More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3054 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3054  NLP/P60 protein  100 
 
 		 381 aa  775    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0610428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8469  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  67.62 
 
 		 362 aa  483  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1103  NLP/P60 protein  55.52 
 
 		 349 aa  325  9e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.107402  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  46.36 
 
 		 390 aa  287  2e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0148  NLP/P60 protein  42.42 
 
 		 392 aa  263  3e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  39.86 
 
 		 302 aa  172  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2747  NLP/P60 protein  41.44 
 
 		 327 aa  164  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  38.49 
 
 		 308 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2551  NLP/P60 protein  40.45 
 
 		 331 aa  153  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6731  NLP/P60 protein  40.14 
 
 		 308 aa  152  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00865661  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5530  NLP/P60 protein  29.53 
 
 		 491 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.479781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7290  NLP/P60 protein  29.34 
 
 		 329 aa  109  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0724969  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  34.42 
 
 		 352 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0315  peptidase M23B  38.74 
 
 		 346 aa  106  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.612531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0041  NLP/P60  28.65 
 
 		 331 aa  103  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.430296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2504  Peptidase M23  36.84 
 
 		 290 aa  103  6e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.241623  normal  0.0435896 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1666  Lytic transglycosylase catalytic  44.36 
 
 		 906 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.341315 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1690  Lytic transglycosylase catalytic  43.8 
 
 		 378 aa  100  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.120979  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  47.87 
 
 		 333 aa  97.1  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1157  lytic transglycosylase, catalytic  42.86 
 
 		 400 aa  95.9  9e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.798233  normal  0.63367 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2302  lytic transglycosylase catalytic  40.38 
 
 		 366 aa  94.7  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2445  peptidase M23B  42.03 
 
 		 844 aa  94  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3208  lytic transglycosylase, catalytic  42.2 
 
 		 387 aa  94  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  45.38 
 
 		 349 aa  93.6  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  35.83 
 
 		 374 aa  93.2  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  49.47 
 
 		 331 aa  92.8  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  39.34 
 
 		 340 aa  91.3  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  42 
 
 		 235 aa  90.1  6e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6778  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  38.85 
 
 		 429 aa  90.1  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  44.07 
 
 		 394 aa  88.2  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  41.96 
 
 		 340 aa  88.6  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  42.24 
 
 		 388 aa  87.8  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  39.07 
 
 		 317 aa  87.8  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  38.46 
 
 		 345 aa  87.8  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8043  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  42.4 
 
 		 210 aa  87.8  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 335 aa  85.5  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  41.67 
 
 		 321 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  43.12 
 
 		 222 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  48.94 
 
 		 319 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  42.39 
 
 		 306 aa  85.1  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  43 
 
 		 452 aa  84.3  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  36.09 
 
 		 232 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  36.36 
 
 		 388 aa  84  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  38.58 
 
 		 453 aa  84  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5739  NLP/P60 protein  41.35 
 
 		 367 aa  82.8  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  43.48 
 
 		 332 aa  82.4  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  44.21 
 
 		 162 aa  82.8  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  38.51 
 
 		 541 aa  81.6  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  34.38 
 
 		 236 aa  82  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  40.15 
 
 		 337 aa  81.6  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1266  NLP/P60 protein  39.26 
 
 		 362 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0570  NLP/P60 protein  39.34 
 
 		 160 aa  80.9  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  29.48 
 
 		 366 aa  80.5  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0007  nlp/p60 family protein  33.87 
 
 		 380 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0241644  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  42.11 
 
 		 475 aa  80.5  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1239  NLP/P60  38.52 
 
 		 362 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00968494  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1256  NLP/P60 protein  38.52 
 
 		 362 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.589306 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1657  NLP/P60 protein  40.95 
 
 		 154 aa  80.1  0.00000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.983654  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4506  NLP/P60 protein  44.12 
 
 		 501 aa  80.1  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.918319  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0298  NLP/P60 protein  39.81 
 
 		 437 aa  79.7  0.00000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.283102  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  38.54 
 
 		 350 aa  79.7  0.00000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  41.05 
 
 		 391 aa  79  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1504  NLP/P60 protein  34.97 
 
 		 188 aa  79.3  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0399794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  35.25 
 
 		 329 aa  79  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1828  lipoprotein, NLP/P60 family  34.97 
 
 		 188 aa  79.3  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.996382  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10024  hypothetical protein  39.5 
 
 		 281 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  42.71 
 
 		 438 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  42.22 
 
 		 342 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  42.55 
 
 		 417 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  39.36 
 
 		 298 aa  78.6  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0023  NLP/P60 protein  38.32 
 
 		 164 aa  78.6  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371839  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  36.73 
 
 		 204 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  43.01 
 
 		 334 aa  77.4  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  41.84 
 
 		 372 aa  77  0.0000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2110  NLP/P60 protein  42.16 
 
 		 491 aa  76.6  0.0000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0361918  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6528  NLP/P60 protein  41.24 
 
 		 392 aa  76.6  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1599  NLP/P60 protein  37.04 
 
 		 368 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0891153 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  30.19 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  39.17 
 
 		 246 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3579  NLP/P60 protein  41.3 
 
 		 323 aa  76.3  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2686  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  37.61 
 
 		 330 aa  76.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377535  normal  0.257604 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  40.24 
 
 		 285 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1448  Lytic transglycosylase catalytic  34.94 
 
 		 362 aa  75.5  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0207836  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  36.36 
 
 		 150 aa  75.9  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  40.43 
 
 		 459 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  36.11 
 
 		 295 aa  75.5  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1820  NLP/P60 protein  34.31 
 
 		 330 aa  75.1  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1243  NLP/P60 protein  43.48 
 
 		 169 aa  75.1  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.215255  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9181  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  32.65 
 
 		 531 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  41.59 
 
 		 337 aa  74.7  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  1 
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0007  NLP/P60 family protein  37.84 
 
 		 380 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  37.84 
 
 		 246 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3050  NLP/P60 protein  34.29 
 
 		 227 aa  74.3  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3603  NLP/P60 protein  40.32 
 
 		 164 aa  74.3  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  41.24 
 
 		 368 aa  73.9  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8718  hypothetical protein  37.98 
 
 		 352 aa  73.9  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  38.98 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4465  NLP/P60 protein  34.71 
 
 		 150 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.231412 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0751  NLP/P60 protein  33.64 
 
 		 173 aa  73.9  0.000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1380  NLP/P60 protein  35.51 
 
 		 343 aa  73.9  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>