More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3070 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  100 
 
 
306 aa  621  1e-177  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  42.21 
 
 
319 aa  228  9e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  46.38 
 
 
331 aa  220  3e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2686  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  41.39 
 
 
330 aa  218  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377535  normal  0.257604 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  40.51 
 
 
334 aa  209  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3958  NLP/P60 protein  35.97 
 
 
323 aa  192  4e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.068937  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  38.02 
 
 
340 aa  190  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  38.59 
 
 
340 aa  188  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  37.61 
 
 
345 aa  183  3e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3579  NLP/P60 protein  35.17 
 
 
323 aa  182  7e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  38.41 
 
 
333 aa  171  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  35.35 
 
 
321 aa  170  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  35.45 
 
 
342 aa  167  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  33.79 
 
 
337 aa  159  4e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  34.35 
 
 
337 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3124  NLP/P60 protein  33.22 
 
 
327 aa  155  8e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0606455  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6766  NLP/P60 protein  31.33 
 
 
350 aa  151  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  30.89 
 
 
333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1380  NLP/P60 protein  32.01 
 
 
343 aa  145  9e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  31.94 
 
 
394 aa  142  8e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  31.44 
 
 
373 aa  141  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  53.54 
 
 
349 aa  138  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1508  NLP/P60 protein  31.82 
 
 
348 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5880  NLP/P60 protein  34.02 
 
 
315 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791829  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  54.87 
 
 
236 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  53.45 
 
 
162 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  51.61 
 
 
453 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  57.14 
 
 
417 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  31.91 
 
 
332 aa  132  6e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0243  NLP/P60 protein  32.89 
 
 
323 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0570  NLP/P60 protein  57.89 
 
 
160 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  55.93 
 
 
459 aa  129  9.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  32.09 
 
 
366 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  30.26 
 
 
348 aa  125  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1427  NLP/P60 protein  32.42 
 
 
301 aa  123  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  51.3 
 
 
235 aa  119  6e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  51.46 
 
 
432 aa  116  5e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  51.46 
 
 
432 aa  115  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1820  NLP/P60 protein  27.89 
 
 
330 aa  113  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  42.86 
 
 
222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  28.62 
 
 
350 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9181  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  44.17 
 
 
531 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8043  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  45.13 
 
 
210 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433259  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4506  NLP/P60 protein  30.12 
 
 
501 aa  107  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.918319  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3713  NLP/P60 protein  27.44 
 
 
348 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  40 
 
 
335 aa  107  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  27.93 
 
 
372 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  27.93 
 
 
372 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  27.93 
 
 
372 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5385  NLP/P60 protein  27.05 
 
 
363 aa  106  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418529  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2139  NLP/P60 protein  48.15 
 
 
374 aa  106  6e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.606148  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1816  NLP/P60 protein  35.84 
 
 
859 aa  105  9e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  35.71 
 
 
274 aa  104  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  44.36 
 
 
298 aa  104  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5350  NLP/P60 protein  26.83 
 
 
348 aa  104  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  44.17 
 
 
432 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2110  NLP/P60 protein  43.75 
 
 
491 aa  103  3e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0361918  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  37.87 
 
 
273 aa  103  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5661  NLP/P60 protein  27.33 
 
 
348 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  41.09 
 
 
476 aa  103  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5736  NLP/P60 protein  50 
 
 
326 aa  103  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  34.12 
 
 
438 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4511  NLP/P60 protein  28.76 
 
 
388 aa  102  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2808  NLP/P60 protein  26.33 
 
 
348 aa  102  8e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  43.75 
 
 
230 aa  101  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  44.86 
 
 
391 aa  101  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1561  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  46.03 
 
 
337 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308616  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2096  NLP/P60 protein  53.26 
 
 
375 aa  101  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.685486  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  39.26 
 
 
329 aa  102  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  36.78 
 
 
278 aa  101  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  28.07 
 
 
347 aa  101  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  33.9 
 
 
307 aa  100  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6528  NLP/P60 protein  49.52 
 
 
392 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3237  NLP/P60 protein  50.54 
 
 
380 aa  100  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00058739  hitchhiker  0.000426733 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3050  NLP/P60 protein  43.75 
 
 
227 aa  101  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4086  NLP/P60 protein  30.03 
 
 
517 aa  100  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.296945 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5739  NLP/P60 protein  46.72 
 
 
367 aa  100  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  38.85 
 
 
265 aa  100  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  31.12 
 
 
285 aa  99.8  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1435  NLP/P60  27.1 
 
 
361 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0418485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1453  NLP/P60 protein  27.1 
 
 
361 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0285  NLP/P60  46.22 
 
 
368 aa  99.4  6e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  45.13 
 
 
400 aa  99.4  6e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2144  NLP/P60 protein  44.25 
 
 
374 aa  99.4  6e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  34.18 
 
 
337 aa  99.4  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  45.26 
 
 
475 aa  98.2  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0888  NLP/P60 protein  42.86 
 
 
363 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  41.22 
 
 
388 aa  97.4  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  44.92 
 
 
308 aa  97.4  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4528  NLP/P60 protein  46.46 
 
 
370 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160091  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  41.94 
 
 
150 aa  96.3  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  40.74 
 
 
378 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  40.74 
 
 
378 aa  96.3  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  39.52 
 
 
150 aa  95.1  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0023  NLP/P60 protein  46.88 
 
 
164 aa  95.1  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371839  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  42.61 
 
 
424 aa  95.1  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  40.17 
 
 
452 aa  94.7  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  44.04 
 
 
202 aa  94.7  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8441  NLP/P60 protein  41.22 
 
 
422 aa  94.4  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.150929 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2700  NLP/P60 protein  41.88 
 
 
188 aa  94.7  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000637216  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>