More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8469 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8469  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  100 
 
 
362 aa  743    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3054  NLP/P60 protein  67.62 
 
 
381 aa  483  1e-135  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0610428  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1103  NLP/P60 protein  49.4 
 
 
349 aa  302  7.000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.107402  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  43.35 
 
 
390 aa  293  3e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0148  NLP/P60 protein  43.21 
 
 
392 aa  270  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  37.37 
 
 
302 aa  159  6e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2747  NLP/P60 protein  38.06 
 
 
327 aa  150  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6731  NLP/P60 protein  36.73 
 
 
308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00865661  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2551  NLP/P60 protein  41.11 
 
 
331 aa  147  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  37.46 
 
 
308 aa  140  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5530  NLP/P60 protein  29.2 
 
 
491 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.479781  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0041  NLP/P60  31.05 
 
 
331 aa  112  7.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.430296  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0315  peptidase M23B  36.79 
 
 
346 aa  111  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.612531  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  35.26 
 
 
352 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7290  NLP/P60 protein  29.45 
 
 
329 aa  103  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0724969  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2504  Peptidase M23  40.41 
 
 
290 aa  103  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.241623  normal  0.0435896 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  49.11 
 
 
335 aa  101  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  45.45 
 
 
333 aa  96.7  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1690  Lytic transglycosylase catalytic  41.61 
 
 
378 aa  93.6  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.120979  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2302  lytic transglycosylase catalytic  40.58 
 
 
366 aa  93.2  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2445  peptidase M23B  37.58 
 
 
844 aa  92  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1157  lytic transglycosylase, catalytic  39.6 
 
 
400 aa  92.4  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.798233  normal  0.63367 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1820  NLP/P60 protein  39.09 
 
 
330 aa  92  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  42.06 
 
 
349 aa  92  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  39.5 
 
 
340 aa  92  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6778  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  37.86 
 
 
429 aa  90.9  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  44.44 
 
 
331 aa  90.9  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  36.84 
 
 
340 aa  90.9  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8043  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  40.88 
 
 
210 aa  89.7  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433259  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1666  Lytic transglycosylase catalytic  37.98 
 
 
906 aa  88.6  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.341315 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  34.68 
 
 
374 aa  88.6  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  34.68 
 
 
306 aa  88.2  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1380  NLP/P60 protein  37.9 
 
 
343 aa  87.4  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  37.98 
 
 
317 aa  85.9  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  42.42 
 
 
321 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  42.45 
 
 
332 aa  85.9  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  40.8 
 
 
388 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  35.88 
 
 
337 aa  84  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  42.72 
 
 
222 aa  83.6  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3208  lytic transglycosylase, catalytic  44.68 
 
 
387 aa  83.6  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  37.37 
 
 
350 aa  82.4  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  37.29 
 
 
345 aa  81.6  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  34.76 
 
 
541 aa  80.9  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  44 
 
 
337 aa  80.5  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  39.66 
 
 
329 aa  80.1  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  34.53 
 
 
217 aa  79.7  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  38.66 
 
 
394 aa  79.7  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  41.3 
 
 
235 aa  79.3  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  35.25 
 
 
476 aa  79  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  37.96 
 
 
298 aa  79.3  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1016  NlpC/P60 family protein  36.89 
 
 
446 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000775164  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  40.19 
 
 
391 aa  78.6  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2686  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  39.13 
 
 
330 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377535  normal  0.257604 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  34.71 
 
 
346 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  39.39 
 
 
342 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  39.81 
 
 
388 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  42.55 
 
 
236 aa  77.8  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  41.58 
 
 
319 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0298  NLP/P60 protein  39.66 
 
 
437 aa  77.4  0.0000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.283102  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  40.23 
 
 
452 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  32.87 
 
 
232 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  35.54 
 
 
342 aa  77  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28410  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  27.88 
 
 
378 aa  76.6  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4506  NLP/P60 protein  41.07 
 
 
501 aa  77  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.918319  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1427  NLP/P60 protein  37.04 
 
 
301 aa  76.6  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  44.05 
 
 
366 aa  76.6  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  34.71 
 
 
342 aa  76.6  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10024  hypothetical protein  37.62 
 
 
281 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0007  nlp/p60 family protein  33.86 
 
 
380 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0241644  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  42.42 
 
 
417 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6528  NLP/P60 protein  45.78 
 
 
392 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  41.05 
 
 
438 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  42.31 
 
 
432 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4528  NLP/P60 protein  38.94 
 
 
370 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160091  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0888  NLP/P60 protein  39.66 
 
 
363 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2808  NLP/P60 protein  39.29 
 
 
348 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  41.05 
 
 
475 aa  75.1  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5739  NLP/P60 protein  43.02 
 
 
367 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  42.31 
 
 
432 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  35.82 
 
 
453 aa  74.7  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  35.54 
 
 
341 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2139  NLP/P60 protein  38.39 
 
 
374 aa  73.9  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.606148  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2684  NLP/P60 protein  33.33 
 
 
232 aa  74.7  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.708971  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  37.5 
 
 
337 aa  74.3  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2110  NLP/P60 protein  39.45 
 
 
491 aa  73.9  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0361918  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  36.94 
 
 
348 aa  73.9  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0243  NLP/P60 protein  39.78 
 
 
323 aa  73.9  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5350  NLP/P60 protein  39.05 
 
 
348 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  30.27 
 
 
342 aa  73.2  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0285  NLP/P60  42.17 
 
 
368 aa  73.2  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3713  NLP/P60 protein  39.05 
 
 
348 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  42.22 
 
 
162 aa  72.8  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  37.5 
 
 
265 aa  72.8  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  39.78 
 
 
334 aa  72.8  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0433  NLP/P60 protein  43.68 
 
 
245 aa  72.8  0.000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.895953  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3076  NLP/P60 protein  37.88 
 
 
231 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1435  NLP/P60  40.59 
 
 
361 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0418485  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  38.52 
 
 
246 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2639  NLP/P60 protein  38.24 
 
 
349 aa  72.4  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5385  NLP/P60 protein  39.05 
 
 
363 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418529  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>