 aa  90.5  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1666  Lytic transglycosylase catalytic  40.43 
 
 		 906 aa  90.5  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.341315 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  43.86 
 
 		 337 aa  89.7  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  46.43 
 
 		 150 aa  89.7  8e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  45.92 
 
 		 388 aa  89.7  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  43.62 
 
 		 391 aa  89  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  36.49 
 
 		 438 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1380  NLP/P60 protein  32.8 
 
 		 343 aa  88.6  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2504  Peptidase M23  31.98 
 
 		 290 aa  88.6  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.241623  normal  0.0435896 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3074  NLP/P60 protein  49.46 
 
 		 116 aa  87  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07830  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  41.98 
 
 		 372 aa  86.7  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2445  peptidase M23B  34.74 
 
 		 844 aa  86.7  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7119  NLP/P60 protein  42.52 
 
 		 182 aa  86.3  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  39.81 
 
 		 235 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5739  NLP/P60 protein  44.79 
 
 		 367 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0243  NLP/P60 protein  43.52 
 
 		 323 aa  85.5  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  43.62 
 
 		 476 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  40 
 
 		 232 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  43.64 
 
 		 366 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0298  NLP/P60 protein  43.69 
 
 		 437 aa  85.1  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.283102  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1461  NLP/P60  41.3 
 
 		 366 aa  84.7  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495869  decreased coverage  0.00837381 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  46.81 
 
 		 303 aa  84.3  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  43.4 
 
 		 348 aa  84.7  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  43.22 
 
 		 372 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1157  lytic transglycosylase, catalytic  39.73 
 
 		 400 aa  84  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.798233  normal  0.63367 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  43.22 
 
 		 372 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  43.22 
 
 		 372 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  46.67 
 
 		 180 aa  83.6  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4629  NLP/P60 protein  31.41 
 
 		 411 aa  83.6  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.213725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  41.67 
 
 		 378 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9181  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  46.74 
 
 		 531 aa  83.2  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  42 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6442  NLP/P60 protein  48.04 
 
 		 392 aa  83.2  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  41.18 
 
 		 378 aa  83.2  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  44.57 
 
 		 347 aa  82.8  0.000000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  39.26 
 
 		 327 aa  82  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  46.81 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0285  NLP/P60  40.62 
 
 		 368 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2139  NLP/P60 protein  43.16 
 
 		 374 aa  82  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.606148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5736  NLP/P60 protein  43.56 
 
 		 326 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3208  lytic transglycosylase, catalytic  44.9 
 
 		 387 aa  82.4  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2700  NLP/P60 protein  40.43 
 
 		 188 aa  82.8  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000637216  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1159  NLP/P60 protein  33.86 
 
 		 210 aa  82.4  0.00000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.944138  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  42 
 
 		 388 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  40.86 
 
 		 337 aa  82  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  37.91 
 
 		 541 aa  82  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0303  NLP/P60 protein  40.37 
 
 		 357 aa  82  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1266  NLP/P60 protein  44.66 
 
 		 362 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1402  NLP/P60 protein  38.26 
 
 		 175 aa  80.9  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1239  NLP/P60  43.69 
 
 		 362 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00968494  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1256  NLP/P60 protein  43.69 
 
 		 362 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.589306 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  46.74 
 
 		 417 aa  81.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  36.59 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0045  NlpC/P60 family domain protein  43.3 
 
 		 174 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000018046  normal  0.424193 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  37.14 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1599  NLP/P60 protein  42.2 
 
 		 368 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0891153 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3076  NLP/P60 protein  40.5 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>