More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2504 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_2504  Peptidase M23  100 
 
 
290 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.241623  normal  0.0435896 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0315  peptidase M23B  58.84 
 
 
346 aa  327  1.0000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.612531  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  43.4 
 
 
352 aa  239  5e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0935  peptidase M23B  32.43 
 
 
598 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1350  M24/M37 family peptidase  55.12 
 
 
386 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1228  M24/M37 family peptidase  55.12 
 
 
386 aa  134  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112662  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0514  M24/M37 family peptidase  54.33 
 
 
386 aa  132  6.999999999999999e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000380878  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1666  Lytic transglycosylase catalytic  38.54 
 
 
906 aa  129  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.341315 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1220  peptidase, M23/M37 family  50.39 
 
 
385 aa  129  6e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000900007  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  50 
 
 
376 aa  126  5e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  50.82 
 
 
375 aa  124  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1590  Peptidase M23  49.22 
 
 
390 aa  123  3e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  51.59 
 
 
374 aa  123  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  42.77 
 
 
477 aa  122  8e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  55.65 
 
 
271 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  50.41 
 
 
503 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  54.84 
 
 
271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  44.97 
 
 
377 aa  120  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0696  M24/M37 family peptidase  49.6 
 
 
388 aa  120  3e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0489006  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  49.19 
 
 
477 aa  120  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  38.54 
 
 
459 aa  119  4.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  43.02 
 
 
375 aa  119  6e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  50.77 
 
 
379 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  51.69 
 
 
474 aa  118  9e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  51.69 
 
 
503 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  50.85 
 
 
475 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0866  Peptidase M23  49.21 
 
 
489 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.329722  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  48.31 
 
 
472 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  48.31 
 
 
473 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  48.31 
 
 
475 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  52.07 
 
 
372 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  48.31 
 
 
473 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  47.76 
 
 
374 aa  116  5e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  52 
 
 
524 aa  115  6e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0732  M24/M37 family peptidase  48.36 
 
 
353 aa  115  8.999999999999998e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.056304  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  37.86 
 
 
233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2445  peptidase M23B  31.98 
 
 
844 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  47.46 
 
 
480 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1223  Peptidase M23  45.97 
 
 
414 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  49.15 
 
 
475 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  49.15 
 
 
447 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  44 
 
 
527 aa  113  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  50 
 
 
490 aa  113  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  48.31 
 
 
468 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  47.45 
 
 
441 aa  112  6e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  50 
 
 
431 aa  112  9e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1627  M24/M37 family peptidase  47.97 
 
 
386 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  28.9 
 
 
1048 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0437  peptidase M23B  47.46 
 
 
513 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000637591  normal  0.0934933 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  36.17 
 
 
379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2136  Peptidase M23  47.46 
 
 
437 aa  110  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1331  M23 peptidase domain-containing protein  46.72 
 
 
389 aa  110  3e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  49.61 
 
 
440 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  49.61 
 
 
440 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  51.69 
 
 
523 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  49.61 
 
 
437 aa  109  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  46.83 
 
 
377 aa  109  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  49.23 
 
 
569 aa  109  7.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1690  Lytic transglycosylase catalytic  53.85 
 
 
378 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.120979  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3284  Peptidase M23  51.85 
 
 
665 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0190084 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0883  peptidase M23B  48.46 
 
 
278 aa  108  9.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  42.14 
 
 
479 aa  108  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  46.67 
 
 
411 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  45.38 
 
 
375 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1368  peptidase M23  50.94 
 
 
434 aa  107  2e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  48.39 
 
 
429 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  43.61 
 
 
541 aa  106  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  46.62 
 
 
400 aa  106  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  48.39 
 
 
314 aa  106  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0370  peptidase M23B  45.45 
 
 
402 aa  106  5e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.890076  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0737  Peptidase M23  31.77 
 
 
580 aa  105  6e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.200765  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  47.11 
 
 
490 aa  105  7e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  42.96 
 
 
379 aa  105  7e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0008  peptidase M23B  46.72 
 
 
417 aa  105  7e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  47.46 
 
 
238 aa  105  9e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  46.09 
 
 
517 aa  105  9e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0419  peptidase M23  49.15 
 
 
695 aa  105  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0620331 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  45.97 
 
 
271 aa  104  1e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  31.37 
 
 
533 aa  105  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  41.27 
 
 
392 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4692  peptidase M23B  46.83 
 
 
302 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574974  normal  0.126416 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  42.37 
 
 
741 aa  104  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1041  peptidase M23B  49.61 
 
 
651 aa  104  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6778  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  50.96 
 
 
429 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3054  NLP/P60 protein  36.84 
 
 
381 aa  103  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0610428  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3351  peptidase M23B  53.68 
 
 
687 aa  103  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0955739  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  47.01 
 
 
471 aa  103  5e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8469  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  40.41 
 
 
362 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2983  peptidase M23B  40.48 
 
 
392 aa  103  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1027  peptidase M23B  48.36 
 
 
464 aa  103  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  47.01 
 
 
471 aa  102  6e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1920  peptidoglycan-specific endopeptidase, M23 family  44.63 
 
 
452 aa  102  7e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0283385  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  44.92 
 
 
470 aa  102  7e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  45.38 
 
 
404 aa  102  7e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2030  Peptidase M23  43.08 
 
 
470 aa  102  8e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0270  M23 peptidase domain-containing protein  44.63 
 
 
423 aa  102  8e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00486213  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  44.92 
 
 
448 aa  101  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  46.34 
 
 
498 aa  100  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4572  Peptidase M23  48 
 
 
615 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  45.74 
 
 
404 aa  100  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>